| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 91,658 | Δ4 bp | coding (750‑753/831 nt) | unknown ← | hypothetical protein |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 91658 | 91661 | 4 | 48 [0] | [0] 48 | unknown | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 91657 | 0 (0.000) | 48 (0.540) | 26/430 | 2.0 | 100% | coding (754/831 nt) | unknown | hypothetical protein |
| ? | 1 | 91662 = | 0 (0.000) | coding (749/831 nt) | unknown | hypothetical protein | |||||
TCCCTCTTGCTTACGTGTCTAATGTTATATTATATAATATAACCGCGCAACCGCTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/91462‑91657‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTTTTGGTTGACGAGAAGAAGATATACGGCGGGCGGGTGATGTTGACTAAGCGCAGGAAGTCGA > 1/91662‑91785 TCCCTCTTGCTTACGTGTCTAATATTATATTATATAATATAACTGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAA > 1:519533/1‑251 CTTGCTTACGTGTCTAATATTATATTATATAATATAACTGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCG > 1:807424/1‑251 CGTGTCTAATATTATATTATATAATATAACTGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTc < 1:218500/246‑2 GTCTAATATTATATTATATAATATAACTGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTCTTAGTTGA > 1:248287/1‑251 ataTTATATTATATAATATAACTGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTCTTAGTTGACGAGA > 1:117604/4‑251 ataTTATATTATATAATATAACTGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTCTTAGTTGACGAGA > 1:73114/4‑251 ataTTATATTATATAATATAACTGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTCTTAGTTGACGAGA > 1:504031/4‑251 ataTTATATTATATAATATAACTGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAAT < 1:112826/216‑1 ATATAATATAACTGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTCTTAGTTGACGAGAAGAAtat > 1:278575/1‑245 ATATAATATAACTGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTCTTAGTTGACGAGAAGAATATATA > 1:822762/1‑251 ATATAATATAACTGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTCTTAGTTGACGAGAAGAATATATA > 1:808279/1‑251 ATATAATATAACTGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTCTTAGTTGACGAGAAGAATATATA > 1:767160/1‑251 ATATAATATAACTGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAA > 1:10627/1‑211 ATATAATATAACTGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATAC < 1:812665/204‑1 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1:41569/1‑248 TAATATAACTGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTCTTAGTTGACGAGAAGAATATATA < 1:628600/248‑1 TAATATAACTGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCG > 1:267486/1‑190 TAATATAACTGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCC < 1:601220/172‑1 TAATATAACTGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGC < 1:178371/167‑1 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1:507963/1‑244 ctGCGCAACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTCTTAGTTGACGAGAAGAATATATAC < 1:516350/239‑1 AACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTCTTAGTTGACGAGAAGAATATATACGGCGGGCGGGTGATGT > 1:763292/1‑251 ACCGGTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCG < 1:498922/175‑1 ccggTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACT < 1:746228/182‑1 gTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGC < 1:373734/147‑1 TTTGTAAGGTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATAC < 1:452135/178‑1 GTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTCTTAGTTGACGAGAAGAATATATA > 1:6909/1‑211 GTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTT < 1:845001/147‑1 CCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTCTTAGTTGACGAGAAGAATATATACGGCGGGCGGGTGATGTTGACTAgcaattctttgacta > 1:730979/1‑219 CCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATAC < 1:649944/149‑1 CCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTAT < 1:344845/145‑1 CCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTCTTAGTTGACGAGAAGAATATATACGGCGGGCGGGTGATGTTGACT < 1:372950/217‑1 CCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTCTTAGTTGACGAGAAGAATATATAC < 1:261590/196‑1 CCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTC > 1:497122/1‑150 CCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTC < 1:245777/167‑1 CTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATAC > 1:77777/1‑146 AGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTCTTAGTTGACGAGAAGAATATATAC < 1:881290/149‑1 TCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTCTTAGTTGACGAGAAGAATATATACG > 1:172254/1‑144 TCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTCTTAGTTGACGAGAAGAATATATA > 1:146535/1‑142 TCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAA > 1:569545/1‑102 CCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTCTTAGTTGACGAGAAGAATATATAC < 1:290215/131‑1 TAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATTAACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTCTTAGTTGACGAGAAGAATATATAC < 1:896805/125‑1 TCCCTCTTGCTTACGTGTCTAATGTTATATTATATAATATAACCGCGCAACCGCTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGCCCCTTAAACATCGTTTAAAGGGCTTTTGAAGTTAAAATTTATAAACCAGATTATCCTCATACTCGCCATGATAGTTGAGGTTTGTCTTAATCGCTATCCGCTTAGCATT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/91462‑91657‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AACGCTTGCCAGTTATCTACTTTATCCGTTTGTATATACTCAATAAAGCGCACAAACTCGCTTTTGGTTGACGAGAAGAAGATATACGGCGGGCGGGTGATGTTGACTAAGCGCAGGAAGTCGA > 1/91662‑91785 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |