| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,723,309 | Δ36 bp | intergenic (‑42/+98) | unknown ← / ← unknown | hypothetical protein/FIG141751: hypothetical protein in PFGI‑1‑like cluster |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1723309 | 1723344 | 36 | 74 [0] | [0] 74 | unknown/unknown | hypothetical protein/FIG141751: hypothetical protein in PFGI‑1‑like cluster |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1723308 | 0 (0.000) | 68 (0.920) | 42/362 | 0.5 | 100% | intergenic (‑41/+134) | unknown/unknown | hypothetical protein/FIG141751: hypothetical protein in PFGI‑1‑like cluster |
| ? | 1 | 1723345 = | 0 (0.000) | intergenic (‑78/+97) | unknown/unknown | hypothetical protein/FIG141751: hypothetical protein in PFGI‑1‑like cluster | |||||
TCATAATGTCATCCTGTTTAATTAATGGTTAAAAAATGTACTTTGGAAAGCCCCTTTCCAGTGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGCTTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCGATCTGCGTTGCCGCTCCTGTTCAGTTGGTTTTTCCGGTTTGTTATTATCCGGGTTAGTTGCCTGTTTTGGTT > 1/1723074‑1723554 | tCATAATGTCATCCTGTTTAATTAATGGTTAAAAAATGTACTTTGGAAAGCCCCTTTCCAGTGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaa > 1:322255‑M1/1‑235 (MQ=255) cATAATGTCATCCTGTTTAATTAATGGTTAAAAAATGTACTTTGGAAAGCCCCTTTCCAGTGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaa < 1:214320‑M1/251‑18 (MQ=255) aTGTCATCCTGTTTAATTAATGGTTAAAAAATGTACTTTGGAAAGCCCCTTTCCAGTGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgta > 1:210717‑M1/1‑230 (MQ=255) cATCCTGTTTAATTAATGGTTAAAAAATGTACTTTGGAAAGCCCCTTTCCAGTGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtacttt > 1:308698‑M1/1‑226 (MQ=255) cTGTTTAATTAATGGTTAAAAAATGTACTTTGGAAAGCCCCTTTCCAGTGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggtta > 1:825861‑M1/1‑222 (MQ=255) taattaatGGTTAAAAAATGTACTTTGGAAAGCCCCTTTCCAGTGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagccc < 1:683216‑M1/251‑35 (MQ=255) atGGTTAAAAAATGTACTTTGGAAAGCCCCTTTCCAGTGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggac < 1:572823‑M1/251‑41 (MQ=255) ggTTAAAAAATGTACTTTGGAAAGCCCCTTTCCAGTGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtac < 1:117387‑M1/231‑23 (MQ=255) gTTAAAAAATGTACTTTGGAAAGCCCCTTTCCAGTGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacag < 1:872772‑M1/250‑43 (MQ=255) gTTAAAAAATGTACTTTGGAAAGCCCCTTTCCAGTGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggac > 1:634599‑M1/1‑208 (MQ=255) gTTAAAAAATGTACTTTGGAAAGCCCCTTTCCAGTGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaa < 1:79237‑M1/225‑18 (MQ=255) aaaaTGTACTTTGGAAAGCCCCTTTCCAGTGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggac < 1:110941‑M1/243‑41 (MQ=255) aaaaTGTACTTTGGAAAGCCCCTTTCCAGTGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggac < 1:282832‑M1/243‑41 (MQ=255) cTTTGGAAAGCCCCTTTCCAGTGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaa < 1:352327‑M1/246‑52 (MQ=255) ggAAAGCCCCTTTCCAGTGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaa > 1:583733‑M1/1‑191 (MQ=255) tGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacac < 1:278135‑M1/250‑77 (MQ=255) tGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaaggtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacac < 1:800804‑M1/250‑77 (MQ=255) tttGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAAGGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACGGAGCAACCCTGGCTCATTGGTT‑AATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaattt < 1:232095‑M1/218‑55 (MQ=255) ttGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaac < 1:680742‑M1/251‑88 (MQ=255) gtgCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTGCTTTGTAGAGCCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggac < 1:850901‑M1/195‑41 (MQ=255) gtgCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaa > 1:822888‑M1/1‑155 (MQ=255) gtgCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaa > 1:282006‑M1/1‑155 (MQ=255) gtgCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaat < 1:605138‑M1/207‑53 (MQ=255) gtgCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggac > 1:725306‑M1/1‑155 (MQ=255) cccTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttat > 1:203424‑M1/1‑149 (MQ=255) cccTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttat > 1:503892‑M1/1‑149 (MQ=255) cccTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacac < 1:562866‑M1/225‑77 (MQ=255) cccTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaat < 1:127136‑M1/201‑53 (MQ=255) cccTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggac < 1:28675‑M1/189‑41 (MQ=255) cccTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggac < 1:477139‑M1/189‑41 (MQ=255) cccTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgcccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaat < 1:304224‑M1/228‑80 (MQ=255) cccTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaa > 1:321949‑M1/1‑149 (MQ=255) tAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatccca < 1:359008‑M1/251‑106 (MQ=255) gTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacac < 1:296374‑M1/215‑77 (MQ=255) ggTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttg > 1:343412‑M1/1‑137 (MQ=255) ggTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggac < 1:858227‑M1/177‑41 (MQ=255) aCTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaa > 1:826103‑M1/1‑122 (MQ=255) cTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaat > 1:777596‑M1/1‑121 (MQ=255) cTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaat > 1:873380‑M1/1‑121 (MQ=255) cTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaat > 1:11455‑M1/1‑121 (MQ=255) cTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaat > 1:478974‑M1/1‑121 (MQ=255) cTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaat > 1:326693‑M1/1‑121 (MQ=255) cTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacac > 1:809120‑M1/1‑121 (MQ=255) gtgCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaatg > 1:227667‑M1/1‑119 (MQ=255) gtgCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcc < 1:652305‑M1/222‑104 (MQ=255) gtgCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacac > 1:93984‑M1/1‑119 (MQ=255) gTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaatgcttgc > 1:204638‑M1/1‑114 (MQ=255) gTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttg < 1:560192‑M1/198‑85 (MQ=255) gTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaacct < 1:635268‑M1/184‑71 (MQ=255) tCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaatgcttgccg < 1:766503‑M1/251‑139 (MQ=255) gTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaatgcttgccgatctgcgttg > 1:214116‑M1/1‑103 (MQ=255) aaaaTGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacac > 1:737778‑M1/1‑95 (MQ=255) aCTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacac > 1:801877‑M1/1‑88 (MQ=255) ttGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaatgcttgccgatctgcgttgccgctcctgttcagttgg > 1:554718‑M1/1‑85 (MQ=255) cccTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttc < 1:14735‑M1/194‑118 (MQ=255) cccTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtgg < 1:135751‑M1/122‑46 (MQ=255) cccTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgcccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaatgcttgccgatctgcgttgccgctcctgttcagttggtttttccg > 1:391038‑M1/1‑77 (MQ=255) tGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaatgcttgccgatctgcgttgccgctcctgttcagttggtttttccggtttgttat < 1:523264‑M1/249‑184 (MQ=255) ggTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccgagagttttgttctgaattcacgaatgcttgccgatctgcgttgccgctcctgttcagttggtttttccggtttgttattat > 1:433142‑M1/1‑65 (MQ=255) ggTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccc > 1:165269‑M1/1‑65 (MQ=255) ttAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaatgcttgccgatctgcgttgccgctcctgttcagttggtttttccggtttgttattatc < 1:522323‑M1/250‑188 (MQ=255) ttAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaatgcttgccgatctgcgttgccgctcctgttcagttggtttttccggtttgttattatc < 1:833629‑M1/250‑188 (MQ=255) gttttttcaccgAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttc < 1:141834‑M1/57‑5 (MQ=255) cACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaatgcttgccgatctgcgttgccgctcctgttcagttggtttttccggtttgttattatccgggttagttgcc < 1:245608‑M1/251‑201 (MQ=255) cACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaatgcttgccgatctgcgttgccgctcctgttcagttggtttttccggtttgttattatccgggttagttgcc < 1:657885‑M1/251‑201 (MQ=255) aCCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaatgcttgccgatctgcgttgccgctcctgttcagttggtttttccggtttgttattatccgggttagttgcctgttttggt > 1:698374‑M1/1‑42 (MQ=255) aCCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttaattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaatgcttgccgatctgcgttgccgctcctgttcagttggtttttccggcttgttattatccgggttagttgcctgttttggt > 1:371132‑M1/1‑42 (MQ=255) ggCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtt < 1:82099‑M1/119‑83 (MQ=255) ggTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaatgcttgccgatctgcgttgccgctcctgttcagttggtttttccggtttgttattatccgggttagttgcctgttttggttgaaaaaatgcaa > 1:523161‑M1/1‑29 (MQ=255) ggTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggac < 1:375877‑M1/69‑41 (MQ=255) aTTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaatgcttgccgatctgcgttgccgctcctgttcagttggtttttccggtttgttattatccgggttagttgcctgttttggttgaaaaaatgcaattttcggttttgaac < 1:496104‑M1/251‑238 (MQ=255) aTTGAAGCGTCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaatgcttgccgatctgcgttgccgctcctgttcagttggtttttccggtttgttattatccgggttagttgcctgttttggttgaaaaaatgcaattttcggttttgaac < 1:200658‑M1/251‑238 (MQ=255) tCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaatgcttgccgatctgcgttgccgctcctgttcagttggtttttccggtttgttattatccgggttagttgcctgttttggttgaaaaaatgcaattttcggttttgaacatttattgg > 1:8313‑M1/1‑5 (MQ=255) tCCCGgttcattggttaaaaaatgtactttgtccagcccctggacagtggttaaaatttattcaatgagtaaccttaacacaatgtttgaacttcagccaagttatcccaagagttttgttctgaattcacgaatgcttgccgatctgcgttgccgctcctgttcagttggtttttccggtttgttattatccgggttagttgcctgttttggttgaaaaaatgcaattttcggttttgaacatttattgg > 1:61547‑M1/1‑5 (MQ=255) | TCATAATGTCATCCTGTTTAATTAATGGTTAAAAAATGTACTTTGGAAAGCCCCTTTCCAGTGATTAAAATTTGTTCACTGTGCAACCCTAGCACAGTGGTTAAAATTTGCTCACTGTGCAGTCCCCGCACAGTGGTTAAAAAATGTACTTTGTAGAACCCTTCTACAGTGGTTAAAATTTGTTCACCGAGCAACCCTGGCTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGCTTCATTGGTTAAATTTTGTACATTGAAGCGTCCCGGTTCATTGGTTAAAAAATGTACTTTGTCCAGCCCCTGGACAGTGGTTAAAATTTATTCAATGAGTAACCTTAACACAATGTTTGAACTTCAGCCAAGTTATCCCAAGAGTTTTGTTCTGAATTCACGAATGCTTGCCGATCTGCGTTGCCGCTCCTGTTCAGTTGGTTTTTCCGGTTTGTTATTATCCGGGTTAGTTGCCTGTTTTGGTT > 1/1723074‑1723554 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |