| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,173,410 | Δ41 bp | [unknown] | [unknown] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1173367 | 1173407 | 41 | 73 [0] | [0] 74 | unknown | Oxygen‑insensitive NADPH nitroreductase (EC 1.‑.‑.‑) |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1173408 = | 0 (0.000) | 62 (0.880) | 47/344 | 0.3 | 100% | coding (703/705 nt) | unknown | Oxygen‑insensitive NADPH nitroreductase (EC 1.‑.‑.‑) |
| ? | 1 | = 1173366 | 0 (0.000) | coding (661/705 nt) | unknown | Oxygen‑insensitive NADPH nitroreductase (EC 1.‑.‑.‑) | |||||
GAAATGGAAGCAGTGGGCAAATTGCTCAATCTGCCGGAACATTGCCTGCCGATGGTGGGAATGTGTTTGGGCTATCCGGATCAGGATCCGCCGAGCAAGCCACGCCTGCCGAAAGAAACCCTGTTTTTTGAAAACCGTTATCAGCCGTTGGATACCACCAAACTGGACGAATATAACGCGACGGTTGCTGACTATTATTGTCAGCGCAGCAACATTGACATGGATTGGTCGCGCAATGTGATAAAAAGTTTGGATAAGCCGATTCGTCCGAACGTATTGGCTTAAAAAGTTTGGATAAGCCGATTCGTCCGAACGTATTGGCTTATTTGCAGCAACAGGGCTTTATTAAAAAATAATTTTGTATGAAATTCTTAATGTTGTGCCGTGAGCCGCGTTTATATAGCTGTCAACGGCTCAAGGATGCGGCAGAGGAAAACGGGCACCAAATGGATATTTTGGATCCGAATCGTTGCCTGATAAAACTCCAAAA > 1/1173126‑1173615 | gAAATGGAAGCAGTGGGCAAATTGCTCAATCTGCCGGAACATTGCCTGCCGATGGTGGGAATGTGTTTGGGCTATCCGGATCAGGATCCGCCGAGCAAGCCACGCCTGCCGAAAGAAACCCTGTTTTTTGAAAACCGTTATCAGCCGTTGGATACCACCAAACTGGACGAATATAACGCGACGGTTGCTGACTATTATTGTCAGCGCAGCAACATTGACATGGATTGGTCGCGCAATGTGAtaaaaagttt < 1:6730‑M2/251‑11 (MQ=255) tGGAAGCAGTGGGCAAATTGCTCAATCTGCCGGAACATTGCCTGCCGATGGTGGGAATGTGTTTGGGCTATCCGGATCAGGATCCGCCGAGCAAGCCACGCCTGCCGAAAGAAACCCTGTTTTTTGAAAACCGTTATCAGCCGTTGGATACCACCAAACTGGACGAATATAACGCGACGGTTGCTGACTATTATTGTCAGCGCAGCAACATTGACATGGATTGGTCGCGCAATGTGAtaa < 1:901731‑M2/240‑4 (MQ=255) gCCGGAACATTGCCTGCCGATGGTGGGAATGTGTTTGGGCTATCCGGATCAGGATCCGCCGAGCAAGCCACGCCTGCCGAAAGAAACCCTGTTTTTTGAAAACCGTTATCAGCCGTTGGATACCACCAAACTGGACGAATATAACGCGACGGTTGCTGACTATTATTGTCAGCGCAGCAACATTGACATGGATTGGTCGCGCAATGTGAtaaaaagtttggataagccgattcgtccgaacgtattggctt < 1:195640‑M2/251‑43 (MQ=255) aaCATTGCCTGCCGATGGTGGGAATGTGTTTGGGCTATCCGGATCAGGATCCGCCGAGCAAGCCACGCCTGCCGAAAGAAACCCTGTTTTTTGAAAACCGTTATCAGCCGTTGGATACCACCAAACTGGACGAATATAACGCGACGGTTGCTGACTATTATTGTCAGCGCAGCAACATTGACATGGATTGGTCGCGCAATGTGAtaaaaagtttggataagccgattcgtccgaacgtattggcttattt > 1:786230‑M2/1‑204 (MQ=255) 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1:220890‑M2/1‑107 (MQ=255) gTTATCAGCCGTTGGATACCACCAAACTGGACGAATATAACGCGACGGTTGCTGACTATTATTGTCAGCGCAGCAACATTGACATGGATTGGTCGCGCAATGTGAtaaaaagtttggataagccgattcgtccgaacgtattggcttatttgcagcaacagggctttattaaaaaataattttgtatgaaattcttaatgttgtgccgtgagccgcgtttatatagctgtcaacggctcaaggatgcggca < 1:286607‑M2/251‑147 (MQ=255) gCCGTTGGATACCACCAAACTGGACGAATATAACGCGACGGTTGCTGACTATTATTGTCAGCGCAGCAACATTGACATGGATTGGTCGCGCAATGTGAtaaaaagtttggataagccgattcgtccgaacgtattggcttatttgcagcaacagggctttattaaaaaataattttgtatgaaattcttaatgttgtgccgtgagc < 1:329688‑M2/206‑109 (MQ=255) ccGTTGGATACCACCAAACTGGACGAATATAACGCGACGGTTGCTGACTATTATTGTCAGCGCAGCAACATTGACATGGATTGGTCGCGCAATGTGAtaaaaagtttggataagccgattcgtccgaacgtattggcttatttgcagcaacag < 1:635404‑M2/153‑57 (MQ=255) ggATACCACCAAACTGGACGAATATAACGCGACGGTTGCTGACTATTATTGTCAGCGCAGCAACATTGACATGGATTGGTCGCGCAATGTGAtaaaaagtttggataagccgattcgtccgaacgtattggcttatttgcagcaacagggctttattaaaaaataattttgtatgaaattcttaatgttgtgccgtgagccgcgtttatatagctgtcaacggctcaaggatgcggcagaggaaaacggg < 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1/1173126‑1173615 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |