| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 1,301,665 | (CACCT)3→5 | intergenic (+139/‑146) | unknown → / → unknown | Translation initiation factor 2/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1301647 | 3 (0.040) | 59 (0.700) +CCTCACCTCA |
38/374 | 0.7 | 95.2% | intergenic (+121/‑164) | unknown/unknown | Translation initiation factor 2/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) |
| ? | 1 | 1301648 = | 3 (0.030) | intergenic (+122/‑163) | unknown/unknown | Translation initiation factor 2/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) | |||||
CCGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCAAGAAACGGCAGTTTATAACCATCTTTTCACTTTCTTTTCCCGCTATTACGACAACG > 1/1301414‑1301886 | cgtttccgaagtgcgtaacggcatggaatgcggtatcggcgtgaagaactacaacgatgtgaaagtcggcgaccagattgaagtgtttgaagtggttgaggttaaacgttcgatctaatttttaatctaaaagagcggtcaaaattcatagtgttttgaccgctcttttacataggatataaacaccatattccatcaaaaataacttgacagctagattttaaaaggaaaaaaatatgcctcacctcacc < 1:727411‑M2/2‑1 (MQ=255) 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atgcctcacctcaCCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCAAGAAACGGCAGTTTATAACCATCTTTTCACTTTCTTTTCCCGCTATTACGACaa > 1:286817‑M2/14‑250 (MQ=255) tgcctcacctcaCCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATc > 1:136017‑M2/13‑45 (MQ=255) tgcctcacctcaCCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCAAGAAACGGCAGTTTATAACCATCTTTTCACTTTCTTTTCCCGCTATTACGACAACg > 1:132164‑M2/13‑251 (MQ=255) cacctcaCCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAAcc < 1:731679‑M2/136‑1 (MQ=255) | CCGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCAAGAAACGGCAGTTTATAACCATCTTTTCACTTTCTTTTCCCGCTATTACGACAACG > 1/1301414‑1301886 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |