| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,173,410 | Δ41 bp | [unknown] | [unknown] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1173367 | 1173407 | 41 | 73 [0] | [0] 74 | unknown | Oxygen‑insensitive NADPH nitroreductase (EC 1.‑.‑.‑) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1173408 = | 0 (0.000) | 62 (0.880) | 47/344 | 0.3 | 100% | coding (703/705 nt) | unknown | Oxygen‑insensitive NADPH nitroreductase (EC 1.‑.‑.‑) |
| ? | 1 | = 1173366 | 0 (0.000) | coding (661/705 nt) | unknown | Oxygen‑insensitive NADPH nitroreductase (EC 1.‑.‑.‑) | |||||
TTGCCTGCCGATGGTGGGAATGTGTTTGGGCTATCCGGATCAGGATCCGCCGAGCAAGCCACGCCTGCCGAAAGAAACCCTGTTTTTTGAAAACCGTTATCAGCCGTTGGATACCACCAAACTGGACGAATATAACGCGACGGTTGCTGACTATTATTGTCAGCGCAGCAACATTGACATGGATTGGTCGCGCAATGTGATAAAAAGTTTGGATAAGCCGATTCGTCCGAACGTATTGGCTTAAAAAGTTTGGATAAGCCGATTCGTCCGAACGTATTGGCTTATTTGCAGCAACAGGGCTTTATTAAAAAATAATTTTGTATGAAATTCTTAATGTTGTGCCGTGAGCCGCGTTTATATAGCTGTCAACGGCTCAAGGATGCGGCAGAGGAAAACGGGCACCAAATGGATATTTTGGATCCGAATCGTTGCCTGATAAAACTCCAAAAAAATCCACCGCACTTTGTGTTGTATTATCAAGCGGACGCGGAG > 1/1173167‑1173658 | gaaatggaagcagtgggcaaattgctcaatctgccggaacattgcctgccgatggtgggaatgtgtttgggctatccggatcaggatccgccgagcaagccacgcctgccgaaagaaaccctgttttttgaaaaccgttatcagccgttggataccaccaaactggacgaatataacgcgacggttgctgactattattgtcagcgcagcaacattgacatggattggtcgcgcaatgtgaTAAAAAGttt < 1:6730‑M1/10‑1 (MQ=255) tggaagcagtgggcaaattgctcaatctgccggaacattgcctgccgatggtgggaatgtgtttgggctatccggatcaggatccgccgagcaagccacgcctgccgaaagaaaccctgttttttgaaaaccgttatcagccgttggataccaccaaactggacgaatataacgcgacggttgctgactattattgtcagcgcagcaacattgacatggattggtcgcgcaatgtgaTaa < 1:901731‑M1/3‑1 (MQ=255) gccggaacattgcctgccgatggtgggaatgtgtttgggctatccggatcaggatccgccgagcaagccacgcctgccgaaagaaaccctgttttttgaaaaccgttatcagccgttggataccaccaaactggacgaatataacgcgacggttgctgactattattgtcagcgcagcaacattgacatggattggtcgcgcaatgtgaTAAAAAGTTTGGATAAGCCGATTCGTCCGAACGTATTGGCtt < 1:195640‑M1/42‑1 (MQ=255) aacattgcctgccgatggtgggaatgtgtttgggctatccggatcaggatccgccgagcaagccacgcctgccgaaagaaaccctgttttttgaaaaccgttatcagccgttggataccaccaaactggacgaatataacgcgacggttgctgactattattgtcagcgcagcaacattgacatggattggtcgcgcaatgtgaTAAAAAGTTTGGATAAGCCGATTCGTCCGAACGTATTGGCTTAttt > 1:786230‑M1/205‑250 (MQ=255) 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1:894975‑M1/190‑194 (MQ=255) tggtgggaatgtgtttgggctatccggatcaggatccgccgagcaagccacgcctgccgaaagaaaccctgttttttgaaaaccgttatcagccgttggataccaccaaactggacgaatataacgcgacggttgctgactattattgtcagcgcagcaacattgacatggattggtcgcgcaatgtgaTAAAAAGTTTGGATAAGCCGATTCGTCCGAACGTATTGGCTTATTTGCAGCAACAGGGCttt < 1:171924‑M1/62‑1 (MQ=255) gtgggaatgtgtttgggctatccggatcaggatccgccgagcaagccacgcctgccgaaagaaaccctgttttttgaaaaccgttatcagccgttggataccaccaaactggacgaatataacgcgacggttgctgactattattgtcagcgcagcaacattgacatggattggtcgcgcaatgtgaTAAAAAGTTTGGATAAGCCGATTCGTCCGAACGTATTGGCTTATTTGCAGCAACAGGGCTttat < 1:111121‑M1/64‑1 (MQ=255) tgggaatgtgtttgggctatccggatcaggatccgccgagcaagccacgcctgccgaaagaaaccctgttttttgaaaaccgttatcagccgttggataccaccaaactggacgaatataacgcgacggttgctgactattattgtcagcgcagcaacattgacatggattggtcgcgcaatgtgaTAAAAAGTTTGGATAAGCCGATTCGTCCGAACGTATTGGCTTATTTGCAGCAACAGGGCTttat > 1:218239‑M1/187‑250 (MQ=255) 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ccgccgagcaagccacgcctgccgaaagaaaccctgttttttgaaaaccgttatcagccgttggataccaccaaactggacgaatataacgcgacggttgctgactattattgtcagcgcagcaacattgacatggattggtcgcgcaatgtgaTAAAAAGTTTGGATAAGCCGATTCGTCCGAACGTATTGGCTTATTTGCAGCAACAGGGCTTTATTAAAAAATAATTTTGTATGAAATTCTTAAtgtt < 1:1903‑M1/97‑1 (MQ=255) caagccacgcctgccgaaagaaaccctgttttttgaaaaccgttatcagccgttggataccaccaaactggacgaatataacgcgacggttgctgactattattgtcagcgcagcaacattgacatggattggtcgcgcaatgtgaTAAAAAGTTTGGATAAGCCGATTCGTCCGAACGTATTGGCTTATTTGCAGCAACAGGGCTTTATTAAAAAATAATTTTGTATGAAATTCTTAATGTTGTGCCg > 1:266766‑M1/147‑249 (MQ=255) caagccacgcctgccgaaagaaaccctgttttttgaaaaccgttatcagccgttggataccaccaaactggacgaatataacgcgacggttgctgactattattgtcagcgcagcaacattgacatggattggtcgcgcaatgtgaTAAAAAGTTTGGATAAGCCGATTCGTCCGAACGTATTGGCTTATTTGCAGCAACAGGGCTTTATTAAAAAATAATTTTGTATGAAATTCTTAATGTTGTGCCg > 1:347941‑M1/147‑249 (MQ=255) 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1:312610‑M1/236‑1 (MQ=255) tcgcgcaatgtgaTAAAAAGTTTGGATAAGCCGATTCGTCCGAACGTATTGGCTTATTTGCAGCAACAGGGCTTTATTAAAAAATAATTTTGTATGAAATTCTTAATGTTGTGCCGTGAGCCGCGTTTATATAGCTGTCAACGGCTCAAGGATGCGGCAGAGGAAAACGGGCACCAAATGGATATTTTGGATCCGAATCGTTGCCTGATAAAACTCCAAAAAAATCCACCGCACTTTGTGTTGTATTATCa > 1:304400‑M1/14‑251 (MQ=255) caatgtgaTAAAAAGTTTGGATAAGCCGATTCGTCCGAACGTATTGGCTTATTTGCAGCAACAGGGCTTTATTAAAAAATAATTTTGTATGAAATTCTTAATGTTGTGCCGTGAGCCGCGTTTATATAGCTGTCAACGGCTCAAGGATGCGGCAGAGGAAAACGGGCACCAAATGGATATTTTGGATCCGAATCGTTGCCTGATAAAACTCCAAAAAAATCCACCGCACTTTGTGTTGTATTATCAAGCgg > 1:163182‑M1/9‑251 (MQ=255) atgtgaTAAAAAGTTTGGATAAGCCGATTCGTCCGAACGTATTGGCTTATTTGCAGCAACAGGGCTTTATTAAAAAATAATTTTGTATGAAATTCTTAAtgt > 1:64003‑M1/7‑102 (MQ=255) atgtgaTAAAAAGTTTGGATAAGCCGATTCGTCCGAACGTATTGGCTTATTTGCAGCAACAGGGCTTTATTAAAAAATAATTTTGTATGAAATTCTTAATGTTGTGCCGTGAGCCGCGTTTATATAGCTGTCAACGGCTCAAGGATGCGGCAGAGGAAAACGGGCACCAAATGGATATTTTGGATCCGAATCGTTGCCTGATAAAACTCCAAAAAAATCCACCGCACTTTGTGTTGTATTATCAAGCGGa < 1:419187‑M1/244‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |