| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
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1:451960‑M2/1‑81 (MQ=255) atctcctgccgcgCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGGTTAATATTATATTATATAATATAACTACGCAACGACTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAGAGTCGACGGAACATCTCCGCTCTTGATACTCCCTCGGTTTTGCAGATTGCGTCGAATTCATCGACCACTTCCGGGCGGAGTTTGAACAATACCTGTTTATAGTTGTCTTTGCTGTAGCTGTTAg < 1:622855‑M1/238‑1 (MQ=255) ctcctgccgcgCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCt > 1:466851‑M1/12‑52 (MQ=255) ccGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAatattatataatataactacgcaaccactattttgtaagttttgtgtaaatatttaaaagtcgacggaacatctccgctcttgatactccctcggttttgcagattgcgtcgaattcatctaccacttccgggcggagtttgaacaatacctgtttatagttctctttgctgtagctgttagcatttgtgctaat > 1:269024‑M2/1‑56 (MQ=255) | GTAACGGTCAACCCATTTCTTACCATCTTCTTTACTTGTGATCTCGTCAACCAGTAACCCGTCGCTGTTTAAGCTGTAGATTGTGCCGATTTTGAGGGTTGTGCCTTGGAAGCACTGACGGCGTGAAGCTTCGCGTTTAGCGTCCGCTAATGTTTGTGCTTTTAACGCTTCGGCTGTTGCGTATGCGTTGATGTTGCTAGTTTCGCTGAAGTAGTAAGTTGTCATTTTTTTAATCTCCTGCCGCTCGTTAATCATTTATAAGCTTCGGTGCGGCGTCCCTCTTGCTTACGTGATTAATATTATATTATATAATATAACTACGCAACCACTATTTTGTAAGTTTTGTGTAAATATTTAAAAGTCGACGGAACATCTCCGCTCTTGATACTCCCTCGGTTTTGCAGATTGCGTCGAATTCATCTACCACTTCCGGGCGGAGTTTGAACAATACCTGTTTATAGTTGTCTTTGCTGTAGCTGTTAGCGTTTGTG > 1/89403‑89893 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |