| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,775,050 | (AAATTAA)2→1 | coding (600‑606/606 nt) | unknown → | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1775041 | 1775047 | 7 | 77 [0] | [0] 78 | unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1775048 = | 0 (0.000) | 75 (0.890) | 53/412 | 0.3 | 100% | coding (598/606 nt) | unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport |
| ? | 1 | = 1775040 | 0 (0.000) | coding (590/606 nt) | unknown | Outer membrane receptor proteins, mostly Fe transport | |||||
ATAAATTATCTGAATCGCGTTTATGATTTTGTTTGTCTAATTTAGCGTCGGGAGCATAACCAATTAATCTATTCTGTTGAATGCGGGCGTGGCGTTTACTGTAACCGATCACCATGCCCAAATTTTCCGTTAAGCCTTTTTCTGCCATGATGCTGAACGTCTGTTTATGGTATTTAGGTTGAAATTCGGCAACACCGCCTGCATCAGGCCTAATTTTATCTAAAAGAGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTAATTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 1/1775304‑1775048‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttaatttttGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATCAAAAAAATAAGCTTGCGTATTACTAATACCCGGAACAACCTGCATGGCTCCATCAAAGATTTCGTTATCGACGGTTAAATCATTATTTACGT < 1/1775040‑1774794 ATAAATTATCTGAATCGCGTTTATGATTTTGTTTGTCTAATTTAGCGTCGGGAGCATAACCAATTAATCTATTCTGTTGAATGCGGGCGTGGCGTTTACTGTAACCGATCACCATGCCCAAATTTTCCGTTAAGCCTTTTTCTGCCATGATGCTGAACGTCTGTTTATGGTATTTAGGTTGAAATTCGGCAACACCGCCTGCATCAGGCCTAATTTTATCTAAAAGAGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTA > 1:257610/1‑251 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ATGGTATTTAGGTTGAAATTCGGCAACACCGCCTGCATCAGGCCTAATTTTATCTAAAAGAGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAATCTTGCGGAAATGTTG < 1:673471/208‑1 GTATTTAGGTTGAAATTCGGCAACACCGCCTGCATCAGGCCTAATTTTATCTAAAAGAGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATCAAAAAtaa > 1:582408/1‑248 ATTTAGGTTGAAATTCGGCAACACCGCCTGCATCAGGCCTAATTTTATCTAAAAGAGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAA < 1:393432/188‑1 TTCGGCAACACCGCCTGCATCAGGCCTAATTTTATCTAAAAGAGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGTCTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATC‑‑AAAAATAAGCTTGCGTATTACTA < 1:517636/251‑1 TTCGGCAACACCGCCTGCATCAGGCCTAATTTTATCTAAAAGAGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATC‑‑AAAAATAAGCTTGCGTATTACTA > 1:808444/1‑251 AACACCGCCTGCATCAGGCCTAATTTTATCTAAAAGAGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATC‑‑AAAAATAAGCTTGCGTATTACTAATACCC < 1:276472/251‑1 CCGCCTGCATCAGGCCTAATTTTATCTAAAAGAGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATG < 1:668910/214‑1 CGCCTGCATCAGGCCTAATTTTATCTAAAAGAGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATC‑‑AAAAATAAGCTTGCGTATTACTAATACCCGGAAC < 1:584041/251‑1 GGCCTAATTTTATCTAAAAGAGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATC‑‑AAAAATAAGCTTGCGTATTACTAATACCC > 1:331249/1‑235 GGCCTAATTTTATCTAAAAGAGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATC‑‑AAAAATAAGCTTGCGTATTAC < 1:896298/227‑1 GGCCTAATTTTATCTAAAAGAGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATAT < 1:624734/108‑1 GCCTAATTTTATCTAAAAGAGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATC‑‑AAAAATAAGCTTGCGTATTACTAATACCCGGAACAACCTGCAT < 1:14554/248‑1 ATCTAAAAGAGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTAATTTTTTCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATC‑‑AAAAATAAGCTTGCGTATTACTAATACCCGGAACAACCTGCATGGCTCCATCAAAG < 1:181362/251‑1 ATCTAAAAGAGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATC‑‑AAAAATAAGCTTGCGTATTACTAATACCCGGAACAACCTGCATGGCTCCATCAAAG < 1:74992/251‑1 ATCTAAAAGAGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATG > 1:347248/1‑191 GAGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATC‑‑AAAAATAAGCTTGCGTATTACTAATACCCGGAACAACCTGCATG < 1:81578/231‑1 AGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATC‑‑AAAAATAAGCTTGCGTATTACTAATACCCGGAAC > 1:687335/1‑220 AGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATG > 1:877447/1‑182 GAGCTATCTGCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATC‑‑AAAAATAAGCTTGCGTATTACTAATACCCGGAACAACCTGCATGGCTCCATCAAAGATTTCGTTATCGACGGTTA > 1:87148/1‑251 GAGCTATCTGCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATC‑‑AAAAATAAGCTTGCGTATTACTAATACCCGGAACAACCTGCAT < 1:707513/219‑1 ATCTGCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATC‑‑AAAAATAAGCTTGCGTATTACTAATACCCGGAACAACCTGCATGGCTCCATCAAAGATTTCGTTATCGACGGTTAAATCA > 1:731705/1‑251 GCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATC‑‑AAAAATAAGCTTGCGTATTACTAATACCCGGAACAACCTGCATGGCTCCATCAAAGATTTCGTTATCGACGGTTAAATCATTAT > 1:262777/1‑251 GCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATC‑‑AAAAATAAGCTTGCGTATAACTAATACCCGGAACAACCTGCATGGCTCCATCAAAGAT > 1:827151/1‑225 GCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTA > 1:3502/1‑85 GCATTAATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCT < 1:139807/84‑1 ATTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATC‑‑AAAAATAAGCTTGCGTATTACTAATACCCGGAACAACCTGCATGGCTCCATCAAAGATTTCGTTATCGACGGTTAAATCATTATTTACGT > 1:311910/1‑251 TTTTTGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATC‑‑AAAAATAAGCTTGCGTATTACTAATACCCGGAACAACCTGCATGGCTCCATCAAAGATTTCGTTATCGAC < 1:375961/230‑1 ATAAATTATCTGAATCGCGTTTATGATTTTGTTTGTCTAATTTAGCGTCGGGAGCATAACCAATTAATCTATTCTGTTGAATGCGGGCGTGGCGTTTACTGTAACCGATCACCATGCCCAAATTTTCCGTTAAGCCTTTTTCTGCCATGATGCTGAACGTCTGTTTATGGTATTTAGGTTGAAATTCGGCAACACCGCCTGCATCAGGCCTAATTTTATCTAAAAGAGTTTTTGCTGAGCTATCTGCATTAATTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 1/1775304‑1775048‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttaatttttGCCCAACCGGAGTTGGTGGTGCGATATTTTAGTGAAACACCGTCTTTACCATTATATTGTTTGGTTTTAGCTACGACTGCACCTCCCATGAAACCACCTAAACTTGCGGAAATGTTGCTATCGTGAACTTCGACTTTTGATAGCATAGATGCATCAAAAAAATAAGCTTGCGTATTACTAATACCCGGAACAACCTGCATGGCTCCATCAAAGATTTCGTTATCGACGGTTAAATCATTATTTACGT < 1/1775040‑1774794 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |