| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,775,050 | (AAATTAA)2→1 | coding (600‑606/606 nt) | unknown → | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1775041 | 1775047 | 7 | 77 [0] | [0] 78 | unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1775048 = | 0 (0.000) | 75 (0.890) | 53/412 | 0.3 | 100% | coding (598/606 nt) | unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| ? | 1 | = 1775040 | 0 (0.000) | coding (590/606 nt) | unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport | |||||
ATGATTTAACCGTCGATAACGAAATCTTTGATGGAGCCATGCAGGTTGTTCCGGGTATTAGTAATACGCAAGCTTATTTTTTTGATGCATCTATGCTATCAAAAGTCGAAGTTCACGATAGCAACATTTCCGCAAGTTTAGGTGGTTTCATGGGAGGTGCAGTCGTAGCTAAAACCAAACAATATAATGGTAAAGACGGTGTTTCACTAAAATATCGCACCACCAACTCCGGTTGGGCAAAAATTAAAAATTAATGCAGATAGCTCAGCAAAAACTCTTTTAGATAAAATTAGGCCTGATGCAGGCGGTGTTGCCGAATTTCAACCTAAATACCATAAACAGACGTTCAGCATCATGGCAGAAAAAGGCTTAACGGAAAATTTGGGCATGGTGATCGGTTACAGTAAACGCCACGCCCGCATTCAACAGAATAGATTAATTGGTTATGCTCCCGACGCTAAATTAGACAAACAAAATCATAAACGCGATTCAGATA > 1/1774803‑1775298 | acgtaaataatgatttaaccgtcgataacgaaatctttgatggagccatgcaggttgttccgggtattagtaatacgcaagcttatttttgatgcatctatgctatcaaaagtcgaagttcacgatagcaacatttccgcaagtttaggtggtttcatgggaggtgcagtcgtagctaaaaccaaacaatataatggtaaagacggtgtttcactaaaatatcgcaccaccaactccggttgggcAAAAAt > 1:311910‑M1/246‑251 (MQ=255) ataatgatttaaccgtcgataacgaaatctttgatggagccatgcaggttgttccgggtattagtaatacgcaagcttatttttgatgcatctatgctatcaaaagtcgaagttcacgatagcaacatttccgcaagtttaggtggtttcatgggaggtgcagtcgtagctaaaaccaaacaatataatggtaaagacggtgtttcactaaaatatcgcaccaccaactccggttgggcAAAAATTAATGc > 1:262777‑M1/240‑251 (MQ=255) tgatttaaccgtcgataacgaaatctttgatggagccatgcaggttgttccgggtattagtaatacgcaagcttatttttgatgcatctatgctatcaaaagtcgaagttcacgatagcaacatttccgcaagtttaggtggtttcatgggaggtgcagtcgtagctaaaaccaaacaatataatggtaaagacggtgtttcactaaaatatcgcaccaccaactccggttgggcAAAAATTAATGCAGAt > 1:731705‑M1/236‑251 (MQ=255) taaccgtcgataacgaaatctttgatggagccatgcaggttgttccgggtattagtaatacgcaagcttatttttgatgcatctatgctatcaaaagtcgaagttcacgatagcaacatttccgcaagtttaggtggtttcatgggaggtgcagtcgtagctaaaaccaaacaatataatggtaaagacggtgtttcactaaaatatcgcaccaccaactccggttgggcAAAAATTAATGCAGATAGCTc > 1:87148‑M1/231‑251 (MQ=255) 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1:66599‑M1/95‑1 (MQ=255) ggtaaagacggtgtttcactaaaatatcgcaccaccaactccggttgggcAAAAATTAATGCAGATAGCTCAGCAAAAACTCTTTTAGATAAAATTAGGCCTGATGCAGGCGGTGTTGCCGAATTTCAACCTAAATACCATAAACAGACGTTCAGCATCATGGCAGAAAAAGGCTTAACGGAAAATTTGGGCATGGTGATCGGt < 1:67004‑M1/154‑1 (MQ=255) ggtaaagacggtgtttcactaaaatatcgcaccaccaactccggttgggcAAAAATTAATGCAGATAGCTCAGCAAAAACTCTTTTAGATAAAATTAGGCCTGATGCAGGCGGTGTTGCCGAATTTCAACCTAAATACCATAAAAAGACGTTCAGCATCATGGCAGAAAAAGGCTTAACGGAAAATTTTGGCATGGAGATCGGTTACAGTAAACGCCACGCCCGCATTCAACAGAATAGATTAATTGGTTa < 1:381285‑M1/201‑1 (MQ=255) gtaaagacggtgtttcactaaaatatcgcaccaccaactccggttgggcAAAAATTAATGCAGATAGCTCAGCAAAAACTCTTTTAGATAAAATTAGGCCTGATGCAGGCGGTGTTGCCGAATTTCAACCTAAATACCATAAAAAGACGTTCAGCATCATGGCAGAAAAGGGCTTAACGGAAAAATTGGGCATGGGGATCgg < 1:450278‑M1/153‑1 (MQ=255) 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ATGATTTAACCGTCGATAACGAAATCTTTGATGGAGCCATGCAGGTTGTTCCGGGTATTAGTAATACGCAAGCTTATTTTTTTGATGCATCTATGCTATCAAAAGTCGAAGTTCACGATAGCAACATTTCCGCAAGTTTAGGTGGTTTCATGGGAGGTGCAGTCGTAGCTAAAACCAAACAATATAATGGTAAAGACGGTGTTTCACTAAAATATCGCACCACCAACTCCGGTTGGGCAAAAATTAAAAATTAATGCAGATAGCTCAGCAAAAACTCTTTTAGATAAAATTAGGCCTGATGCAGGCGGTGTTGCCGAATTTCAACCTAAATACCATAAACAGACGTTCAGCATCATGGCAGAAAAAGGCTTAACGGAAAATTTGGGCATGGTGATCGGTTACAGTAAACGCCACGCCCGCATTCAACAGAATAGATTAATTGGTTATGCTCCCGACGCTAAATTAGACAAACAAAATCATAAACGCGATTCAGATA > 1/1774803‑1775298 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |