| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 1,230,855 | (TGCCT)4→5 | intergenic (+91725/+162456) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1230833 | 0 (0.000) | 24 (0.280) +CTTGC |
16/376 | 2.9 | 100% | intergenic (+91703/+162478) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC |
| ? | 1 | 1230834 = | 0 (0.000) | intergenic (+91704/+162477) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Val‑GAC | |||||
TTCACCGTGGAAGAATTTTTAGACATTCTGAAAAAACAAGTGAGAAATCGCGAATTGAAATTATTGGGTGAGGCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATT > 1/1230595‑1231081 | ttcaccgtggaagaatttttagacattctgaaaaaacaagtgagaaatcgcgaattgaaattattgggtgaggcgtagttctgacaattaaatgagctgaaattacgctagcaggaatcatcattcaatagatttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccattaataggagtaaaaaatatgcttgccttgcct < 1:483973‑M2/7‑1 (MQ=255) acattctgaaaaaacaagtgagaaatcgcgaattgaaattattgggtgaggcgtagttctgacaattaaatgagctgaaattacgctagcaggaatcatcattcaatagatttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCctaaacta < 1:109985‑M2/28‑1 (MQ=255) ttattgggtgaggcgtagttctgacaattaaatgagctgaaattacgctagcaggaatcatcattcaatagatttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTaaaa > 1:762537‑M2/185‑251 (MQ=255) gcgtagttctgacaattaaatgagctgaaattacgctagcaggaatcatcattcaatagatttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCctaaact < 1:563741‑M2/27‑1 (MQ=255) gcgtagttctgacaattaaatgagctgaaattacgctagcaggaatcatcattcaatagatttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCggag > 1:651693‑M2/173‑251 (MQ=255) gcgtagttctgacaattaaatgagctgaaattacgctagcaggaatcatcattcaatagatttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCggag > 1:515156‑M2/173‑251 (MQ=255) gcgtagttctgacaattaaatgagctgaaattacgcaagcaggaatcatcattcaatagatttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCctaaac > 1:446700‑M2/173‑198 (MQ=255) agttctgacaattaaatgagctgaaattacgctagcaggaatcatcattcaatagatttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCAc > 1:230110‑M2/169‑224 (MQ=255) gttctgacaattaaatgagctgaaattacgctagcaggaatcatcattcaatagatttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCt > 1:869215‑M2/168‑218 (MQ=255) aattaaatgagctgaaattacgctagcaggaatcatcattcaatagatttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgccttgcc > 1:416748‑M2/160‑165 (MQ=255) gaaattacgctagcaggaatcatcattcaatagatttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACtttt > 1:99769‑M2/147‑250 (MQ=255) tagcaggaatcatcattcaatagatttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCctaaac > 1:82494‑M2/137‑162 (MQ=255) gaatcatcattcaatagatttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgccttgccttgccttgccttgcct > 1:125110‑M2/131‑152 (MQ=255) gaatcatcattcaatagatttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCAc < 1:509339‑M2/56‑1 (MQ=255) catcattcaatagatttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGc < 1:320664‑M2/125‑1 (MQ=255) caatagatttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAAct > 1:330672‑M2/120‑249 (MQ=255) tttattgatttttccgaccggcgtagtttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAAc < 1:697985‑M2/139‑1 (MQ=255) ttcagctttttaacactcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctc < 1:137326‑M2/166‑16 (MQ=255) acTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgt > 1:137441‑M1/1‑206 (MQ=255) ctcgatattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAacttacccaacttacccaacttaaagc < 1:275169‑M2/164‑14 (MQ=255) atattgtataaaacaaagtacactttgtacttgataaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTCATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAacttacccaacttacccaacttaaagc > 1:34500‑M2/67‑217 (MQ=255) atattgtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATaaa > 1:42710‑M2/67‑151 (MQ=255) atatTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcga > 1:22655‑M1/1‑201 (MQ=255) gtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgccttgccttgccttgcct < 1:79286‑M2/17‑1 (MQ=255) gtataaaacaaagtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACtctgcacaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcc < 1:734897‑M2/172‑22 (MQ=255) gTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaa > 1:170108‑M1/1‑196 (MQ=255) cAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaa > 1:511262‑M1/1‑188 (MQ=255) gtacactttgtacttgacaaccagtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTAcc > 1:71705‑M2/50‑193 (MQ=255) acTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttatt < 1:843693‑M1/251‑72 (MQ=255) gTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTT‑AAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaattttta < 1:636407‑M1/243‑70 (MQ=255) cAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaa > 1:542583‑M1/1‑167 (MQ=255) aCCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaatc < 1:441213‑M1/251‑87 (MQ=255) aCCAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaat > 1:542898‑M1/1‑165 (MQ=255) ccAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaat > 1:469339‑M1/1‑164 (MQ=255) ccAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttatt > 1:858580‑M1/1‑164 (MQ=255) cAGTAATAGGAGTAAAAAATATGCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatg > 1:66360‑M1/1‑163 (MQ=255) gtaataggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCcaacttacccaac > 1:145351‑M2/27‑177 (MQ=255) ggagtaaaaaatatgcttgcCTTGCCTTGCCTTGCCTTGCctaaact < 1:885899‑M2/27‑1 (MQ=255) aaaatatgcttgccttgccttgccttgccttgcctaaactaaacgtTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaatctgaaattgcagaac < 1:870213‑M1/235‑101 (MQ=255) aatatgcttgccttgccttgccttgccttgcctaaactaaacGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaatctgaaattgcagaacaagcc < 1:305433‑M1/240‑106 (MQ=255) tgccttgccttgccttgccttgcctaAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgtttcgatgtaagcggtcaatttttattagaaaaattccaatctgaaattgcagaacaagccgacatcag > 1:631829‑M1/4‑138 (MQ=255) gccttgccttgccttgccttgcctAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCAcaacttacccaacttacccaacttaaagctcttttcccgaattgttt < 1:692605‑M1/182‑48 (MQ=255) | TTCACCGTGGAAGAATTTTTAGACATTCTGAAAAAACAAGTGAGAAATCGCGAATTGAAATTATTGGGTGAGGCGTAGTTCTGACAATTAAATGAGCTGAAATTACGCTAGCAGGAATCATCATTCAATAGATTTATTGATTTTTCCGACCGGCGTAGTTTCAGCTTTTTAACACTCGATATTGTATAAAACAAAGTACACTTTGTACTTGACAACCAGTAATAGGAGTAAAAAATATG‑‑‑‑‑CTTGCCTTGCCTTGCCTTGCCTAAACTAAACGTTAATTGCAAGCAAAATCTATCACTTTTCTTAAAAATTTATTCGGAGGATAAATGATCTCCGAAGAACTTTTCTCTCGTGACGGCGTTTCCGCTAACTCTGCACAACTTACCCAACTTAAAGCTCTTTTCCCGAATTGTTTCGATGTAAGCGGTCAATTTTTATTAGAAAAATTCCAATCTGAAATTGCAGAACAAGCCGACATCAGCCGTGAATT > 1/1230595‑1231081 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |