| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 525,659 | Δ4 bp | intergenic (‑306/‑2) | unknown ← / → unknown | Cof protein, HD superfamily hydrolase/Acetolactate synthase large subunit (EC 2.2.1.6) |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 525659 | 525662 | 4 | 166 [0] | [0] 166 | unknown/unknown | Cof protein, HD superfamily hydrolase/Acetolactate synthase large subunit (EC 2.2.1.6) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 525658 | 0 (0.000) | 166 (1.880) | 86/430 | 0.0 | 100% | intergenic (‑305/‑6) | unknown/unknown | Cof protein, HD superfamily hydrolase/Acetolactate synthase large subunit (EC 2.2.1.6) |
| ? | 1 | 525663 = | 0 (0.000) | intergenic (‑310/‑1) | unknown/unknown | Cof protein, HD superfamily hydrolase/Acetolactate synthase large subunit (EC 2.2.1.6) | |||||
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
CGTTGTTTCCTTGAATTTTAATAAAAGATTAAATCTTTCACGTAGTAAAAAAATTCCTTCCTCAAAATAGAAGTTATCGTAAGTATGAACGGTGCAAATTTAATAATCGAGTGCTTAAAAGCACATAATGTGGACACCATTTTCGGCTTCCCGGCGGCGCCATCATGCCAACCTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATCGGATATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCCTTGCCTGCACCAAACACAGTTTCATCGTGCAACATATTGATGAGTTGTCGGAAATTCCCGCCAA > 1/525413‑525911 | tattcgttgtttccttgaattttaataaaagattaaatctttcacgtagtaaaaaaattccttcctcaaaatagaagttatcgtaagtatgaacggtgcaaatttaataatcgagtgcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatt > 1:846848‑M2/251‑251 (MQ=255) tcgttgtttccttgaattttaataaaagattaaatctttcacgtattaaaaaaattccttcctcaaaatagaagttatcgtaagtatgaacggtgcaaatttaataatcgagtgcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATg < 1:255790‑M2/4‑1 (MQ=255) tcgttgtttccttgaattttaataaaagattaaatctttcacgtagtaaaaaaattccttcctcaaaatagaagttatcgtaagtatgaacggtgcaaatttaataatcgagtgcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATg < 1:320913‑M2/4‑1 (MQ=255) taataaaagattaaatctttcacgtagtaaaaaaattccttcctcaaaatagaagttatcgtaagtatgaacggtgcaaatttaataatcgagtgcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTcc < 1:369396‑M2/7‑1 (MQ=255) aataaaagattaaatctttcacgtagtaaaaaaattccttcctcaaaatagaagttatcgtaagtatgaacggtgcaaatttaataatcgagtgcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATc < 1:781893‑M2/24‑1 (MQ=255) gattaaatctttcacgtagtaaaaaaattccttcctcaaaatagaagttatcgtaagtatgaacggtgcaaatttaataatcgagtgcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctactttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGgtgtgt > 1:631735‑M2/221‑251 (MQ=255) tctttcacgtagtaaaaaaattccttcctcaaaatagaagttatcgtaagtatgaacggtgcaaatttaataatcgagtgcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTa < 1:136164‑M2/38‑1 (MQ=255) 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agtatgaacggtgcaaatttaataatcgagtgcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGa < 1:143575‑M2/47‑1 (MQ=255) agtatgaacggtgcaaatttaataatcgagtgcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGa < 1:165757‑M2/47‑1 (MQ=255) agtatgaacggtgcaaatttaataatcgagtgcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCtt > 1:575198‑M2/166‑251 (MQ=255) agtatgaacggtgcaaatttaataatcgagtgcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCtt > 1:122463‑M2/166‑251 (MQ=255) gtatgaacggtgcaaatttaataatcgagtgcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATc < 1:224003‑M2/34‑1 (MQ=255) gtatgaacggtgcaaatttaataatcgagtgcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGa < 1:56926‑M2/47‑1 (MQ=255) gtatgaacggtgcaaatttaataatcgagtgcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCttt > 1:625257‑M2/165‑251 (MQ=255) gtatgaacggtgcaaatttaataatcgagtgcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCttt > 1:754370‑M2/165‑251 (MQ=255) aacggtgcaaatttaataatcgagtgcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATgg < 1:700036‑M2/92‑1 (MQ=255) aacggtgcaaatttaataatcgagtgcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATg < 1:174052‑M2/91‑1 (MQ=255) aacggtgcaaatttaataatcgagtgcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATg < 1:730862‑M2/91‑1 (MQ=255) gtgcaaatttaataatcgagtgcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGa < 1:63636‑M2/47‑1 (MQ=255) gtgcaaatttaataatcgagtgcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGatt > 1:188128‑M2/156‑250 (MQ=255) 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gcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTa > 1:708891‑M2/135‑250 (MQ=255) gcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTa > 1:482199‑M2/135‑250 (MQ=255) gcttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTa > 1:183953‑M2/135‑250 (MQ=255) cttaaaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggccatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTAc > 1:822300‑M2/134‑250 (MQ=255) aaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGAc < 1:726893‑M2/122‑1 (MQ=255) aaagcacataatgtggacaccattttcggcttcccggcggcgccatcatgccaacctacgatgccatttatgattccggttagatcatctgctttgtcgtaacgaacaaggtgccgccatggcggctatTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGAc < 1:39574‑M2/122‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |