| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 525,659 | Δ4 bp | intergenic (‑306/‑2) | unknown ← / → unknown | Cof protein, HD superfamily hydrolase/Acetolactate synthase large subunit (EC 2.2.1.6) |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 525659 | 525662 | 4 | 166 [0] | [0] 166 | unknown/unknown | Cof protein, HD superfamily hydrolase/Acetolactate synthase large subunit (EC 2.2.1.6) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 525658 | 0 (0.000) | 166 (1.880) | 86/430 | 0.0 | 100% | intergenic (‑305/‑6) | unknown/unknown | Cof protein, HD superfamily hydrolase/Acetolactate synthase large subunit (EC 2.2.1.6) |
| ? | 1 | 525663 = | 0 (0.000) | intergenic (‑310/‑1) | unknown/unknown | Cof protein, HD superfamily hydrolase/Acetolactate synthase large subunit (EC 2.2.1.6) | |||||
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
TATTCGTTGTTTCCTTGAATTTTAATAAAAGATTAAATCTTTCACGTAGTAAAAAAATTCCTTCCTCAAAATAGAAGTTATCGTAAGTATGAACGGTGCAAATTTAATAATCGAGTGCTTAAAAGCACATAATGTGGACACCATTTTCGGCTTCCCGGCGGCGCCATCATGCCAACCTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 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> 1:409273/1‑251 AATGTGGACACCATTTTCGGCTTCCCGGCGGCGCCATCATGCCAACCTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTT > 1:886774/1‑251 ATGTGGACACCATTTTCGGCTTCCCGGCGGCGCCATCATGCCAACCTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTC < 1:52330/251‑1 ATGTGGACACCATTTTCGGCTTCCCGGCGGCGCCATCATGCCAACCTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTC < 1:825790/251‑1 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ACACCATTTTCGGCTTCCCGGCGGCGCCATCATGCCAACCTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGC < 1:746109/250‑1 ACCATTTTCGGCTTCCCGGCGGCGCCATCATGCCAACCTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGGAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCc < 1:438747/251‑2 CCATTTTCGGCTTCCCGGCGGCGCCATCATGCCAACCTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCAT > 1:6781/1‑251 CCATTTTCGGCTTCCCGGCGGCGCCATCATGCCAACCTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTC < 1:443285/116‑1 CCATTTTCGGCTCCCCGGCGGCGCCATCATGCCAACCTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCAT > 1:510363/1‑251 ATTTTCGGCTTCCCGGCGGCGCCATCATGCCAACCTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCG > 1:547898/1‑251 TTTTCGGCTTCCCGGCGGCGCCATCATGCCAACCTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGA < 1:351989/154‑1 TCGGCTTCCCGGCGGCGCCATCATGCCAACCTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCAC < 1:767998/251‑1 CGCCATCATGCCAACCTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGA < 1:26516/251‑1 CGCCATCATGCCAACCTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGG < 1:371692/250‑1 CATCATGCCAACCTGCGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACC < 1:471767/156‑1 CATGCCAACCTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGC < 1:54059/220‑1 CCAACCTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTA > 1:581318/1‑251 AACCTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCAC < 1:587813/224‑1 CCTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCG > 1:711488/1‑251 CTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGC < 1:728252/219‑1 TACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGT < 1:310139/251‑1 ATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGA < 1:116238/116‑1 GCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATC > 1:802967/1‑250 CCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCC < 1:544179/251‑1 CCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCC < 1:743652/251‑1 CCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCC < 1:173511/251‑1 ATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCC < 1:418978/198‑1 TTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAG < 1:584782/134‑1 TATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTGGGCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCCTTGCC < 1:88818/251‑1 GGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCCTTGCCTGCACCAAA > 1:276994/1‑251 GGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTC < 1:119695/153‑1 TAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCCTTGCCTGCACCAAACAC < 1:408747/251‑1 TAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCCTTGCCTGCACCAAACAC < 1:874553/251‑1 GATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCCTTGCCTGCACCAAACACAG > 1:688263/1‑251 GATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCCTTGCCTGCACCAAACACAG > 1:776537/1‑251 GATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTAC < 1:32129/164‑1 GATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACC > 1:118309/1‑109 GATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGC > 1:352518/1‑83 GATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCG > 1:33929/1‑59 CATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTC < 1:156287/153‑1 GCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCCTTGCCTGCACCAAACACAGTTTCATCG > 1:269010/1‑251 GCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGC < 1:505591/113‑1 CTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCCTTGCCTGCACCAAACACAGTTTCATCG < 1:459230/250‑1 TAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCCTTGCCTGCACCAAACACAGTTTCATCGTGCAACAT < 1:5110/250‑1 GAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCCTTGCCTGCACCAAACACAGTTTCATCGTGCAACATATTGA > 1:421991/1‑251 GAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGAC > 1:33462/1‑148 AACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCCTTGCCTGCACCAAACACAGTTTCATCGTGCAACATATTGA < 1:376545/250‑1 AACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCCTTGCCTGCACCAAACACAGTTTCATCGTGCAACATATTGA < 1:18996/250‑1 AAGGTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCCTTGCCTGCACCAAACACAGTTTCATCGTGCAACATATTGATGAG < 1:370410/251‑1 GTGCCGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCCTTGCCTGCACCAAACACAGTTTCATCGTGCAACATATTGATG < 1:719371/246‑1 CGCCATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCCTTGCCTGCACCAAACACAGTTTCATC > 1:420051/1‑226 ATGGCGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCCTTGCCTGCACCAAACACAGTTTCATCGTGCAACATATTGATGAGTTGTCGGAAAT < 1:869076/251‑1 CGGCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTT < 1:348730/93‑1 GCTATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCCTTGCCTGCACCAAACACAGTTTCATCGTGCAACATATTGATGAGTTGTCGGAAATTCCCG > 1:373321/1‑250 ATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCCTTGCC > 1:356922/1‑192 ATTATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTC > 1:85520/1‑103 TATTCGTTGTTTCCTTGAATTTTAATAAAAGATTAAATCTTTCACGTAGTAAAAAAATTCCTTCCTCAAAATAGAAGTTATCGTAAGTATGAACGGTGCAAATTTAATAATCGAGTGCTTAAAAGCACATAATGTGGACACCATTTTCGGCTTCCCGGCGGCGCCATCATGCCAACCTACGATGCCATTTATGATTCCGGTTAGATCATCTGCTTTGTCGTAACGAACAAGGTGCCGCCATGGCGGCTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/525409‑525658‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATGTCCGCGCGTCGGGGAAAATCGGTGTGTATCGCTACCTCAGGGACGGGCGCCACCAACCTCATCACCAGGCTCGGCGATGCTTTAATGGATTCCATTCCTATCGTCGCCATTACCGGACAGGTCGCTTCCCTGCTCATCGGCACCGATGCCTTTCAGGAAGCGGATGTACTCGGTTTATCCCTTGCCTGCACCAAACACAGTTTCATCGTGCAACATATTGATGAGTTGTCGGAAATTCCCGCCAA > 1/525663‑525911 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |