| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | 1 | 513,143 | Δ1,462 bp | unknown | unknown | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | 1 | 513143 | 514604 | 1462 | 101 [0] | [0] 101 | unknown | unknown |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | 1 | 514605 = | 0 (0.000) | intergenic (+266/‑472) | unknown/unknown | Integrase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
AATCAACCCACATTCTTTTTACACTCGAACGGTAGTCTTTAAACCGTAGGGAAAAGTGCTTGCATGGGGTTGATTTTAAAAAGCCCTCATGAGCTTAAAAATTGTGTGAAAAATAGACAAAATAAACGATTAAAAAAATTTTAGTACTATAAATAGTACCATAATTAGATACGGTAAAAATTAAATCATTTAAAAACAATTAGTTATGCTTTAAATTCAACTCCTACGATCTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACC > 1/514367‑514851 | aatgcggaacaatatcaatccgtttaccaacgctatcgccaacatttaaacgcccaatattccgtataaaattaatggattatttttccgcttcacttgaatcgcacgagcttttgcgctaaagttcgcatcaatttccaagaggaagatcgtcgtttccggtgaggcggcaggacttcaaatcctgttgaggctgccagcagtctcgggtaggttcaactcctacgatcttccgccaCTCAattttattt < 1:62091‑M2/13‑1 (MQ=255) gcggaacaatatcaatccgtttaccaacgctatcgccaacatttaaacgcccaatattccgtataaaattaatggattatttttccgcttcacttgaatcgcacgagcttttgcgctaaagttcgcatcaatttccaagaggaagatcgtcgtttccggtgaggcggcaggacttcaaatcctgttgaggctgccagcagtctcgggtaggttcaactcctacgatcttccgccaCTCAATTTTATTTTTa > 1:664745‑M2/236‑251 (MQ=255) gaacaatatcaatccgtttaccaacgctatcgccaacatttaaacgcccaatattccgtataaaattaatggattatttttccgcttcacttgaatcgcacgagcttttgcgctaaagttcgcatcaatttccaagaggaagatcgtcgtttccggtgaggcggcaggacttcaaatcctgttgaggctgccagcagtctcgggtaggttcaactcctacgatcttccgccaCTCAATTTTATTTTTaaaa > 1:142991‑M2/233‑251 (MQ=255) aacaatatcaatccgtttaccaacgctatcgccaacatttaaacgcccaatattccgtataaaattaatggattatttttccgcttcacttgaatcgcacgagcttttgcgctaaagttcgcatcaatttccaagaggaagatcgtcgtttccggtgaggcggcaggacttcaaatcctgttgaggctgccagcagtctcgggtaggttcaactcctacgatcttccgccaCTCAATTTTATTTTTaaaaa < 1:263571‑M2/20‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |