| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | 1 | = 213774 | 20 (0.230) | intergenic (‑1/+17) | unknown/unknown | tRNA‑Arg‑ACG/tRNA‑Ser‑GCT | |||||
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
ATTCCGTTAGATATTCCGGAAGAGGAACAGACATATTTCCTGGCGAACGTATATGGTTTGGTATTGGATCAGCCGCATGTGCTGGCGCGGGTAAGTTAAAAACGCATGGAAAAACCACCGCACTTCTTGGCGTTTGAGTAAGATAAATGAGAAATTGTTGGAATGTGAAATGGCGCACCCGAAAGGATTCGAACCTTTGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGGTGCGAGACAAATTAAACAAATGGCGGTGAGAGAGGGATTCGAACCCTCGATGGAGTTTTTGACCCCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTGCTCGGCCATCTCACCACAATCGATTTGTGGGCGGTATGATACGGGTTTATGACAATAAGTCAAATTATTTTTTCCGAAAAGTGCCTGAAATCAACTTGGTTGAGCGATTTCTCAACAAATCCGAACGGGGTTTTTGTCCTTTATTTTCCG > 1/213527‑214019 | tttgagtaagataaatgagaaattgttggaatgtgaaatggcgcacccgaaaggattcgaacctttgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacgggtgcgtagtgaatgtttaactcgctcaaaccattttaaaccatagagtcgacttaaaatggcgcacccgagaggattcgaacctcTGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGGTGCgaga > 1:240247‑M1/197‑250 (MQ=255) 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1:743796/1‑139 (MQ=255) aTCCAGCTGAGCTACGGGTGCGAGACAAATTAAACAAATGGCGGTGAGAGAGGGATTCGAACCCTCGATGGAGTTTTTGACCCCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTGCTCGGCCATCTCACCACAATCGATTTGTGGGCGGTATGATACGGGTTTATGACAATAAGTCAAATTATTTTTTCCGAAAAGTGCCTGAAATCAACTTGGTTGAGCGATTTCTCAACAAATCCGAACGGGGtttt > 1:85737/1‑251 (MQ=255) ccAGCTGAGCTACGGGTGCGAGACAAATTAAACAAATGGCGGTGAGAGAGGGATTCGAACCCTCGATGGAGTTTTTGACCCCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTGCTCGGCCATCTCACCACAATCGATTTGTGGGCGGTATGATACGGGTTTATGACAATAAGTCAAATTATTTTTTCCGAAAAGTGCCTGAAATCAACTTGGTTGAGCGATTTCTCAACAAATCCGAACGGGGTTTTTg < 1:687100/251‑1 (MQ=255) cAGCTGAGCTACGGGTGCGAGACAAATTAAACAAATGGCGGTGAGAGAGGGATTCGAACCCTCGATGGAGTTTTTGACCCCATACTCCCTTAGCAGGGGAGCGCCTTCAGCCTGCTCGGCCATCTCACCACAATCGATTTGTGGGCGGTATGATACGGGTTTATGAc < 1:842087/167‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |