| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 103662 | 0 (0.000) | 43 (0.490) +GGG |
27/424 | 1.8 | 100% | intergenic (+2/‑242) | unknown/unknown | Transcriptional regulator/ATP‑dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP (EC 3.4.21.92) |
| ? | 1 | = 601411 | 0 (0.000) | intergenic (+13/+6) | unknown/unknown | hypothetical protein/Phage repressor protein cI | |||||
CAATCGACGACGGCGATCAGATGTTAGTGGATTTATCAAAGAAAGAGATTAAAGGCGACAAAATCTATCTGGTGCAGAACGGGGCCAGCGTATGGGTTAAGCGGGTTAAAATCAACTGGGACGGGTTAGAGCTCATTTCAGACAATAGAGAGGAATACCCACCCATTCAATTAAGCCAAAGC‑GAAGCCGAAACCCTGCAAATCATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/103419‑103662‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAATTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGTCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTATCAATTTCTAATATTAAGTGGTTGGTTACATTG < 1/601411‑601172 ||| CAATCGACGACGGCGATCAGATATTAGTGGATTTATCAAAGAAAGAGATTAAAGGCGATAAAATCTATTTGGTACAGAACGGCGCCAGCGTATGGGTTAAGCGCGTTAAAATCAATTGGGACGGGTTAGAGCTCATTTCAGACAATAAAGAAGAATATCCACCAATCCAACTAA‑CCCAAGCTGAAGCCGAAAACCTGCAAATCATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTT > 1:881059/1‑251 ATCGACGACGGCGATCAGATATTAGTGGATTTATCAAAGAAAGAGATTAAAGGCGATAAAATCTATTTGGTACAGAACGGCGCCAGCGTATGGGTTAAGCGCGTTAAAATCAATTGGGACGGGTTAGAGCTCATTTCAGACAATAAAGAAGAATATCCACCAATCCAACTAA‑CCCAAGCTGAAGCCGAAAACCTGCAAATCATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAA > 1:684641/1‑251 GGCGATCAGATATTAGTGGATTTATCAAAGAAAGAGATTAAAGGCGATAAAATCTATTTGGTACAGAACGGCGCCAGCGTATGGGTTAAGCGCGTTAAAATCAATTGGGACGGGTTAGAGCTCATTTCAGACAATAAAGAAGAATATCCACCAATCCAACTAA‑CCCAAGCTGAAGCCGAAAACCTGCAAATCATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTT > 1:410584/1‑251 GAAAGAGATTAAAGGCGATAAAATCTATTTGGTACAGAACGGCGCCAGCGTATGGGTTAAGCGCGTTAAAATCAATTGGGACGGGTTAGAGCTCATTTCAGACAATAAAGAAGAATATCCACCAATCCAACTAA‑CCCAAGCTGAAGCCGAAAACCTGCAAATCATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAG > 1:346617/1‑251 AAAGAGATTAAAGGCGATAAAATCTATTTGGTACAGAACGGCGCCAGCGTATGGGTTAAGCGCGTTAAAATCAATTGGGACGGGTTAGAGCTCATTTCAGACAATAAAGAAGAATATCCACCAATCCAACTAA‑CCCAAGCTGAAGCCGAAAACCTGCAAATCATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGT < 1:645803/251‑1 AAAGAGATTAAAGGCGATAAAATCTATTTGGTACAGAACGGCGCCAGCGTATGGGTTAAGCGCGTTAAAATCAATTGGGACGGGTTAGAGCTCATTTCAGACAATAAAGAAGAATATCCACCAATCCAACTAA‑CCCAAGCTGAAGCCGAAAACCTGCAAATCATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAG < 1:697688/250‑1 GATTAAAGGCGATAAAATCTATTTGGTACAGAACGGCGCCAGCGTATGGGTTAAGCGCGTTAAAATCAATTGGGACGGGTTAGAGCTCATTTCAGACAATAAAGAAGAATATCCACCAATCCAACTAA‑CCCAAGCTGAAGCCGAAAACCTGCAAATCATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTA > 1:262715/1‑251 GATTAAAGGCGATAAAATCTATTTGGTACAGAACGGCGCCAGCGTATGGGTTAAGCGCGTTAAAATCAATTGGGACGGGTTAGAGCTCATTTCAGACAATAAAGAAGAATATCCACCAATCCAACTAA‑CCCAAGCTGAAGCCGAAAACCTGCAAATCATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTA > 1:285583/1‑251 GATTAAAGGCGATAAAATCTATTTGGTACAGAACGGCACCAGCGTATGGGTTAAGCGCGTTAAAATCAATTGGGACGGGTTAGAGCTCATTTCAGACAATAAAGAAGAATATCCACCAATCCAACTAA‑CCCAAGCTGAAGCCGAAAACCTGCAAATCATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTA > 1:663178/1‑251 AAAGGCGATAAAATCTATTTGGTACAGAACGGCGCCAGCGTATGGGTTAAGCGCGTTAAAATCAATTGGGACGGGTTAGAGCTCATTTCAGACAATAAAGAAGAATATCCACCAATCCAACTAA‑CCCAAGCTGAAGCCGAAAACCTGCAAATCATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAAC < 1:489533/251‑1 caactaacccaagctGAAGCCGAAAACCTGCAAATCATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTC < 1:160772/150‑1 aacccaagctGAAGCCGAAAACCTGCAAATCATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTC < 1:570623/241‑1 aacccaagctGAAGCCGAAAACCTGCAAATCATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATT > 1:33905/11‑250 aacccaagctGAAGCCGAAAACCTGCAAATCATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATT > 1:58974/11‑250 AAGCCGAAAACCTGCAAATCATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTTAATTC < 1:191275/250‑1 AAGCCGAAAACCTGCAAATCATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTCAATTC < 1:861979/250‑1 CCGAAAACCTGCAAATCATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCC < 1:588687/205‑1 aCCTGCAAATCATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATT > 1:699674/2‑206 CATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTT > 1:629547/1‑251 ATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTA < 1:139680/251‑1 GGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTC > 1:283137/1‑216 GGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTC > 1:630361/1‑216 GTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGGTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACC < 1:572376/237‑1 GTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTATCAATTT > 1:882533/1‑249 GTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTATCAATTT > 1:76169/1‑249 GTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTATCAATTT > 1:860982/1‑249 GTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTC < 1:431613/211‑1 TGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTATCAATTTCTAATA < 1:161153/251‑1 TGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTATCAATTTCTAAT < 1:743955/250‑1 CACATCGGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTATCAATTTCTAATAT < 1:768187/250‑1 GGGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGCTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTATCAATTTCTAATATTAAGggg > 1:201536/1‑248 GGAAAAACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTA > 1:240251/1‑229 ACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTATCAATTTCTAA < 1:3370/234‑1 ACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTT > 1:502196/1‑197 ACCTTATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGC > 1:343109/1‑159 TATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTATCAATTTCTAATATTAAGTGGTTGGTTACAgg < 1:564495/251‑3 TATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTATCAATTTCTAATATTAAGTGGTTGGTTACAgg < 1:523639/251‑3 TATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCAAATAAAAAAGGGCCAAAACTTTTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTATCAATTTCTAATA > 1:467145/1‑232 TATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAG < 1:119888/85‑1 TATTTAAACGGGCTATAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCT‑AAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTATCAATTTCTAATATTAAGTGGTTGGTTACAgga < 1:194881/251‑4 ATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTATCAATTTCTAATATTAAGTGGTTGGTTACAgga < 1:368077/251‑4 ATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTATCAATTTCTAATATTAAGT < 1:560093/237‑1 ATTTAAACGGGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAAT < 1:711876/51‑1 GGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACC < 1:209870/204‑1 GGCTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAACTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGCCCCGCTTAATTC < 1:347395/178‑1 ||| CAATCGACGACGGCGATCAGATGTTAGTGGATTTATCAAAGAAAGAGATTAAAGGCGACAAAATCTATCTGGTGCAGAACGGGGCCAGCGTATGGGTTAAGCGGGTTAAAATCAACTGGGACGGGTTAGAGCTCATTTCAGACAATAGAGAGGAATACCCACCCATTCAATTAAGCCAAAGC‑GAAGCCGAAACCCTGCAAATCATCGGGCAAGTCGTGCACATCGGGAAAAACCTTATTTAAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/103419‑103662‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTTAAACGTTTTTTAAACGCCTTTTTGTTTTTCTACAATTAAGTGGCTAAAACCGCCCTTTTTAGATTTTAGCCACTTTTTTTCTAAAACTAACTTTAACGACAAAACCACCCAATAAAAAAGGGCCAAAATTTCTTTCAGCCCTTTATTTCATTGATTCTGTCCCGCTTAATTCCGTTTAATTCAACTTAAGTCCTAACCTGTTATCAATTTCTAATATTAAGTGGTTGGTTACATTG < 1/601411‑601172 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |