| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,404,507 | 947 bp→CCGATCGGATTATGGTCATGAAAAAAGGCGTGATCGAACAAATCGATACGCCG | intergenic (‑11120/+7852) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1404507 | 1405453 | 947 | 59 [0] | [0] 60 | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1404506 | 0 (0.000) | 49 (0.740) +CCGATCGGATTATGGTCATGAAAAAAGGCGTGATCGAACAAATCGATACGCCG |
37/324 | 0.5 | 100% | intergenic (‑11119/+8799) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | 1405454 = | 0 (0.000) | intergenic (‑12067/+7851) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA | |||||
ATCCGGCAAAGCAGCCAATCGTTGTTTTTCCTGCAAGTGATAAAACAGCATAGGAGAGGAACTTAAAACAAGATCAATATTATCGTTTTTTTCGTC‑ATCAAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATACGCCCTTCCTAAACAGAATAAAGCGATGACCGGCACGACAAGCAGAGAATGAAAATAACCTCGTTTTATCCCTGACATATAAATCACCTATACGAAATATGTTGAATAAAATGATTCTAACCTTGAATTCCACTCAAATTCTATAAAATACCAATCCATTCATATTTTTTGTGATCCATTTCAAATAATTAAAATTTAGCTATTCTCGATATTTTGAGTTACGCATGGCAATTTTCTT > 1/1404271‑1404745 | aTCCGGCAAAGCAGCCAATCGTTGTTTTTCCTGCAAGTGATAAAACAGCATAGGAGAGGAACTTAAAACAAGATCAATATTATCGTTTTTTTCGTC‑ATCAAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatgg < 1:269601‑M1/251‑16 (MQ=255) tCCGGCAAAGCAGCCAATCGTTGTTTTTCCTGCAAGTGATAAAACAGCATAGGAGAGGAACTTAAAACAAGATCAATATTATCGTTTTTTTCGTC‑ATCAAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggt < 1:633595‑M1/251‑17 (MQ=255) gTGATAAAACAGCATAGGAGAGGAACTTAAAACAAGATCAATATTATCGTTTTTTTCGTC‑ATCAAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacg > 1:105874‑M1/1‑200 (MQ=255) gTGATAAAACAGCATAGGAGAGGAACTTAAAACAAGATCAATATTATCGTTTTTTTCGTC‑ATCAAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacg > 1:73293‑M1/1‑200 (MQ=255) gCATAGGAGAGGAACTTAAAACAAGATCAATATTATCGTTTTTTTCGTC‑ATCAAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatt > 1:135178‑M1/1‑189 (MQ=255) cATAGGAGAGGAACTTAAAACAAGATCAATATTATCGTTTTTTTCGTC‑ATCAAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacat < 1:882642‑M1/249‑62 (MQ=255) ggAGAGGAACTTAAAACAAGATCAATATTATCGTTTTTTTCGTC‑ATCAAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaa > 1:20439‑M1/1‑184 (MQ=255) aCTTAAAACAAGATCAATATTATCGTTTTTTTCGTCAATCAAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgc > 1:149601‑M1/1‑177 (MQ=255) ttAAAACAAGATCAATATTATCGTTTTTTTCGTC‑ATCAAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtg < 1:520094‑M1/251‑78 (MQ=255) gATCAATATTATCGTTTTTTTCGTC‑ATCAAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatgg < 1:730628‑M1/180‑16 (MQ=255) gATCAATATTATCGTTTTTTTCGTC‑ATCAAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCCATccgatcggattatgg < 1:463137‑M1/180‑16 (MQ=255) atatTATCGTTTTTTTCGTC‑ATCAAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtt > 1:823936‑M1/1‑160 (MQ=255) atatTATCGTTTTTTTCGTC‑ATCAAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaac < 1:364784‑M1/219‑60 (MQ=255) atatTATCGTTTTTTTCGTC‑ATCAAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggt > 1:437022‑M1/1‑160 (MQ=255) atCGTTTTTTTCGTC‑ATCAAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacattt < 1:794397‑M1/218‑64 (MQ=255) atcaAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatcca > 1:612212‑M1/1‑140 (MQ=255) atcaAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatgg < 1:193419‑M1/155‑16 (MQ=255) caAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaat > 1:526582‑M1/1‑138 (MQ=255) aaaTAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatc < 1:351589‑M1/251‑115 (MQ=255) gtttAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacg > 1:360805‑M1/1‑128 (MQ=255) gtttAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacg > 1:485236‑M1/1‑128 (MQ=255) tttAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgt < 1:754106‑M1/251‑125 (MQ=255) gTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgca > 1:739190‑M1/1‑112 (MQ=255) gTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaatt < 1:123386‑M1/192‑86 (MQ=255) gTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaac < 1:128067‑M1/166‑60 (MQ=255) ttAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgt > 1:106970‑M1/1‑105 (MQ=255) cATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcacta < 1:652319‑M1/251‑151 (MQ=255) cTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattga > 1:529727‑M1/1‑97 (MQ=255) tATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatc < 1:758875‑M1/251‑157 (MQ=255) tCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatcat < 1:230030‑M1/251‑159 (MQ=255) gACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatc < 1:667914‑M1/247‑157 (MQ=255) gCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatcattgtgaagg > 1:538399‑M1/1‑85 (MQ=255) cATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatcattgtgaagg < 1:728177‑M1/250‑167 (MQ=255) aTTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatcattgtgaaggtg < 1:846831‑M1/251‑169 (MQ=255) ttGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatcattgtgaaggtgttttt < 1:66422‑M1/250‑174 (MQ=255) gCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatcattgtgaaggtgtttttaat > 1:67064‑M1/1‑75 (MQ=255) cGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggtgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatcc < 1:175364‑M1/173‑111 (MQ=255) cGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctctccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatcattgtgaaggtgtttttaatattcaaccgacg > 1:453733‑M1/1‑63 (MQ=255) cGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgacgctaaacatttacaataagccggagaataaattcgtgtttaattttattgggctatccaatcagatgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatcattgtgaaggcgtttttaatattcaaccgacg > 1:612620‑M1/1‑63 (MQ=255) gTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaatt < 1:659395‑M1/146‑86 (MQ=255) aaTAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtc < 1:292040‑M1/187‑134 (MQ=255) tAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatcattgtgaagg < 1:462490‑M1/218‑167 (MQ=255) tAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaa < 1:696744‑M1/119‑68 (MQ=255) tAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaac < 1:420125‑M1/111‑60 (MQ=255) gAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcacta < 1:134224‑M1/199‑151 (MQ=255) aaGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaac > 1:213724‑M1/1‑47 (MQ=255) ggACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcgatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatcattgtgaaggtgtttttaatattcaaccgacgcctccggcagaattattgg > 1:442155‑M1/1‑44 (MQ=255) gTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatcattgtgaaggtgtttttaatattcaaccgacgcctccggcagaattattgg < 1:214892‑M1/243‑208 (MQ=255) aTGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatcattgtgaaggtgtttttaatattcaaccgacgcctccggcagaattattggttcagggtaaagc > 1:366228‑M1/1‑30 (MQ=255) tGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatcattgtgaaggtgtttttaatattcaac < 1:318830‑M1/212‑184 (MQ=255) gTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggc < 1:498958‑M1/133‑106 (MQ=255) aCCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatcc < 1:41400‑M1/133‑111 (MQ=255) gACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatcattgtgaaggtgtttttaatattcaaccgacgcctccggcagaattattggttcagggtaaagcacttctggcaagc > 1:864116‑M1/1‑17 (MQ=255) aTTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatcattgtgaaggtgtttttaatattcaaccgacgcctccggcagaattattggttcagggtaaagcacttctggcaagccgcccg > 1:1422‑M1/1‑12 (MQ=255) aTTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatcattgtgaaggtgtttttaatattcaaccgacgcctccggcagaattattggttcagggtaaagcacttctggcaagccgcccg > 1:30736‑M1/1‑12 (MQ=255) aTTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatcattgtgaaggtgtttttaatattcaaccgacgcctccggcagaattattggttcagggtaaagcacttctggca > 1:47274‑M1/1‑12 (MQ=255) aTTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatac < 1:105626‑M1/61‑50 (MQ=255) ttGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatcat > 1:614899‑M1/1‑7 (MQ=255) aTccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgtcaatttgtctgcgcaaggtgtcactattgatcattgtgaagg < 1:164530‑M1/168‑167 (MQ=255) | ATCCGGCAAAGCAGCCAATCGTTGTTTTTCCTGCAAGTGATAAAACAGCATAGGAGAGGAACTTAAAACAAGATCAATATTATCGTTTTTTTCGTC‑ATCAAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATACGCCCTTCCTAAACAGAATAAAGCGATGACCGGCACGACAAGCAGAGAATGAAAATAACCTCGTTTTATCCCTGACATATAAATCACCTATACGAAATATGTTGAATAAAATGATTCTAACCTTGAATTCCACTCAAATTCTATAAAATACCAATCCATTCATATTTTTTGTGATCCATTTCAAATAATTAAAATTTAGCTATTCTCGATATTTTGAGTTACGCATGGCAATTTTCTT > 1/1404271‑1404745 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |