| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 1,230,984 | (CCCAACTTA)1→2 | intergenic (+91854/+162327) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1230968 | 0 (0.000) | 44 (0.520) +CAACTTACC |
42/380 | 0.6 | 100% | intergenic (+91838/+162343) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| ? | 1 | 1230969 = | 0 (0.000) | intergenic (+91839/+162342) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC | |||||
TTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATCCTATGCCAAATTGCTGCGTAATCTTCCGCCTGAAACTTTACTTTGCGAAGACAAAAACCACAACGCTAAACCTGAAAATGCCAACAGCCAAAATCTGTTAATC > 1/1230727‑1231211 | tttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAAc < 1:697985‑M2/139‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) aatatgcttgccttgccttgccttgccttgcctaaactaaacGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaatctgaaattgcagaacaagcc < 1:305433‑M1/240‑106 (MQ=255) tgccttgccttgccttgccttgcctaAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaatctgaaattgcagaacaagccgacatcag > 1:631829‑M1/4‑138 (MQ=255) gccttgccttgccttgccttgcctAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgttt < 1:692605‑M1/182‑48 (MQ=255) 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1:616888‑M1/1‑8 (MQ=255) ctGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaatctgaaattgcagaacaagccgacatcagccgtgaattttacgaaatgaactggttgggtaaatcctatgccaaattgctgcgtaatcttccgcctgaaactttactttgcgaagacaaaaaccacaacgctaaacctgaaaatgccaacagccaaaat > 1:790374‑M1/1‑5 (MQ=255) | TTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATTTTACGAAATGAACTGGTTGGGTAAATCCTATGCCAAATTGCTGCGTAATCTTCCGCCTGAAACTTTACTTTGCGAAGACAAAAACCACAACGCTAAACCTGAAAATGCCAACAGCCAAAATCTGTTAATC > 1/1230727‑1231211 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |