| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 263,387 | (A)6→3 | coding (298‑300/630 nt) | unknown ← | LSU ribosomal protein L3p (L3e) |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 263387 | 263389 | 3 | 98 [0] | [0] 99 | unknown | LSU ribosomal protein L3p (L3e) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 263386 | 0 (0.000) | 98 (1.130) | 68/424 | 0.1 | 100% | coding (301/630 nt) | unknown | LSU ribosomal protein L3p (L3e) |
| ? | 1 | 263390 = | 0 (0.000) | coding (297/630 nt) | unknown | LSU ribosomal protein L3p (L3e) | |||||
TCTACACGAACAACTTCAAGTGATTGAACGGTTACACGCTCATTACCTAAGTGTCCTGCCATTTTTTTGCCTTTAAACACACGGCCCGGAGTTTGGTTTTGACCAATAGAACCAAGGACACGATGTGATAAAGAGTTACCGTGGGTAGCATCTTGAGTGCGGAAGTTCCAACGTTTAACACCACCTTGGAAGCCTTTACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGGCTCGCTTTTTTAGAACCGGTTGTAACTTGAACTGCAGTATAGCCATCGTTTTCAAGAGTTTTAACTTGAGTTACGCGGTTGGCTTCGATTTCGATAACGGTAACCGGTACTGACACGCCGTCTTCAT > 1/263145‑263640 | gcatctacacgaacaacttcaagtgattgaacggttacacgctcattacctaagtgtcctgccatttttttgcctttaaacacacggcccggagtttggttttgaccaatagaaccaaggacacgatgtgataaagagttaccgtgggtagcatcttgagtgcggaagttccaacgtttaacaccaccttggaagcctttacctttagatgtaccggtaacatcgacttttttaacatctgcaaaGATGt > 1:886922‑M2/246‑250 (MQ=255) 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1:838784‑M2/112‑1 (MQ=255) atagaaccaaggacacgatgtgataaagagttaccgtgggtagcatcttgagtgcggaagttccaacgtttaacaccaccttggaagcctttacctttagatgtaccggtaacatcgacttttttaacatctgcaaaGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCtt > 1:143225‑M2/138‑251 (MQ=255) atagaaccaaggacacgatgtgataaagagttaccgtgggtagcatcttgagtgcggaagttccaacgtttaacaccaccttggaagcctttacctttagatgtaccggtaacatcgacttttttaacatctgcaaaGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCtt > 1:663808‑M2/138‑251 (MQ=255) gaaccaaggacacgatgtgataaagagttaccgtgggtagcatcttgagtgcggaagttccaacgtttaacaccaccttggaagcctttacctttagatgtaccggtaacatcgacttttttaacatctgcaaaGa > 1:739845‑M2/135‑136 (MQ=255) 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1:403652‑M2/119‑251 (MQ=255) gtgataaagagttaccgtgggtagcatcttgagtgcggaagttccaacgtttaacaccaccttggaagcctttacctttagatgtaccggtaacatcgacttttttaacatctgcaaaGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGGCTCGCtttt > 1:852265‑M2/119‑251 (MQ=255) gataaagagttaccgtgggtagcatcttgagtgcggaagttccaacgtttaacaccaccttggaagcctttacctttagatgtaccggtaacatcgacttttttaacatctgcaaag > 1:390359‑M2/117‑117 (MQ=255) gataaagagttaccgtgggtagcatcttgagtgcggaagttccaacgtttaacaccaccttggaagcctttacctttagatgtaccggtaacatcgacttttttaacatctgcaaaGATGTCAACATTAAttt > 1:778922‑M2/117‑133 (MQ=255) gataaagagttaccgtgggtagcatcttgagtgcggaagttccaacgtttaacaccaccttggaagcctttacctttagatgtaccggtaacatcgacttttttaacatctgcaaaGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAg > 1:95151‑M2/117‑232 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |