| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 145,202 | +AAT | intergenic (‑9751/+68495) | unknown ← / ← unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 145199 | 0 (0.000) | 68 (0.780) +AAT |
52/418 | 0.4 | 100% | intergenic (‑9748/+68498) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| ? | 1 | 145200 = | 0 (0.000) | intergenic (‑9749/+68497) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG | |||||
ATTATCTTACAGGGAGAATACATATGTCTGGCAGCGGTAATAGTGATTTTTCAAATAACCCGATCTTTAATAATGGTATAGGAGGCTTTGAAGGAGGTAATAGTGCGTCATCATGTGAATTACTACAAAAAAGCACTCAATTAATATCACCACAACCCAAAACTATAGAAAGCTTACTTATTGGAGATCGTTTAACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATTATGTCAAATAATAAATGTATTACTGTTATTGGTGGTGTATATATTGAGCGGTGCGCTTGGCCACATTGGGATGAATTATACGGTTCTGGAGGA > 1/144955‑145430 | atcttacagggagaatacatatgtctggcagcggtaatagtgatttttcaaataacccgatctttaataatggtataggaggctttgaaggaggtaatagtgcgtcatcatgtgaattactacaaaaaagcactcaattaatatcaccacaacccaaaactatagaaagcttacttattggagatcgtttgactttacagataaacaaacaagaaggatttacatctattgaagcatacaaaaatAatgat > 1:391189‑M2/246‑251 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attgaagcatacaaaaatAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATTATGTCAAATAATAAATGTATTACTGTTATTGGTGGTGTATATATTGAGCGGTGCGCTTGGCCACATTGGGATGAATTATAc < 1:765811‑M2/219‑1 (MQ=255) attgaagcatacaaaaatAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACT‑CTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAat > 1:838630‑M2/19‑84 (MQ=255) agcatacaaaaatAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTa < 1:482742‑M2/76‑1 (MQ=255) caaaaatAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAAtt > 1:88206‑M2/8‑145 (MQ=255) caaaaatAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATTATGTCAAATAATAAATGTATTACTGTTATTGGTGGTGTATATATTGAGCGGTGCGCTTGGCCACATTGGGATGAATTATACGGTTCTggagga > 1:617898‑M2/8‑238 (MQ=255) aaTGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATTATGTCAAATAATAAATGTATTAc > 1:88453/1‑161 (MQ=255) | ATTATCTTACAGGGAGAATACATATGTCTGGCAGCGGTAATAGTGATTTTTCAAATAACCCGATCTTTAATAATGGTATAGGAGGCTTTGAAGGAGGTAATAGTGCGTCATCATGTGAATTACTACAAAAAAGCACTCAATTAATATCACCACAACCCAAAACTATAGAAAGCTTACTTATTGGAGATCGTTTAACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATTATGTCAAATAATAAATGTATTACTGTTATTGGTGGTGTATATATTGAGCGGTGCGCTTGGCCACATTGGGATGAATTATACGGTTCTGGAGGA > 1/144955‑145430 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |