| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1202126 | 11 (0.130) | 59 (1.290) +CAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCT |
42/234 | 0.0 | 90.8% | intergenic (+117/+478) | unknown/unknown | Na+/H+ antiporter/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | 1657336 = | NA (NA) | coding (123/369 nt) | unknown | Transposase, IS200 family | |||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
TTATGCTATCACCATCGCCACCGCGAGCATTGCAGGCTATATTGTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGGGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/1201877‑1202126‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTTATA > 1/1657336‑1657576 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TGCTATCACCATCGCCACCGCGAGCATTGCAGGCTATATTGTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGAGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAA > 1:173904/1‑250 CCATCGCCACCGCGAGCATTGCAGGCTATATTGTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGAGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAAT < 1:114715/251‑1 CGAGCATTGCAGGCTATATTGTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGAGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACC < 1:471249/251‑1 ATTGCAGGCTATATTGTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGAGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACC > 1:312717/1‑250 GCAGGCTATATTGTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGAGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTT > 1:361327/1‑251 GGCTATATTGTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGAGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAAC < 1:275988/220‑1 CTATATTGTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGAGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGG < 1:539602/251‑1 CTATATTGTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGAGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGG > 1:841083/1‑251 CTATATTGTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGAGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAG < 1:764649/250‑1 ATATTGTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGCTTCATCACCACGAGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGCGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGAC > 1:566499/1‑235 ATATTGTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGAGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGG > 1:713013/1‑251 ATATTGTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGAGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGG > 1:798420/1‑251 ATATTGTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGAGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGG > 1:748693/1‑251 ATATTGTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGAGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGG < 1:145407/251‑1 ATATTGTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGAGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGAC < 1:248738/235‑1 GTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGAGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTC > 1:540636/1‑248 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1:863810/250‑1 CACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGAGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTT > 1:487090/1‑249 CACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGAGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGAC > 1:512540/1‑219 CTTGGATTCATCACCACGAGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATC > 1:23697/1‑248 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AAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAAT < 1:656603/251‑1 CGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGC < 1:634002/251‑1 ATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTT > 1:135792/1‑249 TCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATC < 1:45448/165‑1 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1:601118/1‑251 GACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAG > 1:523885/1‑80 ACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGG > 1:255308/1‑251 TAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTT > 1:414301/1‑251 AGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTG > 1:161406/1‑226 GTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGAC < 1:337508/61‑1 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CCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTA‑CCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACT < 1:879543/251‑1 CTTCAAAGGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATC > 1:751709/1‑128 GGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTC > 1:555378/1‑250 GGGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTC > 1:641122/1‑250 GGCATATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTC < 1:713802/249‑1 TATGAAAACCAACAACCGTGAAATAGCTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAAGCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATAT < 1:40403/251‑1 TATGAAAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATAT > 1:707192/1‑251 AAACCAACAACCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCG > 1:37183/1‑208 CCGTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCC < 1:76247/228‑1 GTGAAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTC < 1:35450/139‑1 AAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAG > 1:620270/1‑250 AAATAACTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAG > 1:466167/1‑250 CTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATT > 1:672024/1‑251 CTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTC < 1:704354/160‑1 CTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTC < 1:327935/130‑1 CTCTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGC < 1:696836/100‑1 CTATGACCTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATT > 1:815937/1‑249 CTACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAG < 1:97022/251‑1 ACCCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCAT > 1:260071/1‑196 CCCTTAAAGGGGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTC < 1:211456/239‑1 GGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGGGGATTTTTTAT > 1:389451/1‑251 GGTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATAT < 1:507589/235‑1 GTCCACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGC > 1:19981/1‑171 ACATATCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATA < 1:876962/229‑1 TCCTTTCTTCGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAG < 1:292824/227‑1 CGATAAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGGGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTT > 1:887480/1‑251 AAATTATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGT < 1:285152/112‑1 ATCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTGTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGGGGATTTTTTATGTTGACCGCTTA < 1:454353/235‑1 TCCTGAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGGGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATA > 1:344126/1‑251 GAATCATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGGGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCT < 1:637616/234‑1 ATGTCTTCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGC > 1:694463/1‑134 TCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGGGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATACGCATAGCGTACGGT < 1:200055/251‑1 TCCTTTTCCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTT > 1:166503/1‑167 CCTGATTCCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGGGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCgtacgctatgcgtatggaatcaaag < 1:416073/251‑26 CCTTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAG < 1:343973/76‑1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| TTATGCTATCACCATCGCCACCGCGAGCATTGCAGGCTATATTGTAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGGGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/1201877‑1202126‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTTATA > 1/1657336‑1657576 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |