| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 263,387 | (A)6→3 | coding (298‑300/630 nt) | unknown ← | LSU ribosomal protein L3p (L3e) |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 263387 | 263389 | 3 | 98 [0] | [0] 99 | unknown | LSU ribosomal protein L3p (L3e) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 263386 | 0 (0.000) | 98 (1.130) | 68/424 | 0.1 | 100% | coding (301/630 nt) | unknown | LSU ribosomal protein L3p (L3e) |
| ? | 1 | 263390 = | 0 (0.000) | coding (297/630 nt) | unknown | LSU ribosomal protein L3p (L3e) | |||||
GCATCTACACGAACAACTTCAAGTGATTGAACGGTTACACGCTCATTACCTAAGTGTCCTGCCATTTTTTTGCCTTTAAACACACGGCCCGGAGTTTGGTTTTGACCAATAGAACCAAGGACACGATGTGATAAAGAGTTACCGTGGGTAGCATCTTGAGTGCGGAAGTTCCAACGTTTAACACCACCTTGGAAGCCTTTACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/263142‑263386‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGGCTCGCTTTTTTAGAACCGGTTGTAACTTGAACTGCAGTATAGCCATCGTTTTCAAGAGTTTTAACTTGAGTTACGCGGTTGGCTTCGATTTCGATAACGGTAACCGGTACTGACACGCCGT > 1/263390‑263634 GCATCTACACGAACAACTTCAAGTGATTGAACGGTTACACGCTCATTACCTAAGTGTCCTGCCATTTTTTTGCCTTTAAACACACGGCCCGGAGTTTGGTTTTGACCAATAGAACCAAGGACACGATGTGATAAAGAGTTACCGTGGGTAGCATCTTGAGTGCGGAAGTTCCAACGTTTAACACCACCTTGGAAGCCTTTACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGT > 1:886922/1‑250 TACACGAACAACTTCAAGTGATTGAACGGTTACACGCTCATTACCTAAGTGTCCTGCCATTTTTTTGCCTTTAAACACACGGCCCGGAGTTTGGTTTTGACCAATAGAACCAAGGACACGATGTGATAAAGAGTTACCGTGGGTAGCATCTTGAGTGCGGAAGTTCCAACGTTTAACACCACCTTGGAAGCCTTTACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGTCAACAT < 1:141172/251‑1 ACGAACAACTTCAAGTGATTGAACGGTTACACGCTCATTACCTAAGTGTCCTGCCATTTTTTTGCCTTTAAACACACGGCCCGGAGTTTGGTTTTGACCAATAGAACCAAGGACACGATGTGATAAAGAGTTACCGTGGGTAGCATCTTGAGTGCGGAAGTTCCAACGTTTAACACCACCTTGGAAGCCTTTACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGTCAACATTAA < 1:707418/251‑1 TGATTGAACGGTTACACGCTCATTACCTAAGTGTCCTGCCATTTTTTTGCCTTTAAACACACGGCCCGGAGTTTGGTTTTGACCAATAGAACCAAGGACACGATGTGATAAAGAGTTACCGTGGGTAGCATCTTGAGTGCGGAAGTTCCAACGTTTAACACCACCTTGGAAGCCTTTACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGTCAAC > 1:710066/1‑231 ATTGAACGGTTACACGCTCATTACCTAAGTGTCCTGCCATTTTTTTGCCTTTAAACACACGGCCCGGAGTTTGGTTTTGACCAATAGAACCAAGGACACGATGTGATAAAGAGTTACCGTGGGTAGCATCTTGAGTGCGGAAGTTCCAACGTTTAACACCACCTTGGAAGCCTTTACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTG > 1:52560/1‑251 ATTGAACGGTTACACGCTCATTACCTAAGTGTCCTGCCATTTTTTTGCCTTTAAACACACGGCCCGGAGTTTGGTTTTGACCAATAGAACCAAGGACACGATGTGATAAAGAGTTACCGTGGGTAGCATCTTGAGTGCGGAAGTTCCAACGTTTAACACCACCTTGGAAGCCTTTACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTG < 1:756875/251‑1 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CGTTTAACACCACCTTGGAAGCCTTTACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGGCTCGCTTTTTTAGAACCGGTTGTAACTTGAACTGCAGTATAGCCATCGTTTTCAAG < 1:549926/251‑1 CGTTTAACACCACCTTGGAAGCCTTTACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGGCTCGCTTTTTTAGAACCGGTTGTAACTTGAACTGCAGTATAGCCA < 1:173448/240‑1 CGTTTAACACCACCTTGGAAGCCTTTACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGC > 1:266789/1‑183 GTTTAACACCACCTTGGAAGCCTTTACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGG < 1:731170/194‑1 GTTTAACACCACCTTGGAAGCCTTTACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTC > 1:676188/1‑188 TAACACCACCTTGGAAGCCTTTACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGGCTCGCTTTTTTAGAACCGGTTGTAACTTGAACTGCAGTATAGCCATCGTTTTCAAGAGTT > 1:835866/1‑251 AACACCACCTTGGAAGCCTTTACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGGCTCGCTTTTTTAGAACCGGTTGTAACTTGAACTGCAGTATAGCCATCGTTTTCAAGAGTTT > 1:658375/1‑251 ACCTTGGAAGCCTTTACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGG > 1:73199/1‑184 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CCTTTACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGGCTCGCTTTTTTAGAACCGGTTGTAACTTGAACTGCAGTATAG > 1:307832/1‑216 CTTTACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGGCTCGCTTTTTTAGAACCGGTTGTAACTTGAACTGCAGTATAGCCATCGTTTTCAAGAGTTTTAACTTGAGTTACGCGG < 1:403902/251‑1 ACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGGCTCGCTTTTTTAGAACCGGTTGTAACTTGAACTGCAGTATAGCCATCGTTTTCAAGAGTTTTAACTTGAGTTACGCGGTTGG > 1:404504/1‑251 ACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGGCTCGCTTTTTTAGAACCGGTTGTAACTTGAACTGCAGTATAGCCATCGTTTTCAAGAGTTTTAACTTGAGTTACGCGGTTGG > 1:859698/1‑251 ACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGGCTCGCTTTTTTAGAACCGGTTGTAACTTGAACTGCAGTATAGCCATCGTTTTCAAGAGTTTTAACTTGAGTTACGCGGTTGG > 1:592831/1‑251 CCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCT > 1:394116/1‑157 CCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATG > 1:596162/1‑143 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TAACATCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGGCTCGCTTTTTTAGAACCGGTTGTAACTTGAACTGCAGTATAGCCATCGTTTTCAAGAGTTTTAACTTGAGTTACGCGGTTGGCTTCGATTTCGATAACGGTAACCGGTACTGAC < 1:871921/251‑1 AACATCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGGCTCGCTTTTTTAGAACCGGTTGTAACTTGAACTGCAGTATAGCCATCGTTTTCAAGAGTTTTAACTTGAGTTACGCGGTTGGCTTCGATTTCGATAACGGTAACCGGTACTGACA < 1:295594/251‑1 AACATCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGGCTCGCTTTTTTAGAACCGGTTGTAACTTGAACTGCAGTATAGCCATCGTTTTCAAGAGTTTTAACTTGAGTTACGCGGTTGGCTTCGATTTCGATAACGGTAACCGGTACTGACA < 1:889485/251‑1 TCTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGGCTCGCTTTTTTAGAACCGGTTGTAACTTGAACTGCAGTATAGCCATCGTTTTCAAGAGTTTTAACTTGAGTTACGCGGTTGGCTTCGATTTCGATAACGGTAACCGGT > 1:675504/1‑240 CTGCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGGCTCGCTTTTTTAGAACCGGTTGTAACTTGAACTGCAGTATAGCCATCGTTTTCAAG > 1:208133/1‑187 GCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGGCTCGCTTTTTTAGAACCGGTTGTAACTTGAACTGCAGTATAGCCATCGTTTTCAAGAGTTTTAACTTGAGTTACGCGGTTGGCTTCGATTTCGATAACGGTAACCGGTACTGACACGCCGT > 1:835620/1‑250 GCAAAGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGGCTCGCTTTTTTAGAACCGGTTGTAACTTGAACTGCAGTATAGCCA > 1:808130/1‑174 GCATCTACACGAACAACTTCAAGTGATTGAACGGTTACACGCTCATTACCTAAGTGTCCTGCCATTTTTTTGCCTTTAAACACACGGCCCGGAGTTTGGTTTTGACCAATAGAACCAAGGACACGATGTGATAAAGAGTTACCGTGGGTAGCATCTTGAGTGCGGAAGTTCCAACGTTTAACACCACCTTGGAAGCCTTTACCTTTAGATGTACCGGTAACATCGACTTTTTTAACATCTGCAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/263142‑263386‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aaaGATGTCAACATTAATTTCTTGACCTAAAGTGAATTCTTCACCTTCAGTACGAAATTCCCATAAACCGCGACCGGCTTCAACACCGGCTTTCACGAAATGACCCGCTTCAGGCTTAGTCACACGGCTCGCTTTTTTAGAACCGGTTGTAACTTGAACTGCAGTATAGCCATCGTTTTCAAGAGTTTTAACTTGAGTTACGCGGTTGGCTTCGATTTCGATAACGGTAACCGGTACTGACACGCCGT > 1/263390‑263634 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |