| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 945,038 | Δ1,650 bp | unknown–unknown | unknown, unknown, unknown | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 945038 | 946687 | 1650 | 76 [0] | [1] 77 | unknown–unknown | unknown,unknown,unknown |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 945037 | 0 (0.000) | 71 (0.930) | 50/372 | 0.3 | 100% | intergenic (+4/‑275) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑GAG/Integrase |
| ? | 1 | 946688 = | 0 (0.000) | intergenic (+504/‑78) | unknown/unknown | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
TAGCCATCATCATCTTTTCATGGTTGTCACTTGCATGGGGTTAACTTATAAATTGCCGGATCTATTTTTATAGAGTTCGAAAATTCCCTGGCAAGAATCTATTGTTCAATGATTAAGCAAAATAGGGTATGACTTTTTGATTTAGTTATACGTTTAGTTATACGGTAAAGATTTTTAAAAATCTAACTTTAGTAACGATATGGATTGATTTGACTTAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCT‑CACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAAATAAAACATTAAATGAATGTATTAGTGGAGCTTTAAATGATGAACACAAATGTCAGAC > 1/946443‑946935 | gcaacatcaattcgcacagaaacaacgtaaaacaaggcgcatttgacgatttatccggcacagcggaacaaattcagcagcaacagcaacaacaagcaccagctgtattagacacaaaaaacaacgatattcctcaataaaatttatcaaattaagctctggtggtggaattggtagacacgctatcttgagggggtagtgaccgtaggtcatgcgagttcaagtctcgcccagagcaccaatttCTaaaa > 1:138364‑M2/246‑251 (MQ=255) 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TAGCCATCATCATCTTTTCATGGTTGTCACTTGCATGGGGTTAACTTATAAATTGCCGGATCTATTTTTATAGAGTTCGAAAATTCCCTGGCAAGAATCTATTGTTCAATGATTAAGCAAAATAGGGTATGACTTTTTGATTTAGTTATACGTTTAGTTATACGGTAAAGATTTTTAAAAATCTAACTTTAGTAACGATATGGATTGATTTGACTTAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTCTAAAAGATCGCGGTTTTGCGGTC‑TTTTTTATTGGTTTTCTACATGTTATCT‑CACTATCTTAAATTAAGGAGTTTTCTATGAAAAAATTATCTGTTTCCCTTCTTATTGCCGGTTCTTTGCTTGCTTTGGCTGGTTGTGAAGAAAAGAATATGACAATTTATGATTATCTTCAGAACGAAGAACTGTTAAATAAAACATTAAATGAATGTATTAGTGGAGCTTTAAATGATGAACACAAATGTCAGAC > 1/946443‑946935 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |