| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 2156994 | 0 (0.000) | 84 (1.050) | 58/430 | 0.3 | 100% | intergenic (+58/–) | unknown/– | Mobile element protein/– |
| ? | 4 | 1 = | 0 (0.000) | coding (1/255 nt) | unknown | putative phage‑related membrane protein | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTTTGAAATTTATTGTTTTTTCTTTGATTTATCTTTGCATTCAAGAAGTTGTGCCATTGCTTTTAGATATTTTTGTCGGTGATAAATTTGATGAAATTAAACAGCTTTTGGGTCAGGTGCCGGAGAATGTGGCTTATATTTTAAAAATGTTCCGCGTTGATTTTGCTTTTAAGGTGGTTTTAAGCGCTTATCTTATGCGTTTTGTTATTCGCCGCATTCCGATTATAG > 4/1‑250 | tttattatcagcaagttaaacacgattatcgtgagataaaagaaactatcttgttgcggtataaaaagaacagaaaacgagatggctatcgcccaatgacactcaaattacgtcaaatgggttctcctgttttcactctcctttggtcttcattggctttgattattattctttcggcgtaggtggtgtatggttaagttaattattggctggatagctaaaaattcaggcggattgcttAAATGGCtttt > 1:498890‑M2/241‑251 (MQ=255) 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1:810082‑M2/116‑250 (MQ=255) cctgttttcactctcctttggtcttcattggctttgattattattctttcggcgtaggtggtgtatggttaagttaattattggctggatagctaaaaattcaggcggattgcttAAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTTTGAAATTTATTGTTTTTTCTTTGATTTATCTTTGCATTCAAGAAGTTGTGCCATTGCTTTTAGATATTTTTGTCGGTGATAAATTTGATGAAATTAAACAGCTTTTGGGt > 1:811529‑M2/116‑250 (MQ=255) ctgttttcactctcctttggtcttcattggctttgattattattctttcggcgtaggtggtgtatggttaagttaattattggctggatagctaaaaattcaggcggattgcttAAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTTTGaaa > 1:849131‑M2/115‑144 (MQ=255) gttttcactctcctttggtcttcattggctttgattattattctttcggcgtaggtggtgtatggttaagttaattattggctggatagctaaaaattcaggcggattgcttAAATg > 1:242312‑M2/113‑117 (MQ=255) gttttcactctcctttggtcttcattggctttgattattattctttcggcgtaggtggtgtatggttaagttaattattggctggatagctaaaaattcaggcggattgcttAAATGGCttttt > 1:832381‑M2/113‑124 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |