| Predicted mutation | ||||||
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| JC | 1 | 1,230,984 | (CCCAACTTA)1→2 | intergenic (+91854/+162327) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
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ATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATCCTATGCCAAATTGCTGCGTAATCTTCCGCCTGAAACTTTACTTTGCGAAGACAAAAACCACAACGCTAAACCTGAAAATGCCAACAGCCAAAATCTGTTAATCCAAGGG > 1/1230722‑1231217 | tttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAAc < 1:697985‑M2/139‑1 (MQ=255) 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1:616888‑M2/18‑251 (MQ=255) ctgcacaacttaccCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATCCTATGCCAAATTGCTGCGTAATCTTCCGCCTGAAACTTTACTTTGCGAAGACAAAAACCACAACGCTAAACCTGAAAATGCCAACAGCCAAAAt > 1:790374‑M2/15‑248 (MQ=255) caacttaccCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATCCTATGCCAAATTGCTGCGTAATCTTCCGCCTGAAACTTTACTTTGCGAAGACAAAAACCACAACGCTAAAcc > 1:498397‑M2/10‑221 (MQ=255) acttaccCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATCCTATGcc > 1:474764‑M2/8‑154 (MQ=255) cttaccCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATCCTATGCCAAATTGCTGCGTAATCTTCCGCCTGAAACTTTACTTTGCGAAGACAAAAACCACAAc < 1:9033‑M2/204‑1 (MQ=255) ttaccCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATcc > 1:213427‑M2/6‑146 (MQ=255) ccCAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATCCTATGCCAAATTGCTGCGTAATCTTCCGCCTGAAACTTTACTTTGCGAAGACAAAAACCACAACGCTAAACCTGAAAATGCCAACAGCCAAAATCTGTTAATCCAAggg < 1:237004‑M2/249‑1 (MQ=255) caACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATCCTATGCCAAATTGCTGCGTAATCTTCCGCCTGAAACTTTACTTTGCGAAGACAAAAACCACAACGCTAAACCTGaaaa < 1:473940/218‑1 (MQ=255) | ATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATCCTATGCCAAATTGCTGCGTAATCTTCCGCCTGAAACTTTACTTTGCGAAGACAAAAACCACAACGCTAAACCTGAAAATGCCAACAGCCAAAATCTGTTAATCCAAGGG > 1/1230722‑1231217 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |