| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,234,394 | Δ603 bp | intergenic (+95264/+158315) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1234394 | 1234996 | 603 | 35 [0] | [0] 35 | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1234393 | 0 (0.000) | 35 (0.400) | 31/426 | 1.5 | 100% | intergenic (+95263/+158918) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| ? | 1 | 1234997 = | 0 (0.000) | intergenic (+95867/+158314) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC | |||||
AAGGTATTTAAAGGGAAAATCATCGTTAATGATTTTTGAAAGGCATGCGAACCTAAAATACAACTATGGTAACCGATATTTTTGGTCGAAAGGCTATTATGTAAGCACGGTAGGGCTAAATACAAAGGCTGTGGAGGAGTATATAAGGAATCAGGAAAAAGGAGGATATTTATACTAGGCCCTTATAAGGTAGCCTAAAAACTGCACGTTTTACGTGCGGATCGTTATTTAAGATTATCCATTCATTCTAATGAACATATTTGGTTAAGAGAATTATTACTTAATCGTCGAAATAAATTAGGTCTACAGTGCGCATTTTATGAAAAATTGGGTGTTGTGTATTCTTTTATTGATAAAGTCGAGACCATAGATCGTCGTTTGGATATTTTTGAATTTATTGAATACTATAAGGGGGTGGGAGCTAGGTCCTGTTAGGGTTTTAC > 1/1234760‑1235202 | gtaagatccttgctgatatcgccgtattcgacaaagtggctttcgctgcattagttgaaaaagcaaaatctgcactttaattttaaagtttagataaaaaataagggcgctcatgagcgtcctttttattattgttgattttctgattgattggctattttttcttgttttgaataatagaaatagagccaaatgagtccgattggtgagataaataaagcaaaaaagtaacagataTCCATTCATTCTaa > 1:586244‑M2/238‑251 (MQ=255) atccttgctgatatcgccgtattcgacaaagtggctttcgctgcattagttgaaaaagcaaaatctgcactttaattttaaagtttagataaaaaataagggcgctcatgagcgtcctttttattattgttgattttctgattgattggctattttttcttgttttgaataatagaaatagagccaaatgagtccgattggtgagataaataaagcaaaaaagtaacagataTCCATTCATTCTAATGa < 1:422553‑M2/17‑1 (MQ=255) tccttgctgatatcgccgtattcgacaaagtggctttcgctgcattagttgaaaaagcaaaatctgcactttaattttaaagtttagataaaaaataagggcgctcatgagcgtcctttttattattgttgattttctgattgattggctattttttcttgttttgaataatagaaatagagccaaatgagtccgattggtgagataaataaagcaaaaaagtaacagataTCCATTCATTCTAATGAACa > 1:391906‑M2/232‑251 (MQ=255) cttgctgatatcgccgtattcgacaaagtggctttcgctgcattagttgaaaaagcaaaatctgcactttaattttaaagtttagataaaaaataagggcgctcatgagcgtcctttttattattgttgattttctgattgattggctattttttcttgttttgaataatagaaatagagccaaatgagtccgattggtgagataaataaagcaaaaaagtaacagataTCCATTCATTCTAATg > 1:2803‑M2/230‑245 (MQ=255) tgatatcgccgtattcgacaaagtggctttcgctgcattagttgaaaaagcaaaatctgcactttaattttaaagtttagataaaaaataagggcgctcatgagcgtcctttttattattgttgattttctgattgattggctattttttcttgttttgaataatagaaatagagccaaatgagtccgattggtgagataaataaagcaaaaaagtaacagataTCCATTCATTCTAATGAACATATTTgg < 1:691345‑M2/27‑1 (MQ=255) 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1:58329‑M2/97‑1 (MQ=255) | AAGGTATTTAAAGGGAAAATCATCGTTAATGATTTTTGAAAGGCATGCGAACCTAAAATACAACTATGGTAACCGATATTTTTGGTCGAAAGGCTATTATGTAAGCACGGTAGGGCTAAATACAAAGGCTGTGGAGGAGTATATAAGGAATCAGGAAAAAGGAGGATATTTATACTAGGCCCTTATAAGGTAGCCTAAAAACTGCACGTTTTACGTGCGGATCGTTATTTAAGATTATCCATTCATTCTAATGAACATATTTGGTTAAGAGAATTATTACTTAATCGTCGAAATAAATTAGGTCTACAGTGCGCATTTTATGAAAAATTGGGTGTTGTGTATTCTTTTATTGATAAAGTCGAGACCATAGATCGTCGTTTGGATATTTTTGAATTTATTGAATACTATAAGGGGGTGGGAGCTAGGTCCTGTTAGGGTTTTAC > 1/1234760‑1235202 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |