| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
ACCAAGTTGATTTCAGGCACTTTTCGGAAAAAATAATTTGACTTATTGTCATAAACCCGTATCATACCGCCCACAAATCGATTGTGGTGAGATGGCCGAGCAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGGGGTCAAAAACTCCATCGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCACCGCCATTTGTTTAATTTGTCTCGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 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1:412367/1‑206 ATTGTGGTGAGATGGCCGAGCAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGGGGTCAAAAACTCCATCGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCACCGCCATTTGTTTAATTTGTCTCGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGG < 1:559847/212‑1 AGATGGCCGGGCAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGGGGTCAAAAACTCCATCGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCACCGCCATTTGTTTAATTTGTCTCGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCT < 1:332617/250‑1 AGATGGCCGAGCAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGGGGTCAAAAACTCCATCGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCACCGCCATTTGTTTAATTTGTCTCGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGT > 1:772961/1‑192 ATGGCCGAGCAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGGGGTCAAAAACTCCATCGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCACCGCCATTTGTTTAATTTGTCTCGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTC < 1:725996/249‑1 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> 1:54840/1‑250 CCATTTGTTTAATTTGTCTCGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAAT > 1:173394/1‑124 TGTTTAATTTGTCTCGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTAT > 1:560423/1‑251 GTCTCGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACA < 1:81440/128‑1 TCTCGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAA > 1:240247/1‑250 CCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGA > 1:527272/1‑251 CCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAA < 1:837035/221‑1 CGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAG < 1:731145/251‑1 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GGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTT > 1:715099/1‑251 GGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTC > 1:807751/1‑127 GGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAACTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTT > 1:833361/1‑251 ATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAAT > 1:771486/1‑85 GAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCAT > 1:521994/1‑251 GAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGACAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCAT > 1:267201/1‑251 GCTACGAACCGAGCGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGG > 1:823367/1‑170 CCGAGCGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACT > 1:639985/1‑246 CGGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGC > 1:671743/1‑250 GGTCAGAGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCA > 1:737652/1‑251 AGGTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCAC < 1:786369/249‑1 GTTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATG > 1:49436/1‑250 TTCGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAAC < 1:793142/230‑1 CGAATCCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGG < 1:868822/145‑1 CCTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGAT > 1:143200/1‑250 CTCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTG < 1:842674/141‑1 TCTCGGGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGA > 1:669702/1‑106 GGTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATAC < 1:750289/250‑1 GTGCGCCATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATACC < 1:462565/250‑1 ATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATACCAAAC < 1:27672/247‑1 ATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATACC < 1:459905/243‑1 ATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTC < 1:889335/167‑1 ATTTTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACAT < 1:162552/48‑1 TTAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCCCTGCGCCCCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATACCAAACCATATAC < 1:829532/251‑1 TAAGTCGACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATACCAAACCATATACG < 1:106469/251‑1 ACTCTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATACCAAACCATATACG > 1:288569/1‑244 CTATGGTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATACCAAACCATATACG > 1:615253/1‑241 GTTTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATACCAAACCATATACGTTCGCCAGGAAATAT > 1:548712/1‑251 TTAAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTC > 1:17279/1‑146 AAAATGGTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCT > 1:755153/1‑139 GTTTGAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATACCAAACCATATACGTTCGCCAGGAAATATGTCTGTTC > 1:221732/1‑249 GAGCGAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATACCAAACCATATACGTTCGCCAGGAAATATG > 1:781870/1‑238 GAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATACCAAACCATATACGTTCGCCAGGAAATATGTCTGTTCCTCTTCCGGA > 1:286354/1‑251 GAGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATACCAAACCATATACGTTCGCCAGGAAATATGTCTGTTCCTCTTCCGGA > 1:880771/1‑251 AGTTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGC > 1:845839/1‑193 TTAAACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATACCAAACCATATACGTTCGCCAGGAAATATGTCTGTTCCTCTTCCGGAA < 1:194230/249‑1 AACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATACCAAACCATATACGTTCGCCAGGAAATATGTCTGTTCCTCTTCCGGAATATCT < 1:555487/251‑1 AACATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATACCAAACCATATACGTTCGCCAGGAAATATGTCTGTTCCTCTTCCGGAATAT > 1:505836/1‑249 CATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATACCAAACCATATACGTTCGCCAGGAAATATGTCTGTTCCTCTTCCGGAA > 1:19209/1‑244 CATTCACTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATAC > 1:892269/1‑197 CTACGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATACCAAACCATATACGTTCGCCAGGAAATATGTCTGTTCCTCTTCCGGAATATCTAACGGAAT > 1:125209/1‑251 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ACCAAGTTGATTTCAGGCACTTTTCGGAAAAAATAATTTGACTTATTGTCATAAACCCGTATCATACCGCCCACAAATCGATTGTGGTGAGATGGCCGAGCAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGGGGTCAAAAACTCCATCGAGGGTTCGAATCCCTCTCTCACCGCCATTTGTTTAATTTGTCTCGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 1/213969‑213724‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCACCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACTCGGCTACGAACCGAGCGGTCAAAGGTTCGAATCCTTTCGGGTGCGCCATTTCACATTCCAACAATTTCTCATTTATCTTACTCAAACGCCAAGAAGTGCGGTGGTTTTTCCATGCGTTTTTAACTTACCCGCGCCAGCACATGCGGCTGATCCAATACCAAACCATATACGTTCGCCAGGAAATATGTCTGTTCCTCTTCCGGAATATCTAACGGAAT < 1/213774‑213527 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |