| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 91,658 | Δ4 bp | coding (750‑753/831 nt) | unknown ← | hypothetical protein |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 91658 | 91661 | 4 | 48 [0] | [0] 48 | unknown | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 91657 | 0 (0.000) | 48 (0.540) | 26/430 | 2.0 | 100% | coding (754/831 nt) | unknown | hypothetical protein |
| ? | 1 | 91662 = | 0 (0.000) | coding (749/831 nt) | unknown | hypothetical protein | |||||
TCCCTCTTGCTTACGTGTCTAATGTTATATTATATAATATAACCGCGCAACCGCTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTGTCAAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTTTTGGTTGACGAGAAGAAGATATACGGCGGGCGGGTGATGTTGACTAAGCGCAGGAAG > 1/91462‑91781 | tCCCTCTTGCTTACGTGTCTAATATTATATTATATAATATAACTGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTaacgcttgccagttatctactttatccgtttgtatatactcaataaagcgcacaa > 1:519533‑M1/1‑196 (MQ=255) ctTGCTTACGTGTCTAATATTATATTATATAATATAACTGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTaacgcttgccagttatctactttatccgtttgtatatactcaataaagcgcacaaactcg > 1:807424‑M1/1‑191 (MQ=255) 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1:290215‑M1/131‑88 (MQ=255) tAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTaacgcttgccagttatctactttatccgtttgtatatactcaataaagcgcacaaactcgctcttagttgacgagaagaatatatac < 1:896805‑M1/125‑88 (MQ=255) | TCCCTCTTGCTTACGTGTCTAATGTTATATTATATAATATAACCGCGCAACCGCTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTGTCAAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTTTTGGTTGACGAGAAGAAGATATACGGCGGGCGGGTGATGTTGACTAAGCGCAGGAAG > 1/91462‑91781 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |