| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | 1 | 513,143 | Δ1,462 bp | unknown | unknown | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | 1 | 514605 = | 0 (0.000) | intergenic (+266/‑472) | unknown/unknown | Integrase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
CGCCGATAGCGGAAAATGCGGAACAATATCAATCCGTTTACCAACGCTATCGCCAACATTTAAACGCCCAATATTCCGTATAAAATTAATGGATTATTTTTCCGCTTCACTTGAATCGCACGGGCTTTTGCGCTAAAGTTCGCATCAATTTCCAAGAGGAAGATCGTCGTTTCCGGTGAGGCGGCAGGACTTCAAATCCTGTTGAGGCTGCCAGCAGTCTCGGGTAGGTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 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AACAATATCAATCCGTTTACCAACGCTATCGCCAACATTTAAACGCCCAATATTCCGTATAAAATTAATGGATTATTTTTCCGCTTCACTTGAATCGCACGAGCTTTTGCGCTAAAGTTCGCATCAATTTCCAAGAGGAAGATCGTCGTTTCCGGTGAGGCGGCAGGACTTCAAATCCTGTTGAGGCTGCCAGCAGTCTCGGGTAGGTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAA < 1:263571/251‑1 ATATCAATCCGTTTACCAACGCTATCGCCAACATTTAAACGCCCAATATTCCGTATAAAATTAATGGATTATTTTTCCGCTTCACTTGAATCGCACGAGCTTTTGCGCTAAAGTTCGCATCAATTTCCAAGAGGAAGATCGTCGTTTCCGGTGAGGCGGCAGGACTTCAAATCCTGTTGAGGCTGCCAGCAGTCTCGGGTAGGTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACA > 1:235263/1‑250 TATCAATCCGTTTACCAACGCTATCGCCAACATTTAAACGCCCAATATTCCGTATAAAATTAATGGATTATTTTTCCGCTTCACTTGAATCGCACGAGCTTTTGCGCTAAAGTTCGCATCAATTTCCAAGAGGAAGATCGTCGTTTCCGGTGAGGCGGCAGGACTTCAACTCCTGTTGAGGCTGCCAGCAGTCTCGGGTAGGTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACA > 1:434694/1‑249 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1:430404/240‑1 CTTCAAATCCTGTTGAGGCTGCCAGCAGTCTCGGGTAGGTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTT > 1:612297/1‑251 CCTGTTGAGGCTGCCAGCAGTCTCGGGTAGGTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGG < 1:388140/225‑1 CTGTTGAGGCTGCCAGCAGTCTCGGGTAGGTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAAT > 1:523486/1‑251 GTTGAGGCTGCCAGCAGTCTCGGGTAGGTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGA > 1:341462/1‑251 GTTGAGGCTGCCAGCAGTCTCGGGTAGGTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGC < 1:178246/227‑1 TGCCAGCAGTCTCGGGTAGGTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCACTCCATTTTATTT > 1:479608/1‑57 GTCTCGGGTAGGTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTC > 1:531303/1‑250 GTCTCGGGTAGGTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGC > 1:565574/1‑211 GTCTCGGGTAGGTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGC > 1:764833/1‑211 GTCTCGGGTAGGTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACAT < 1:779062/156‑1 TCTCGGGTAGGTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTC < 1:414440/249‑1 CTCGGGTAGGTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTT > 1:357612/1‑251 CTCGGGTAGGTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTT > 1:888875/1‑251 TCGGGTAGGTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTA < 1:743330/251‑1 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GTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACAC > 1:67792/1‑250 GTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAA < 1:450339/210‑1 GTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCA < 1:430417/117‑1 CTCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATC > 1:565385/1‑153 cCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATC < 1:259621/250‑1 cCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATC < 1:29639/250‑1 TCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATC < 1:216554/251‑1 TCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATC < 1:831749/251‑1 TCCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATC < 1:799816/251‑1 CCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGA < 1:669995/248‑1 CCTACGATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATC < 1:671402/87‑1 ATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCACCGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCC > 1:426544/1‑250 ATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCC > 1:658052/1‑250 ATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCC > 1:529496/1‑250 ATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCC > 1:85162/1‑250 ATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGA > 1:533336/1‑242 ATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGA < 1:396153/242‑1 ATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAAC < 1:736411/197‑1 ATCTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCC > 1:259388/1‑116 CTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCA > 1:725714/1‑251 CTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATC < 1:730382/242‑1 CTTCCGCCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGA > 1:769188/1‑110 CCACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACC < 1:320175/250‑1 ACTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATC > 1:379757/1‑234 CGCCGATAGCGGAAAATGCGGAACAATATCAATCCGTTTACCAACGCTATCGCCAACATTTAAACGCCCAATATTCCGTATAAAATTAATGGATTATTTTTCCGCTTCACTTGAATCGCACGGGCTTTTGCGCTAAAGTTCGCATCAATTTCCAAGAGGAAGATCGTCGTTTCCGGTGAGGCGGCAGGACTTCAAATCCTGTTGAGGCTGCCAGCAGTCTCGGGTAGGTTCAACTCCTACGATCTTCCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/512891‑513142‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccgccaCTCAATTTTATTTTTAAAAAACACTTCATAAAATGACCGCACTTTTGACCGAAATTGATTGCCGACTATCAGCTTCGGTTGCAGCGTTGTCACCCGATAGAAGCCATCGCATGGTTACATTTGGCATTTGAATCCATTCACCCATTTTGTTGATGGCAACGGGCGACAGGTAGGCTATTGCTAAACTTTGAATTAATGAAAAACGGTTATTTTCCTTATAAACACCTATGATCTGCCCCCCAAAACC > 1/514605‑514851 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |