| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,723,309 | Δ36 bp | intergenic (‑42/+98) | unknown ← / ← unknown | hypothetical protein/FIG141751: hypothetical protein in PFGI‑1‑like cluster |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1723309 | 1723344 | 36 | 74 [0] | [0] 74 | unknown/unknown | hypothetical protein/FIG141751: hypothetical protein in PFGI‑1‑like cluster |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1723308 | 0 (0.000) | 68 (0.920) | 42/362 | 0.5 | 100% | intergenic (‑41/+134) | unknown/unknown | hypothetical protein/FIG141751: hypothetical protein in PFGI‑1‑like cluster |
| ? | 1 | 1723345 = | 0 (0.000) | intergenic (‑78/+97) | unknown/unknown | hypothetical protein/FIG141751: hypothetical protein in PFGI‑1‑like cluster | |||||
TGTACTTTGGAAAGCCCCTTTCCAGTGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGCTTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCGATCTGCGTTGCCGCTCCTGTTCAGTTGGTTTTTCCGGTTTGTTATTATCCGGGTTAGTTGCCTGTTTTGGTTGAAAAAATGCAATTTTCGGTTTTGAACATTTATTGG > 1/1723110‑1723590 | tcataatgtcatcctgtttaattaatggttaaaaaatgtactttggaaagcccctttccagtgattaaaatttgttcactgtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTaaaaa > 1:322255‑M2/236‑251 (MQ=255) cataatgtcatcctgtttaattaatggttaaaaaatgtactttggaaagcccctttccagtgattaaaatttgttcactgtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTaaaaaa < 1:214320‑M2/17‑1 (MQ=255) atgtcatcctgtttaattaatggttaaaaaatgtactttggaaagcccctttccagtgattaaaatttgttcactgtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTa > 1:210717‑M2/231‑251 (MQ=255) catcctgtttaattaatggttaaaaaatgtactttggaaagcccctttccagtgattaaaatttgttcactgtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACttt > 1:308698‑M2/227‑251 (MQ=255) ctgtttaattaatggttaaaaaatgtactttggaaagcccctttccagtgattaaaatttgttcactgtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTa > 1:825861‑M2/223‑234 (MQ=255) taattaatggttaaaaaatgtactttggaaagcccctttccagtgattaaaatttgttcactgtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGccc < 1:683216‑M2/34‑1 (MQ=255) atggttaaaaaatgtactttggaaagcccctttccagtgattaaaatttgttcactgtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGAc < 1:572823‑M2/40‑1 (MQ=255) ggttaaaaaatgtactttggaaagcccctttccagtgattaaaatttgttcactgtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTAc < 1:117387‑M2/22‑1 (MQ=255) gttaaaaaatgtactttggaaagcccctttccagtgattaaaatttgttcactgtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTaaaaaa < 1:79237‑M2/17‑1 (MQ=255) gttaaaaaatgtactttggaaagcccctttccagtgattaaaatttgttcactgtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGAc > 1:634599‑M2/209‑248 (MQ=255) gttaaaaaatgtactttggaaagcccctttccagtgattaaaatttgttcactgtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAg < 1:872772‑M2/42‑1 (MQ=255) aaaatgtactttggaaagcccctttccagtgattaaaatttgttcactgtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGAc < 1:110941‑M2/40‑1 (MQ=255) aaaatgtactttggaaagcccctttccagtgattaaaatttgttcactgtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGAc < 1:282832‑M2/40‑1 (MQ=255) ctttggaaagcccctttccagtgattaaaatttgttcactgtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTaaaa < 1:352327‑M2/51‑1 (MQ=255) ggaaagcccctttccagtgattaaaatttgttcactgtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCaa > 1:583733‑M2/192‑251 (MQ=255) tgattaaaatttgttcactgtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAacac < 1:278135‑M2/76‑1 (MQ=255) tgattaaaatttgttcactgtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAAGGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAacac < 1:800804‑M2/76‑1 (MQ=255) tttgttcactgtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaaggtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcacggagcaaccctggctcattggttaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAAttt < 1:232095‑M2/54‑1 (MQ=255) ttgttcactgtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAAc < 1:680742‑M2/87‑1 (MQ=255) gtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtgctttgtagagcccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGAc < 1:850901‑M2/40‑1 (MQ=255) gtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGAc > 1:725306‑M2/156‑195 (MQ=255) gtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAAt < 1:605138‑M2/52‑1 (MQ=255) gtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCaa > 1:282006‑M2/156‑251 (MQ=255) gtgcaaccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCaa > 1:822888‑M2/156‑251 (MQ=255) ccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTaaaaa > 1:321949‑M2/150‑165 (MQ=255) ccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGAc < 1:477139‑M2/40‑1 (MQ=255) ccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGAc < 1:28675‑M2/40‑1 (MQ=255) ccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAAt < 1:127136‑M2/52‑1 (MQ=255) ccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAacac < 1:562866‑M2/76‑1 (MQ=255) ccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTAt > 1:203424‑M2/150‑250 (MQ=255) ccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTAt > 1:503892‑M2/150‑250 (MQ=255) ccctagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGCCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAAt < 1:304224‑M2/79‑1 (MQ=255) tagcacagtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCa < 1:359008‑M2/105‑1 (MQ=255) gtggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAacac < 1:296374‑M2/76‑1 (MQ=255) ggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGAc < 1:858227‑M2/40‑1 (MQ=255) ggttaaaatttgctcactgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTg > 1:343412‑M2/138‑251 (MQ=255) actgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGaa > 1:826103‑M2/123‑251 (MQ=255) ctgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAacac > 1:809120‑M2/122‑197 (MQ=255) ctgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAAt > 1:777596‑M2/122‑251 (MQ=255) ctgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAAt > 1:11455‑M2/122‑251 (MQ=255) ctgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAAt > 1:873380‑M2/122‑251 (MQ=255) ctgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAAt > 1:326693‑M2/122‑251 (MQ=255) ctgtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAAt > 1:478974‑M2/122‑251 (MQ=255) gtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAacac > 1:93984‑M2/120‑195 (MQ=255) gtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATcc < 1:652305‑M2/103‑1 (MQ=255) gtgcagtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATg > 1:227667‑M2/120‑250 (MQ=255) gtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCt < 1:635268‑M2/70‑1 (MQ=255) gtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTg < 1:560192‑M2/84‑1 (MQ=255) gtccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGc > 1:204638‑M2/115‑250 (MQ=255) tccccgcacagtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCg < 1:766503‑M2/138‑1 (MQ=255) gtggttaaaaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCGATCTGCGTTg > 1:214116‑M2/104‑251 (MQ=255) aaaatgtactttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAacac > 1:737778‑M2/96‑171 (MQ=255) actttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAacac > 1:801877‑M2/89‑164 (MQ=255) ttgtagaacccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCGATCTGCGTTGCCGCTCCTGTTCAGTTgg > 1:554718‑M2/86‑251 (MQ=255) cccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTgg < 1:135751‑M2/45‑1 (MQ=255) cccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTc < 1:14735‑M2/117‑1 (MQ=255) cccttctacagtggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGCCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCGATCTGCGTTGCCGCTCCTGTTCAGTTGGTTTTTCCg > 1:391038‑M2/78‑251 (MQ=255) tggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCGATCTGCGTTGCCGCTCCTGTTCAGTTGGTTTTTCCGGTTTGttat < 1:523264‑M2/183‑1 (MQ=255) ggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGcccc > 1:165269‑M2/66‑100 (MQ=255) ggttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCGAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCGATCTGCGTTGCCGCTCCTGTTCAGTTGGTTTTTCCGGTTTGTtattat > 1:433142‑M2/66‑251 (MQ=255) ttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCGATCTGCGTTGCCGCTCCTGTTCAGTTGGTTTTTCCGGTTTGTTATTATc < 1:522323‑M2/187‑1 (MQ=255) ttaaaatttgttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCGATCTGCGTTGCCGCTCCTGTTCAGTTGGTTTTTCCGGTTTGTTATTATc < 1:833629‑M2/187‑1 (MQ=255) gttttttcaccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTc < 1:141834‑M2/4‑1 (MQ=255) caccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCGATCTGCGTTGCCGCTCCTGTTCAGTTGGTTTTTCCGGTTTGTTATTATCCGGGTTAGTTGcc < 1:245608‑M2/200‑1 (MQ=255) caccgagcaaccctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCGATCTGCGTTGCCGCTCCTGTTCAGTTGGTTTTTCCGGTTTGTTATTATCCGGGTTAGTTGcc < 1:657885‑M2/200‑1 (MQ=255) accctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCGATCTGCGTTGCCGCTCCTGTTCAGTTGGTTTTTCCGGTTTGTTATTATCCGGGTTAGTTGCCTGTTTTGGt > 1:698374‑M2/43‑251 (MQ=255) accctggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTAATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCGATCTGCGTTGCCGCTCCTGTTCAGTTGGTTTTTCCGGCTTGTTATTATCCGGGTTAGTTGCCTGTTTTGGt > 1:371132‑M2/43‑251 (MQ=255) ggctcattggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGtt < 1:82099‑M2/82‑1 (MQ=255) ggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGAc < 1:375877‑M2/40‑1 (MQ=255) ggttaaattttgtacattgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCGATCTGCGTTGCCGCTCCTGTTCAGTTGGTTTTTCCGGTTTGTTATTATCCGGGTTAGTTGCCTGTTTTGGTTGAAAAAATGCaa > 1:523161‑M2/30‑251 (MQ=255) attgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCGATCTGCGTTGCCGCTCCTGTTCAGTTGGTTTTTCCGGTTTGTTATTATCCGGGTTAGTTGCCTGTTTTGGTTGAAAAAATGCAATTTTCGGTTTTGAAc < 1:200658‑M2/237‑1 (MQ=255) attgaagcgtcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCGATCTGCGTTGCCGCTCCTGTTCAGTTGGTTTTTCCGGTTTGTTATTATCCGGGTTAGTTGCCTGTTTTGGTTGAAAAAATGCAATTTTCGGTTTTGAAc < 1:496104‑M2/237‑1 (MQ=255) tcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCGATCTGCGTTGCCGCTCCTGTTCAGTTGGTTTTTCCGGTTTGTTATTATCCGGGTTAGTTGCCTGTTTTGGTTGAAAAAATGCAATTTTCGGTTTTGAACATTTATTgg > 1:8313‑M2/6‑251 (MQ=255) tcccgGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCGATCTGCGTTGCCGCTCCTGTTCAGTTGGTTTTTCCGGTTTGTTATTATCCGGGTTAGTTGCCTGTTTTGGTTGAAAAAATGCAATTTTCGGTTTTGAACATTTATTgg > 1:61547‑M2/6‑251 (MQ=255) | TGTACTTTGGAAAGCCCCTTTCCAGTGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGCTTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCGATCTGCGTTGCCGCTCCTGTTCAGTTGGTTTTTCCGGTTTGTTATTATCCGGGTTAGTTGCCTGTTTTGGTTGAAAAAATGCAATTTTCGGTTTTGAACATTTATTGG > 1/1723110‑1723590 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |