| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 148809 | 0 (0.000) | 68 (1.000) | 46/332 | 0.2 | 100% | intergenic (‑337/‑134) | unknown/unknown | Cold shock protein of CSP family/Phage protein |
| ? | 1 | 152196 = | 0 (0.000) | noncoding (31/76 nt) | unknown | tRNA‑Ala‑GGC | |||||
AGCATGAACCGCTAGCGATTTGACTTAAACAGAGATGGATAAATAGAATCTTCAAAGCGCAAATTTAAAACTTGAATGAGGAAGAACCGAAATAACTAACTTACTGAAGTGATTGTCTAGCGTGGAGCGCATTAGAACACACCCGGGAAATGAAAACAATCTATTTTATTGAATTTACATGCTTGTCTAATCAGCTTTCGGTTAAAACGAAAAAAATCCTATCAATTTTTATTGATAGGATTTTGGAATTTGGTGGAGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/148515‑148809‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aatttggtggagataatcgggatcgaaccgacgacctcttgaatgccatTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTGAATGCGGTTTAATACGCGTTCGCGTCCGATGCCGACCAGGGTGACATCCATTGACGGCGATTGTCCCGCACCGGTAACGGCAACACGCAAAGGC > 1/152196‑152437 AGCATGAACCGCTAGCGATTTGACTTAAACAGAGATGGATAAATAGAATCTTCAAAGCGCAAATTTAAAACTTGAATGAGGAAGAACCGAAATAACTAACTTACTGAAGTGATTGTCTAGCGTGGAGCGCATTAGAACACACCCGGGAAATGAAAACAATCTATTTTATTGAATTTACATGCTTGTCTAATCAGCTTTCGGTTAAAACGAAAAAAATCCTATCAATTTTTATTGATAGGATTTTGGAATTT > 1:773045/1‑251 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ATTTTATTGAATTTACATGCTTGTCTAATCAGCTTTCGGTTAAAACGAAAAAAATCCTATCAATTTTTATTGATAGGATTTTGGAATTTGGTGGAGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTT > 1:187009/1‑251 ATTTTATTGAATTTACATGCTTGTCTAATCAGCTTTCGGTTAAAACGAAAAAAATCCTATCAATTTTTATTGATAGGATTTTGGAATTTGGTGGAGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTT > 1:434038/1‑251 ATTTTATTGAATTTACATGCTTGTCTAATCAGCTTTCGGTTAAAACGAAAAAAATCCTATCAATTTTTATTGATAGGATTTTGGAATTTGGTGGAGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACT > 1:330512/1‑151 ATTGAATTTACATGCTTGTCTAATCAGCTTTCGGTTAAAACGAAAAAAATCCTATCAATTTTTATTGATAGGATTTTGGAATTTGGTGGAGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCG > 1:865656/1‑251 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1:13070/1‑251 TGTCTAATCAGCTTTCGGTTAAAACGAAAAAAATCCTATCAATTTTTATTGATAGGATTTTGGAATTTGGTGGAGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCC < 1:179186/141‑1 TGTCTAATCAGCTTTCGGTTAAAACGAAAAAAATCCTATCAATTTTTATTGATAGGATTTTGGAATTTGGTGGAGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTG < 1:431275/131‑1 CTAATCAGCTTTCGGTTAAAACGAAAAAAATCCTATCAATTTTTATTGATAGGATTTTGGAATTTGGTGGAGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGC < 1:289575/251‑1 CTAATCAGCTTTCGGTTAAAACGAAAAAAATCCTATCAATTTTTATTGATAGGATTTTGGAATTTGGTGGAGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGT > 1:298671/1‑226 ATCAGCTTTCGGTTAAAACGAAAAAAATCCTATCAATTTTTATTGATAGGATTTTGGAATTTGGTGGAGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAAT > 1:571384/1‑187 GCTTTCGGTTAAAACGAAAAAAATCCTATCAATTTTTATTGATAGGATTTTGGAATTTGGTGGAGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTGA > 1:795410/1‑251 GCTTTCGGTTAAAACGAAAAAAATCCTATCAATTTTTATTGATAGGATTTTGGAATTTGGTGGAGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATC > 1:845824/1‑201 TCGGTTAAAACGAAAAAAATCCTATCAATTTTTATTGATAGGATTTTGGAATTTGGTGGAGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTGAATGC < 1:722271/251‑1 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AATTTGGTGGAGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTGAATGCGGTTTAATACGCGTTCGCGTCCGATGCCGACCAGGGTGACATCCATTG < 1:367864/250‑1 AGATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTGAATGCGGTTTAATACGCGTTCGCGTCCGATGCCGACCAGGGTGACATCCATTGACGGCGATTGT > 1:758763/1‑251 GATAATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTGAATGCGGTTTAATACGCGTTCGCGTCCGATGCCGACCAGGGAGACATCCATTGACGGCGATTGT > 1:698080/1‑250 AATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTGAATGCGGTTTAATACGCGTTCGCGTCCGATGCCGACCAGGGTGACATCCATTGACGGCGATTGTCCCG > 1:570582/1‑251 AATCGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTGAATGCGGTTTAATACGCGTTCGCGTCCGATGCCGACCAGGGTGACATCCATTGACGGCGATTGTCC > 1:119935/1‑249 CGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTGAATGCGGTTTAATACGCGTTCGCGTCCGATGCCGACCAGGGTGACATCCATTGACGGCGATTGTCCCGCAC < 1:821069/251‑1 CGGGATCGAACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTGAATGCGGTTTAATACGCGTTCGCGTCCGATGCCGACCAGGGTGACATCCATTGACGGCGATTGTCCCGCAC < 1:442316/251‑1 ACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTGAATGCGGTTTAATACGCGTTCGCGTCCGATGCCGACCAGGGTAACATCCATTGACGGCGATTGTCCCGCACCGGTAACGG > 1:74244/1‑251 ACCGACGACCTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGG > 1:550449/1‑59 CTCTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTG < 1:658803/162‑1 CTTGAATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTGAATGCGGTTTAATACGCGTTCGCGTCCGATGCCGACCAGGGTGACATCCATTGACGGCGATTGTCCCGCACCGGTAACGGCAACACGCAAA > 1:80422/1‑251 AATGCCATTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTGAATGCGGTTTAATACGCGTTCGCGTCCGATGCCGACCAGGGTGACATCCATTGACGGCGATTGTCCCGCACCGGTAACGGCAACACGCAAAGGC < 1:329620/250‑1 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1/148515‑148809‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aatttggtggagataatcgggatcgaaccgacgacctcttgaatgccatTCAAGCGCTCTCCCAACTGAGCTATATCCCCGTAGGTGGCGGCTATAATAGATTCCGACCCTTTGTCTGTCAATATTAAATTTTCAATTCAATGTTATCAGATTAAATATTAAGCGTTTTGCGCTTTAATAAAATCAATGGCACGTTGAATGCGGTTTAATACGCGTTCGCGTCCGATGCCGACCAGGGTGACATCCATTGACGGCGATTGTCCCGCACCGGTAACGGCAACACGCAAAGGC > 1/152196‑152437 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |