| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 145,202 | +AAT | intergenic (‑9751/+68495) | unknown ← / ← unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 145199 | 0 (0.000) | 68 (0.780) +AAT |
52/418 | 0.4 | 100% | intergenic (‑9748/+68498) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG |
| ? | 1 | 145200 = | 0 (0.000) | intergenic (‑9749/+68497) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG | |||||
TAATTATCTTACAGGGAGAATACATATGTCTGGCAGCGGTAATAGTGATTTTTCAAATAACCCGATCTTTAATAATGGTATAGGAGGCTTTGAAGGAGGTAATAGTGCGTCATCATGTGAATTACTACAAAAAAGCACTCAATTAATATCACCACAACCCAAAACTATAGAAAGCTTACTTATTGGAGATCGTTTAACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/144953‑145199‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATTATGTCAAATAATAAATGTATTACTGTTATTGGTGGTGTATATATTGAGCGGTGCGCTTGGCCACATTGGGATGAATTATACGGTTCTGGAGGA > 1/145200‑145430 ||| TAATTATCTTACAGGGAGAATACATATGTCTGGCAGCGGTAATAGTGATTTTTCAAATAACCCGATCTTTAATAATGGTATAGGAGGCTTTGAAGGAGGTAATAGTGCGTCATCATGTGAATTACTACAAAAAAGCACTCAATTAATATCACCACAACCCAAAACTATAGAAAGCTTACTTATTGGAGATCGTTTAACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAAT < 1:238046/250‑1 ATCTTACAGGGAGAATACATATGTCTGGCAGCGGTAATAGTGATTTTTCAAATAACCCGATCTTTAATAATGGTATAGGAGGCTTTGAAGGAGGTAATAGTGCGTCATCATGTGAATTACTACAAAAAAGCACTCAATTAATATCACCACAACCCAAAACTATAGAAAGCTTACTTATTGGAGATCGTTTGACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATAATGAT > 1:391189/1‑251 ATCTTACAGGGAGAATACATATGTCTGGCAGCGGTAATAGTGATTTTTCAAATAACCCGATCTTTAATAATGGTATAGGAGGCTTTGAAGGAGGTAATAGTGCGTCATCATGTGAATTACTACAAAAAAGCACTCAATTAATATCACCACAACCCAAAACTATAGAAAGCTTACTTATTGGAGATCGTTTAACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATAATGAT > 1:448769/1‑251 ATCTTACAGGGAGAATACATATGTCTGGCAGCGGTAATAGTGATTTTTCAAATAACCCGATCTTTAATAATGGTATAGGAGGCTTTGAAGGAGGTAATAGTGCGTCATCATGTGAATTACTACAAAAAAGCACTCAATTAATATCACCACAACCCAAAACTATAGAAAGCTTACTTATTGGAGATCGTTTAACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATAATGAT > 1:375185/1‑251 GGGAGAATACATATGTCTGGCAGCGGTAATAGTGATTTTTCAAATAACCCGATCTTTAATAATGGTATAGGAGGCTTTGAAGGAGGTAATAGTGCGTCATCATGTGAATTACTACAAAAAAGCACTCAATTAATATCACCACAACCCAAAACTATAGAAAGCTTACTTATTGGAGATCGTTTAACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATAATGATGATAGAG > 1:612873/1‑250 GAATACATATGTCTGGCAGCGGTAATAGTGATTTTTCAAATAACCCGATCTTTAATAATGGTATAGGAGGCTTTGAAGGAGGTAATAGTGCGTCATCATGTGAATTACTACAAAAAAGCACTCAATTAATATCACCACAACCCAAAACTATAGAAAGCTTACTTATTGGAGATCGTTTAACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATAATGATGATAGAGCGGGA > 1:584106/1‑251 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CTTTAATAATGGTATAGGAGGCTTTGAAGGAGGTAATAGTGCGTCATCATGTGAATTACTACAAAAAAGCACTCAATTAATATCACCACAACCCAAAACTATAGAAAGCTTACTTATTGGAGATCGTTTAACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAAT < 1:11373/251‑1 AATAATGGTATAGGAGGCTTTGAAGGAGGTAATAGTGCGTCATCATGTGAATTACTACAAAAAAGCACTCAATTAATATCACCACAACCCAAAACTATAGAAAGCTTACTTATTGGAGATCGTTTAACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTAAATCTATTGAAGCATAAAAAAATAATGATGATAGAGAGGGAGGGATTGTACTTCAACAACTAATAAATTGAATGGAGAAAGGTCATAAATATAT < 1:505713/251‑1 GGTATAGGAGGCTTTGAAGGAGGTAATAGTGCGTCATCATGTGAATTACTACAAAAAAGCACTCAATTAATATCACCACAACCCAAAACTATAGAAAGCTTACTTATTGGAGATCGTTTAACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATAT > 1:833067/1‑243 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AAGGAGGTAATAGTGCGTCATCATGTGAATTACTACAAAAAAGCACTCAATTAATATCACCACAACCCAAAACTATAGAAAGCTTACTTATTGGAGATCGTTTAACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTAT < 1:359410/250‑1 GAGGTAATAGTGCGTCATCATGTGAATTACTACAAAAAAGCACTCAATTAATATCACCACAACCCAAAACTATAGAAAGCTTACTTATTGGAGATCGTTTAACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAAT > 1:319556/1‑222 GGTAATAGTGCGTCATCATGTGAATTACTACAAAAAAGCACTCAATTAATATCACCACAACCCAAAACTATAGAAAGCTTACTTATTGGAGATCGTTTAACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGG > 1:748463/1‑251 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CTTATTGGAGATCGTTTAACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATTATGTCAAATAATAAATGTATTACTGTTATTGGTGGTGTATA > 1:40088/1‑251 ATTGGAGATCGTTTAACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATTATGTCAAATAATAAATGTATTACTGTTATTGGTGGTGTATATAT < 1:42961/251‑1 ATCGTTTAACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATTATGTCAAATAATAAATGTATTACTGTTATTGGTGGTGTATATATTGAGC < 1:503724/249‑1 CTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAG > 1:873940/1‑126 GATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATAT < 1:216599/115‑1 CAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATTATGTCAAATAATAAATG > 1:692350/1‑191 GGATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATTATGTCAAATAATAAATGTATTACTGTTATTGGTGGTGTATATATTGAGCGGTGCGCTTGGCCACATTGGGATGAATTATAC < 1:650926/249‑1 GATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGT < 1:630946/139‑1 ATTTACATCTATTGAAGCATACAAAAATAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATTATGTCAAATAATAAATGTATTACTGTTATTGGTGGTGTATATAT > 1:636372/1‑210 CATCTATTGAAGCATACAAAAATAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAG < 1:664830/105‑1 ATTGAAGCATACAAAAATAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATTATGTCAAATAATAAATGTATTACTGTTATTGGTGGTGTATATATTGAGCGGTGCGCTTGGCCACATTGGGATGAATTATAC < 1:765811/237‑1 ATTGAAGCATACAAAAATAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACT‑CTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAAT > 1:838630/1‑84 AGCATACAAAAATAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTA < 1:482742/89‑1 CAAAAATAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATTATGTCAAATAATAAATGTATTACTGTTATTGGTGGTGTATATATTGAGCGGTGCGCTTGGCCACATTGGGATGAATTATACGGTTCTGGAGGA > 1:617898/1‑238 CAAAAATAATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATT > 1:88206/1‑145 ||| TAATTATCTTACAGGGAGAATACATATGTCTGGCAGCGGTAATAGTGATTTTTCAAATAACCCGATCTTTAATAATGGTATAGGAGGCTTTGAAGGAGGTAATAGTGCGTCATCATGTGAATTACTACAAAAAAGCACTCAATTAATATCACCACAACCCAAAACTATAGAAAGCTTACTTATTGGAGATCGTTTAACTTTACAGATAAACAAACAAGAAGGATTTACATCTATTGAAGCATACAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/144953‑145199‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATGATGATAGAGCGGGAGGGATTGTACTTCCACAACTCCTCACTTGCATGGAGAACGGTCATAAATATATAGCTATTGTAGAAAGTATTATTGAAGGACAAGTTCAAGTATCTATCAAACATATCTGAGTCTTAATTATGTCAAATAATAAATGTATTACTGTTATTGGTGGTGTATATATTGAGCGGTGCGCTTGGCCACATTGGGATGAATTATACGGTTCTGGAGGA > 1/145200‑145430 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |