| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | 1 | 1,404,507 | 947 bp→CCGATCGGATTATGGTCATGAAAAAAGGCGTGATCGAACAAATCGATACGCCG | intergenic (‑11120/+7852) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1404507 | 1405453 | 947 | 59 [0] | [0] 60 | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1404506 | 0 (0.000) | 49 (0.740) +CCGATCGGATTATGGTCATGAAAAAAGGCGTGATCGAACAAATCGATACGCCG |
37/324 | 0.5 | 100% | intergenic (‑11119/+8799) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | 1405454 = | 0 (0.000) | intergenic (‑12067/+7851) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA | |||||
ATCCGGCAAAGCAGCCAATCGTTGTTTTTCCTGCAAGTGATAAAACAGCATAGGAGAGGAACTTAAAACAAGATCAATATTATCGTTTTTTTCGTC‑ATCAAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATACGCCCTTCCTAAACAGAATAAAGCGATGACCGGCACGACAAGCAGAGAATGAAAATAACCTCGTTTTATCCCTGACATATAAATCACCTATACGAAATATGTTGAATAAAATGATTCTAACCTTGAATTCCACTCAAATTCTATAAAATACCAATCCATTCATATTTTTTGTGATCCATTTCAAATAATTAAAATTTAGCTATTCTCGATATTTTGAGTTACGCATGGCAATTTTCTT > 1/1404271‑1404745 | aTCCGGCAAAGCAGCCAATCGTTGTTTTTCCTGCAAGTGATAAAACAGCATAGGAGAGGAACTTAAAACAAGATCAATATTATCGTTTTTTTCGTC‑ATCAAATAGTTTGTTTAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatgg < 1:269601‑M1/251‑16 (MQ=255) 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< 1:351589‑M1/251‑115 (MQ=255) gtttAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacg > 1:360805‑M1/1‑128 (MQ=255) gtttAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacg > 1:485236‑M1/1‑128 (MQ=255) tttAATGAGTTGCTTGTTCTGTTTAGCATTCTTATCGACGTGGCATTCGGTTGCTTTTCCCACTCGGTAATTAAATAAGAAAGGGACTCCGGTGAAAATGTCGTACCAATGACCAATTCATTGCTATccgatcggattatggtcatgaaaaaaggcgtgatcgaacaaatcgatacgccgctaaacatttacaataatccggtgaataaattcgtgtttaatttcattgggctatccaatcagttgaacgt < 1:754106‑M1/251‑125 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |