| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 103662 | 0 (0.000) | 43 (0.490) +GGG |
27/424 | 1.8 | 100% | intergenic (+2/‑242) | unknown/unknown | Transcriptional regulator/ATP‑dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP (EC 3.4.21.92) |
| ? | 1 | = 601411 | 0 (0.000) | intergenic (+13/+6) | unknown/unknown | hypothetical protein/Phage repressor protein cI | |||||
CTTTCACAGCGCAATGTAACCAACCACTTAATATTAGAAATTGATAACAGGTTAGGACTTAAGTTGAATTAAACGGAATTAAGCGGGACAGAATCAATGAAATAAAGGGCTGAAAGAAATTTTGGCCCTTTTTTATTGGGTGGTTTTGTCGTTAAAGTTAGTTTTAGAAAAAAAGTGGCTAAAATCTAAAAAGGGCGGTTTTAGCCACTTAATTGTAGAAAAACAAAAAGGCGTTTAAAAAACGTTTAAAGACCGTTTAAATTACGCTTTTGCCGATGTAGGCAACTTGTCCGATTATCTCCAATTTGTCCGCTTCCTCTTTGGTTAGCGTTATCGGGGCGTACTCTTCTTTGTTGTCTGAAATGAGCTCTATGCCGTTCCAGTTGAGTTTTACGCGCTTAACCCATACGCTTTCGCGGTTTTGCACTAAATAGATTTTATCGCCCTTGATCTCTTTTTTAGAGAGGTCAACCAACATCTGATCGCCGTCATCAATGG > 1/601161‑601658 | aggattgtccgtccTGTAACCAACCACTTAATATTAGAAATTGATAACAGGTTAGGACT‑AAGTTGAATTAAACGGAATTAAGCGGGGCAGAATCAATGAAATAAAGGGCTGAAAGAAGTTTTGGCCCTTTTTTATTGGGTGGTTTTGTCGTTAAAGTTAGTTTTAGAAAAAAAGTGGCTAAAATCTAAAAAGGGCGGTTTTAGCCACTTAATTGTAGAAAAACAAAAAGGCGTTTAAAAAACGTTTAAAg < 1:226944‑M1/236‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |