| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 79,054 | (GAAGCCA)5→2 | intergenic (–/+54870) | – / ← unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 79054 | 79074 | 21 | 55 [0] | [0] 56 | –/unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 79053 | 0 (0.000) | 47 (0.580) | 34/398 | 1.1 | 100% | intergenic (–/+54891) | –/unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| ? | 1 | 79075 = | 0 (0.000) | intergenic (–/+54869) | –/unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC | |||||
TGCAACGTTGGCACGACAACTGCCAAGGTAACGACTGCCCGGAATGCTCGATTTTGGAGGGCTTGAGTGAGTGAAAAGTGCGGTGATTTTTCATTGCAATTTTAAGTAGAAATATAATTAAAAAATCTCTCACGCTTATCTTTTAAACATGCACAATTCCTATAAAATAGGTATATTTTTTTATTTACTCACTTTACAAAGGACAAATTTTATGCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCACCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAGCTTCACCGCACAGCAAGACAAAATCCGTGTCGAGCTTTCTAATCCTGAAAATCCCCTTTATCTTGACCG > 1/78824‑79302 | tGCAACGTTGGCACGACAACTGCCAAGGTAACGACTGCCCGGAATGCTCGATTTTGGAGGGCTTGAGTGAGTGAAAAGTGCGGTGATTTTTCATTGCAATTTTAAGTAGAAATATAATTAAAAAATCTCTCATGCTTATCTTTTAAACATGCACAATTCCTATAAAATAGGTATATTTTTTTATTTACTCACTTTACAAAGGACAAATTTTATGCAGAAGCCAGAAGCCAccaagattatgttgaaaatt > 1:605221‑M1/1‑230 (MQ=255) 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cTTTTAAACATGCACAATTCCTATAAAATAGGTATATTTTTTTATTTACTCACTTTACAAAGGACAAATTTTATGCAGAAGCCAGAAGCCAccaagattatgttgaaaattcagccacacaacaagccttcctaaacgacctcgacgaaaaactttggtcttccgccgaccgtctccgccagcaactcgacgccgccaactacaaacacattgtgcttggcttaatcttcttaaaatacatctccgacag > 1:71908‑M1/1‑91 (MQ=255) cTTTTAAACATGCACAATTCCTATAAAATAGGTATATTTTTTTATTTACTCACTTTACAAAGGACAAATTTTATGCAGAAGCCAGAAGCCAccaagattatgttgaaaattcagccacacaacaagccttcctaaacgacctcgacgaaaaactttggtcttccgccgaccgtctccgccagcaactcgacgccgccaactacaaacacattgtgcttggcttaatcttcttaaaatacatctccgacag > 1:152342‑M1/1‑91 (MQ=255) cTTTTAAACATGCACAATTCCTATAAAATAGGTATATTTTTTTATTTACTCACTTTACAAAGGACAAATTTTATGCAGAAGCCAGAAGCCAccaagattatgttgaaaattcagccacacaacaagccttcctaaacgacctcgacgaaaaactttggtcttccgc > 1:766041‑M1/1‑91 (MQ=255) 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1:889077‑M1/1‑61 (MQ=255) tttaCTCACTTTACAAAGGACAAATTTTATGCAGAAGCCAGAAGCCAccaagattatgttgaaaattcagccacacaacaagccttcctaaacgacctcgacgaaaaactttggtcttccgccgaccgtctccgccagcaactcgacgccgccaactacaaacacattgtgcttggcttaatcttcttaaaatacatctccgacagcttcaccgcacagcaagacaaaatccgtgtcgagctttctaatcc < 1:679686‑M1/251‑205 (MQ=255) cTTTACAAAGGACAAATTTTATGCAGAAGCCAGAAGCCAccaagattatgttgaaaattcagccacacaacaagccttcctaaacgacctcgacgaaaaactttggtcttccgccgaccgtctccgccagcaactcgacgccgccaactacaaacacattgtgcttggcttaatcttcttaaaatacatctccgacagcttcaccgcacagcaagacaaaatccgtgtcgagctttctaatcctgaaaat > 1:768317‑M1/1‑39 (MQ=255) cTTTACAAAGGACAAATTTTATGCAGAAGCCAGAAGCCAccaagattatgttgaaaattcagccacacaacaagccttcctaaacgacctcgacgaaaaactttggtcttccgccgaccgtctccgccagcaactcgacgccgccaactacaaacacattgtgcttggcttaatcttcttaaaatacatctccgacagcttcaccgcacagcaagacaaaatccgtgtcgagctttctaatcctgaaaat > 1:722429‑M1/1‑39 (MQ=255) 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(MQ=255) aagccagaagccaccaagattatgttgaaaattcagccacacaacaagccttcctaaacgacctcgacgaaaaactttggtcttccgccgaccgtctccgccagcaactcgacgccgccaactacaaacacattgtgcttggcttaatcttcttaaaatacatctccgacagcttcaccgcacagcaagacaaaatccgtgtcgagctttctaatcctgaaaatcccctttatcttgaccgcactttttac < 1:7857‑M1/251‑239 (MQ=255) agccagaagccaccaagattatgttgaaaattcagccacacaacaagccttcctaaacgacctcgacgaaaaactttggtcttccgccgaccgtctccgccagcaactcgacgccgccaactacaaacacattgtgcttggcttaatcttcttaaaatacatctccgacagcttcaccgcacagcaagacaaaatccgtgtcgagctttctaatcctgaaaatcccctttatcttgaccgcactttttaca > 1:870537‑M1/1‑12 (MQ=255) agccagaagccaccaagattatgttgaaaattcagccacacaacaagccttcctaaacgacctcgacgaaaaactttggtcttccgccgaccgtctccgccagcaactcgacgccgccaactacaaacacattgtgcttggcttaatcttcttaaaatacatctccgacagcttcaccgcacagcaagacaaaatccgtgtcgagct > 1:663524‑M1/1‑12 (MQ=255) agccagaagccaccaagattatgttgaaaattcagccacacaacaagccttcctaaacgacctcgacgaaaaactttggtcttccgccgaccgtctccgccagcaactcgacgccgccaactacaaacacattgtgcttggcttaatcttcttaaaatacatctccgacagcttcaccgcac > 1:483916‑M1/1‑12 (MQ=255) ccaccaagattatgttgaaaattcagccacacaacaagccttcctaaacgacctcgacgaaaaactttggtcttccgccgatcgtctccgccagcaactcgacgccgccaactacaaacacattgtgcttggcttaatcttcttaaaatacatctccgacagcttcaccgcacagcaagacaaaatccgtgtcgagctttctaatcctgaaaatcccctttatcttgaccgcactttttacaactccgatg < 1:432866‑M1/251‑249 (MQ=255) caccaagattatgttgaaaattcagccacgcaacaagccttcctaaacgacctcgacgaaaaactttggtcttccgccgaccgtctccgccagcaactcgacgccgccaactacaaacacattgtgcttggcttaatcttcttaaaatacatctccgacagcttcaccgcacagcaagacaaaatccgtgtcgagctttctaatcctgaaaatcccctttatcttgaccgcactttttacaactccgatga < 1:124136‑M1/251‑250 (MQ=255) | TGCAACGTTGGCACGACAACTGCCAAGGTAACGACTGCCCGGAATGCTCGATTTTGGAGGGCTTGAGTGAGTGAAAAGTGCGGTGATTTTTCATTGCAATTTTAAGTAGAAATATAATTAAAAAATCTCTCACGCTTATCTTTTAAACATGCACAATTCCTATAAAATAGGTATATTTTTTTATTTACTCACTTTACAAAGGACAAATTTTATGCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCAGAAGCCACCAAGATTATGTTGAAAATTCAGCCACACAACAAGCCTTCCTAAACGACCTCGACGAAAAACTTTGGTCTTCCGCCGACCGTCTCCGCCAGCAACTCGACGCCGCCAACTACAAACACATTGTGCTTGGCTTAATCTTCTTAAAATACATCTCCGACAGCTTCACCGCACAGCAAGACAAAATCCGTGTCGAGCTTTCTAATCCTGAAAATCCCCTTTATCTTGACCG > 1/78824‑79302 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |