| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 1,301,665 | (CACCT)3→5 | intergenic (+139/‑146) | unknown → / → unknown | Translation initiation factor 2/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | 1 | = 1301647 | 3 (0.040) | 59 (0.700) +CCTCACCTCA |
38/374 | 0.7 | 95.2% | intergenic (+121/‑164) | unknown/unknown | Translation initiation factor 2/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) |
| ? | 1 | 1301648 = | 3 (0.030) | intergenic (+122/‑163) | unknown/unknown | Translation initiation factor 2/Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) | |||||
CGTTTCCGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCAAGAAACGGCAGTTTATAACCATCTTTTCACTTTCTTTTCCCGCTATTACGA > 1/1301409‑1301881 | cgTTTCCGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATGcctcacctcacc < 1:727411‑M1/251‑13 (MQ=255) 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tAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATGcctcacctcacctcacctcacctcaccttgcacaacttatatctaaactcaaggaaatttttcaaattaatcaaccggagctggatttcggtatttatcgcattttaaattcccgcgctgcggaaattgccacctttcttgaaaccacacttcctcaaaaaattcaaactgcattgg > 1:819158‑M1/1‑37 (MQ=255) aaaTATGcctcacctcacctcacctcacctcaccttgcacaacttatatctaaactcaaggaaatttttcaaattaatcaaccggagctggatttcggtatttatc > 1:551014‑M1/1‑7 (MQ=255) atGcctcacctcacctcacctcacctcaccttgcacaacttatatctaaactcaaggaaatttttcaaattaatcaaccggagctggatttcggtatttatcgcattttaaattcccgcgctgcggaaattgccacctttcttgaaaccacacttcctcaaaaaattcaaactgcattggcgagcaatgccgagcaagaaacggcagtttataaccatcttttcactttcttttcccgctattacgacaa > 1:286817‑M1/1‑3 (MQ=255) tGcctcacctcacctcacctcacctcaccttgcacaacttatatctaaactcaaggaaatttttcaaattaatcaaccggagctggatttcggtatttatcgcattttaaattcccgcgctgcggaaattgccacctttcttgaaaccacacttcctcaaaaaattcaaactgcattggcgagcaatgccgagcaagaaacggcagtttataaccatcttttcactttcttttcccgctattacgacaacg > 1:132164‑M1/1‑2 (MQ=255) tGcctcacctcacctcacctcacctcaccttgcacaacttatatc > 1:136017‑M1/1‑2 (MQ=255) | CGTTTCCGAAGTGCGTAACGGCATGGAATGCGGTATCGGCGTGAAGAACTACAACGATGTGAAAGTCGGCGACCAGATTGAAGTGTTTGAAGTGGTTGAGGTTAAACGTTCGATCTAATTTTTAATCTAAAAGAGCGGTCAAAATTCATAGTGTTTTGACCGCTCTTTTACATAGGATATAAACACCATATTCCATCAAAAATAACTTGACAGCTAGATTTTAAAAGGAAAAAAATATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCTCACCTCACCTCACCTTGCACAACTTATATCTAAACTCAAGGAAATTTTTCAAATTAATCAACCGGAGCTGGATTTCGGTATTTATCGCATTTTAAATTCCCGCGCTGCGGAAATTGCCACCTTTCTTGAAACCACACTTCCTCAAAAAATTCAAACTGCATTGGCGAGCAATGCCGAGCAAGAAACGGCAGTTTATAACCATCTTTTCACTTTCTTTTCCCGCTATTACGA > 1/1301409‑1301881 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |