| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 79,054 | (GAAGCCA)5→2 | intergenic (–/+54870) | – / ← unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 79054 | 79074 | 21 | 55 [0] | [0] 56 | –/unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 79053 | 0 (0.000) | 47 (0.580) | 34/398 | 1.1 | 100% | intergenic (–/+54891) | –/unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| ? | 1 | 79075 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+54869) | –/unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC | |||||
GCCAAGGTAACGACTGCCCGGAATGCTCGATTTTGGAGGGCTTGAGTGAGTGAAAAGTGCGGTGATTTTTCATTGCAATTTTAAGTAGAAATATAATTAAAAAATCTCTCACGCTTATCTTTTAAACATGCACAATTCCTATAAAATAGGTATATTTTTTTATTTACTCACTTTACAAAGGACAAATTTTATGCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCACCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAGCTTCACCGCACAGCAAGACAAAATCCGTGTCGAGCTTTCTAATCCTGAAAATCCCCTTTATCTTGACCGCACTTTTTACAACTCCGATGAAG > 1/78845‑79325 | tgcaacgttggcacgacaactgccaaggtaacgactgcccggaatgctcgattttggagggcttgagtgagtgaaaagtgcggtgatttttcattgcaattttaagtagaaatataattaaaaaatctctcatgcttatcttttaaacatgcacaattcctataaaataggtatatttttttatttactcactttacaaaggacaaattttatgcagaagccagaagccaCCAAGATTATGTTGAAAAtt > 1:605221‑M2/231‑250 (MQ=255) 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cttttaaacatgcacaattcctataaaataggtatatttttttatttactcactttacaaaggacaaattttatgcagaagccagaagccaCCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAg > 1:71908‑M2/92‑250 (MQ=255) cttttaaacatgcacaattcctataaaataggtatatttttttatttactcactttacaaaggacaaattttatgcagaagccagaagccaCCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAg > 1:215752‑M2/92‑250 (MQ=255) cttttaaacatgcacaattcctataaaataggtatatttttttatttactcactttacaaaggacaaattttatgcagaagccagaagccaCCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAg > 1:152342‑M2/92‑250 (MQ=255) 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ctataaaataggtatatttttttatttactcactttacaaaggacaaattttatgcagaagccagaagccaCCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGAc < 1:630285‑M2/157‑1 (MQ=255) ctataaaataggtatatttttttatttactcactttacaaaggacaaattttatgcagaagccagaagccaCCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAGCTTCACCGCACAGCAAGACaa > 1:340561‑M2/72‑251 (MQ=255) ctataaaataggtatatttttttatttactcactttacaaaggacaaattttatgcagaagccagaagccaCCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAGCTTCACCGCACAGCAAGACaa > 1:318557‑M2/72‑251 (MQ=255) 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> 1:367683‑M2/25‑250 (MQ=255) attttatgcagaagccagaagccaCCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAGCTTCACCGCACAGCAAGACAAAATCCGTGTCGAGCTTTCTAATCCTGAAAATCCCCTTTATCTTGAc > 1:89832‑M2/25‑250 (MQ=255) gaagccagaagccaCCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGCCAGCTTCACCGCACAGCAAGACAAAATCCGTGTCGAGCTTTCTAATCCTGAAAATCCCCTTTATCTTGACCGCACTTTTTa > 1:447213‑M2/15‑251 (MQ=255) gaagccagaagccaCCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAGCTTCACCGCACAGCAAGACAAAATCCGTGTCGAGCTTTCTAATCCTGAAAATCCCCTTTATCTTGACCGCACTTTTTa > 1:807542‑M2/15‑251 (MQ=255) 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1:870537‑M2/13‑251 (MQ=255) ccaCCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGATCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAGCTTCACCGCACAGCAAGACAAAATCCGTGTCGAGCTTTCTAATCCTGAAAATCCCCTTTATCTTGACCGCACTTTTTACAACTCCGATg < 1:432866‑M2/248‑1 (MQ=255) caCCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACGCAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAGCTTCACCGCACAGCAAGACAAAATCCGTGTCGAGCTTTCTAATCCTGAAAATCCCCTTTATCTTGACCGCACTTTTTACAACTCCGATGa < 1:124136‑M2/249‑1 (MQ=255) ccaAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAGCTTCACCGCACAGCAAGACAAAATCCGTGTCGAGCTTTCTAATCCTGAAAATCCCCTTTATCTTGACCGCACTTTTTACAACTCCGATgaag < 1:485044/251‑1 (MQ=255) | 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |