| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 148809 | 0 (0.000) | 68 (1.000) | 46/332 | 0.2 | 100% | intergenic (‑337/‑134) | unknown/unknown | Cold shock protein of CSP family/Phage protein |
| ? | 1 | 152196 = | 0 (0.000) | noncoding (31/76 nt) | unknown | tRNA‑Ala‑GGC | |||||
ACATTATGTCGGGAACGCCGTTATATGTGCTGCAAGAGTTGGGCGGGTGGAGTAAATCAGACACCGTGAGAAAATATGCGCATTTATCTGTTGAGCATTTACAAAACCACGCCAACAATGTTCAACTTTTTGCCACAAAATTGGCACAAACACAAAAAGGAAAAAACCTTATCAATCACTAACTAATTGATAAAGCTATAAAATTTGGTGGAGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTGAATGCGGTTTAATACGCGTTCGCGTCCGATGCCGACCAGGGTGACATCCATTGACGGCGATTGTCCCGCACCGGTAACGGCAACACGCAAAGGC > 1/151946‑152437 | gaatcttcaaagcgcaaatttaaaacttgaatgaggaagaaccgaaataactaacttactgaagtgattgtctagcgtggagcgcattagaacacacccgggaaatgaaaacaatctattttattgaatttacatgcttgtctaatcagctttcggttaaaacgaaaaaaatcctatcaatttttattgataggattttggaatttggtggagataatcgggatcgaaccgacgacctcttgaatgccatt > 1:698905‑M2/251‑251 (MQ=255) 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1:13070‑M2/113‑251 (MQ=255) ctaatcagctttcggttaaaacgaaaaaaatcctatcaatttttattgataggattttggaatttggtggagataatcgggatcgaaccgacgacctcttgaatgccatTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGt > 1:298671‑M2/110‑226 (MQ=255) ctaatcagctttcggttaaaacgaaaaaaatcctatcaatttttattgataggattttggaatttggtggagataatcgggatcgaaccgacgacctcttgaatgccatTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGc < 1:289575‑M2/142‑1 (MQ=255) atcagctttcggttaaaacgaaaaaaatcctatcaatttttattgataggattttggaatttggtggagataatcgggatcgaaccgacgacctcttgaatgccatTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAAt > 1:571384‑M2/107‑187 (MQ=255) gctttcggttaaaacgaaaaaaatcctatcaatttttattgataggattttggaatttggtggagataatcgggatcgaaccgacgacctcttgaatgccatTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATc > 1:845824‑M2/103‑201 (MQ=255) gctttcggttaaaacgaaaaaaatcctatcaatttttattgataggattttggaatttggtggagataatcgggatcgaaccgacgacctcttgaatgccatTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTGa > 1:795410‑M2/103‑251 (MQ=255) tcggttaaaacgaaaaaaatcctatcaatttttattgataggattttggaatttggtggagataatcgggatcgaaccgacgacctcttgaatgccatTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTGAATGc < 1:722271‑M2/153‑1 (MQ=255) ggttaaaacgaaaaaaatcctatcaatttttattgatagggttttggaatttggaggagataatcgggatcgaaccgacgacctcttgaatgccatTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAg < 1:814030‑M2/51‑1 (MQ=255) aacgaaaaaaatcctatcaatttttattgataggattttggaatttggtggagataatcgggatcgaaccgacgacctcttgaatgccatTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATc < 1:795419‑M2/99‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |