| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 945,038 | Δ1,650 bp | unknown–unknown | unknown, unknown, unknown | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 945038 | 946687 | 1650 | 76 [0] | [1] 77 | unknown–unknown | unknown,unknown,unknown |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 945037 | 0 (0.000) | 71 (0.930) | 50/372 | 0.3 | 100% | intergenic (+4/‑275) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑GAG/Integrase |
| ? | 1 | 946688 = | 0 (0.000) | intergenic (+504/‑78) | unknown/unknown | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
GCAACATCAATTCGCACAGAAACAACGTAAAACAAGGCGCATTTGACGATTTATCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTTGAAAAGATCGCAATTTTGCGGTCTTTTTTTGTTGTATTTTTTCTTACACCTTCTTGCACTCACTCCTTGCTATTACAGGCTTTATTTAAATTTCTATCTTTTCTGGTTTTATTTCTTTTTACGTTTTCTTACGTTTACAACCGCTTATTTTAGTTATATGCTTAGTTATATGTTTTGAGTTTCTGAAAATGGGTATAGCTAAAATTTGATGAAAGCTTGTCCAAAAA > 1/944793‑945265 | gCAACATCAATTCGCACAGAAACAACGTAAAACAAGGCGCATTTGACGATTTATCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaa > 1:138364‑M1/1‑245 (MQ=255) cAACATCAATTCGCACAGAAACAACGTAAAACAAGGCGCATTTGACGATTTATCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaag < 1:236903‑M1/251‑8 (MQ=255) aCATCAATTCGCACAGAAACAACGTAAAACAAGGCGCATTTGGCGATTTATCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagat < 1:105862‑M1/251‑10 (MQ=255) cacaGAAACAACGTAAAACAAGGCGCATTTGACGATTTATCCGGCACACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggtttt > 1:247341‑M1/1‑233 (MQ=255) acGTAAAACAAGGCGCATTTGACGATTTATCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtctttttt > 1:223582‑M1/1‑221 (MQ=255) tAAAACAAGGCGCATTTGACGATTTATCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttat < 1:217835‑M1/250‑33 (MQ=255) cATTTGACGATTTATCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaa < 1:771784‑M1/211‑6 (MQ=255) aTTTGACGATTTATCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatg < 1:600237‑M1/251‑47 (MQ=255) aCGATTTATCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttat < 1:807651‑M1/250‑51 (MQ=255) aTTTATCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctc < 1:833832‑M1/250‑54 (MQ=255) tttATCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTTAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcac < 1:853187‑M1/251‑56 (MQ=255) tttATCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcac < 1:95656‑M1/251‑56 (MQ=255) aTCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctc > 1:110356‑M1/1‑193 (MQ=255) aTCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatg > 1:776850‑M1/1‑193 (MQ=255) aTCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctaca < 1:564211‑M1/237‑45 (MQ=255) ccGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatct < 1:556322‑M1/251‑61 (MQ=255) cGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaat < 1:190231‑M1/247‑66 (MQ=255) gAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaagg < 1:820126‑M1/250‑71 (MQ=255) aTTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttc < 1:645847‑M1/251‑78 (MQ=255) aTTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactat < 1:364813‑M1/232‑59 (MQ=255) gcaacagcaacaACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaa > 1:26279‑M1/1‑166 (MQ=255) gcaacaACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattat > 1:302683‑M1/1‑160 (MQ=255) caacaaGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctc < 1:195055‑M1/209‑54 (MQ=255) aCCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttc < 1:735294‑M1/251‑104 (MQ=255) cAGCTGTAATAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaat < 1:755185‑M1/211‑66 (MQ=255) cTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttat < 1:27699‑M1/250‑108 (MQ=255) gTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattg > 1:835623‑M1/1‑141 (MQ=255) gTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattg > 1:459676‑M1/1‑141 (MQ=255) gTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactat > 1:147187‑M1/1‑141 (MQ=255) gTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcac > 1:153812‑M1/1‑141 (MQ=255) aGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggtt > 1:706197‑M1/1‑136 (MQ=255) aaaCAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttg > 1:449833‑M1/1‑127 (MQ=255) aacaacGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgc < 1:185301‑M1/251‑126 (MQ=255) caacGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctt > 1:331827‑M1/1‑124 (MQ=255) caacGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggag < 1:381422‑M1/196‑73 (MQ=255) caacGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaat > 1:177481‑M1/1‑124 (MQ=255) cGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaat > 1:255921‑M1/1‑121 (MQ=255) atatTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggct < 1:19185‑M1/251‑133 (MQ=255) ccTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttg > 1:357204‑M1/1‑114 (MQ=255) cAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaat < 1:670587‑M1/176‑66 (MQ=255) aTAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaag < 1:314141‑M1/251‑143 (MQ=255) aTAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctac > 1:887162‑M1/1‑109 (MQ=255) aTTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaag < 1:738374‑M1/251‑148 (MQ=255) aTCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttccctt < 1:608326‑M1/202‑103 (MQ=255) aaTTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaagaatatga > 1:805932‑M1/1‑96 (MQ=255) gCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaagaatatgacaattta > 1:280786‑M1/1‑90 (MQ=255) ctGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatg > 1:725146‑M1/1‑87 (MQ=255) gtggtggAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtctcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaagaatatgacaatttatgatta > 1:575399‑M1/1‑84 (MQ=255) cGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaagaatatgacaatttatgattatcttcagaacgaagaa > 1:893442‑M1/1‑65 (MQ=255) cGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaagaatatgacaatttatgattatcttcagaacgaagaa > 1:854297‑M1/1‑65 (MQ=255) aTCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaagaatatgacaatttatgattatcttcagaacgaagaactgttaa > 1:416868‑M1/1‑61 (MQ=255) aTCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaagaatatgacaatttatgattatcttcagaacgaagaactgttaa > 1:840071‑M1/1‑61 (MQ=255) aTCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaagaatatgacaatttatgattatcttcagaacgaagaactgttaa > 1:336534‑M1/1‑61 (MQ=255) aTCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaagaatatgacaatttatgattatcttcagaa > 1:74510‑M1/1‑61 (MQ=255) aTCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggct < 1:741924‑M1/193‑133 (MQ=255) cTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaagaatatgacaatttatgattatcttcagaacgaagaactgttaaat < 1:195555‑M1/251‑193 (MQ=255) cTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatg < 1:472877‑M1/105‑47 (MQ=255) ggTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaagaatatgacaatttatgattatcttcagaacgaagaactgttaaataaaacatt > 1:550371‑M1/1‑51 (MQ=255) ggTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaagaatatgacaatttatgattatcttcagaacgaagaactgttaaataaaacat < 1:194549‑M1/250‑200 (MQ=255) ggTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaagaatatgacaatttatgattatcttcagaacgaagaac > 1:394494‑M1/1‑51 (MQ=255) ggTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaagaatatgacaatttatgat > 1:123421‑M1/1‑51 (MQ=255) ggTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaat < 1:889060‑M1/116‑66 (MQ=255) gTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaagaatatgacaatttatgattatcttcagaacgaagaac < 1:415579‑M1/234‑185 (MQ=255) gACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaagaatatgacaatttatgattatcttcagaacgaagaactgttaaataaaacattaaatga > 1:86388‑M1/1‑45 (MQ=255) gACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggc < 1:563257‑M1/176‑132 (MQ=255) aCCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttctta > 1:514615‑M1/1‑44 (MQ=255) aCCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatc > 1:812482‑M1/1‑44 (MQ=255) aCCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgtt > 1:300206‑M1/1‑44 (MQ=255) ccGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaag < 1:25103‑M1/50‑8 (MQ=255) tCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaag > 1:47478‑M1/1‑36 (MQ=255) tGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaagaatatgacaatttatgattatcttcagaacgaagaactgttaaataaaacattaaatgaatgtattagtgg < 1:549983‑M1/251‑219 (MQ=255) gTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaagaatatgacaatttatgat > 1:160071‑M1/1‑28 (MQ=255) gTCTCGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgt < 1:633935‑M1/69‑48 (MQ=255) tctcGCCCAGAGCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaagaatatgacaatttatgattatcttcagaacgaagaactgttaaataaaacattaaatgaatgtattagtggagctttaaat < 1:346183‑M1/249‑229 (MQ=255) gagCACCAATTTctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttcttattgccggttctttgcttgctttggctggttgtgaagaaaagaatatgacaatttatgattatcttcagaacgaagaactgttaaataaaacattaaatgaatgtattagtgg > 1:545011‑M1/1‑12 (MQ=255) ttctaaaagatcgcggttttgcggtcttttttattggttttctacatgttatctcactatcttaaattaaggagttttctatgaaaaaattatctgtttcccttc < 1:123759‑M1/105‑104 (MQ=255) | GCAACATCAATTCGCACAGAAACAACGTAAAACAAGGCGCATTTGACGATTTATCCGG‑‑CACAGCGGAACAAATTCAGCAGCAACAGCAACAACAAGCACCAGCTGTATTAGACACAAAAAACAACGATATTCCTCAATAAAATTTATCAAATTAAGCTCTGGTGGTGGAATTGGTAGACACGCTATCTTGAGGGGGTAGTGACCGTAGGTCATGCGAGTTCAAGTCTCGCCCAGAGCACCAATTTTGAAAAGATCGCAATTTTGCGGTCTTTTTTTGTTGTATTTTTTCTTACACCTTCTTGCACTCACTCCTTGCTATTACAGGCTTTATTTAAATTTCTATCTTTTCTGGTTTTATTTCTTTTTACGTTTTCTTACGTTTACAACCGCTTATTTTAGTTATATGCTTAGTTATATGTTTTGAGTTTCTGAAAATGGGTATAGCTAAAATTTGATGAAAGCTTGTCCAAAAA > 1/944793‑945265 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |