| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 2156994 | 0 (0.000) | 84 (1.050) | 58/430 | 0.3 | 100% | intergenic (+58/–) | unknown/– | Mobile element protein/– |
| ? | 4 | 1 = | 0 (0.000) | coding (1/255 nt) | unknown | putative phage‑related membrane protein | |||||
TTTATTATCAGCAAGTTAAACACGATTATCGTGAGATAAAAGAAACTATCTTGTTGCGGTATAAAAAGAACAGAAAACGAGATGGCTATCGCCCAATGACACTCAAATTACGTCAAATGGGTTCTCCTGTTTTCACTCTCCTTTGGTCTTCATTGGCTTTGATTATTATTCTTTCGGCGTAGGTGGTGTATGGTTAAGTTAATTATTGGCTGGATAGCTAAAAATTCAGGCGGATTGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/2156755‑2156994‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTTTGAAATTTATTGTTTTTTCTTTGATTTATCTTTGCATTCAAGAAGTTGTGCCATTGCTTTTAGATATTTTTGTCGGTGATAAATTTGATGAAATTAAACAGCTTTTGGGTCAGGTGCCGGAGAATGTGGCTTATATTTTAAAAATGTTCCGCGTTGATTTTGCTTTTAAGGTGGTTTTAAGCGCTTATCTTATGCGTTTTGTTATTCGCCGCATTCCGATTATAG > 4/1‑250 TTTATTATCAGCAAGTTAAACACGATTATCGTGAGATAAAAGAAACTATCTTGTTGCGGTATAAAAAGAACAGAAAACGAGATGGCTATCGCCCAATGACACTCAAATTACGTCAAATGGGTTCTCCTGTTTTCACTCTCCTTTGGTCTTCATTGGCTTTGATTATTATTCTTTCGGCGTAGGTGGTGTATGGTTAAGTTAATTATTGGCTGGATAGCTAAAAATTCAGGCGGATTGCTTAAATGGCTTTT > 1:498890/1‑251 ATTATCAGCAAGTTAAACACGATTATCGTGAGATAAAAGAAACTATCTTGTTGCGGTATAAAAAGAACAGAAAACGAGATGGCTATCGCCCAATGACACTCAAATTACGTCAAATGGGTTCTCCTGTTTTCACTCTCCTTTGGTCTTCATTGGCTTTGATTATTATTCTTTCGGCGTAGGTGGTGTATGGTTAAGTTAATTATTGGCTGGATAGCTAAAAATTCAGGCGGATTGCTTAAATGGCTTTTTGA > 1:690578/1‑251 GTTAAACACGATTATCGTGAGATAAAAGAAACTATCTTGTTGCGGTATAAAAAGAACAGAAAACGAGATGGCTATCGCCCAATGACACTCAAATTACGTCAAATGGGTTCTCCTGTTTTCACTCTCCTTTGGTCTTCATTGGCTTTGATTATTATTCTTTCGGCGTAGGTGGTGTATGGTTAAGTTAATTATTGGCTGGATAGCTAAAAATTCAGGCGGATTGCTTAAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTT > 1:701626/1‑251 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GTTAATTATTGGCTGGATAGCTAAAAATTCAGGCGGATTGCTTAAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTTTGAAATTTATTGTTTTTTCTTTGATTTATCTTTGCATTCAAGAAGTTGTGCCATTGCTTTTAGATATTTTTGTCGGTGATAAATTTGATGAAATTAAACAGCTTTTGGGTCAGGTGCCGGAGAATGTGGCTTATATTTTAAAAATGTTCCGCGTTGATTTTGCTTTTAAGGTGGTTT > 1:579532/1‑245 ATTATTGGCTGGATAGCTAAAAATTCAGGCGGATTGCTTAAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTTTGAAATTTATTGTTTTTTCTTTGATTTATCTTTGCATTCAAGAAGTTGTGCCATTGCTTTTAGATATTTTTGTCGGTGATAAATTTGATGAAATTAAACAGCTTTTGGGTCAGGTGCCGGAGAATGTGGCTTATATTTTAAAAATGTTCCGCGTTGATTTTGCTTTTAAGGTGGTTTTAAGTGCTTA > 1:816900/1‑251 TATTGGCTGGATAGCTAAAAATTCAGGCGGATTGCTTAAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTTTGAAATTTATTGTTTTTTCTTTGATTTATCTTTGCATTCAAGAAGTTGTGCCATTGCTTTTAGATATTTTTGTCGGTGATAAATTTGATGAAATTAAACAGCTTTTGGGTCAGGTGCCGGAGAATGTGGCTTATATTTTAAAAATGTTCCGCGTTGATTTTGCTTTTAAGGTGGTTTTAAGTGCTTAcc < 1:793961/251‑3 TATTGGCTGGATAGCTAAAAATTCAGGCGGATTGCTTAAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTTTGAAATTTATTGTTTTTTCTTTGATTTATCTTTGCATTCAAGAAGTTGTGCCATTGCTTTTAGATATTTTTGTCGGTGATAAATTTGATGAAATTAAACAGCTTTTGGGTCAGGTGCCGGAGAATGTGGCTTATATTTTAAAAATGTTCCGCGTTGATTTTGCTTTTAAGGTGGTTTTAAGTGCTTAcc < 1:642908/251‑3 TGGCTGGATAGCTAAAAATTCAGGCGGATTGCTTAAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTTTGAAATTTATTGTTTTTTCTTTGATTTATCTTTGCATTCAAGAAGTTGTGCCATTGCTTTTAGATATTTTTGTCGGTGATAAATTTGATGAAATTAAACAGCTTTTGGGTCAGGTGCCGGAGAATGTGGCTTATAT > 1:491181/1‑195 TGGCTGGATAGCTAAAAATTCAGGCGGATTGCTTAAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTTTGAAATTTATTGTTTTTTCTTTGATTTATCTTTGCATTCAAGAAGTTGTGCCATTGCTTTTAGATATTTTTGTCGGTGATAAATTTGATGAAATTAAACAGCTTTTGGGTCAGGTGCCGGAGAATGTGGCTTATAT > 1:853239/1‑195 GGATAGCTAAAAATTCAGGCGGATTGCTTAAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTTTGAAATTTATTGTTTTTTCTTTGATTTATCT > 1:351556/1‑85 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TGCTTAAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTTTGAAATTTATTGTTTTTTCTTTGATTTATCTTTGCATTCAAGAAGTTGTGCCATTGCTTTTAGATATTTTTGTCGGTGATAAATTTGATGAAATTAAACAGCTTTTGGGTCAGGTGCCGGAGAATGTGGCTTATATTTTAAAAATGTTCCGCGTTGATTTTGCTTTTAAGGTGGTTTTAAGTGCTTACCTTATGCGTTTTGTTATTCGTCGTATTCCGATT < 1:124254/251‑1 GCTTAAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTTTGAAATTTATTGTTTTTTCTTTGATTTATCTTTGCATTCAAGAAGTTGTGCCATTGCTTTTAGATATTTTTGTCGGTGATAAATTTGATGAAATTAAACAGCTTTTGGGTCAGGTGCCGGAGAATGTGGCTTATATTTTAAAAATGTTCCGCGTTGATTTTGCTTTTAAGGTGGTTTTAAGTGCTTACCTTATGCG < 1:34778/225‑1 GCTTAAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTTTGAAATTTATTGTTTTTTCTTTGATTTATCTTTGCATTCAAGAAGTTGTGCCATTGCTTTTAGATATTTTTGTCGGTGATAAATTTGATGAAATTAAACAGCTTTTGGGTCAGGTGCCGGAGAATGTGGCTTATATTTTAAAAATGTTCCGCGTTGATTTTGCTTTTAAGG > 1:834398/1‑200 GCTTAAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTTTGAAATTTATTGTTTTTTCTTTGATTTATC > 1:719578/1‑59 TAAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTTTGAAATTTATTGTTTTTTCTTTGATTTATCTTTGCATTCAAGAAGTTGTGCCATTGCTTTTAGATATTTTTGTCGGTGATAAATTTGATGAAATTAAACAGCTTTTGGGTCAGGTGCCGGAGAATGTGGCTTATATTTTAAAAATGTTCCGCGTTGATTTTGCTTTTAAGGTGGTTTTAAGTGCTTACCTTATGCGTTTTGTTATTCGTCGTATTCCGATTATAG < 1:621954/251‑1 TTTATTATCAGCAAGTTAAACACGATTATCGTGAGATAAAAGAAACTATCTTGTTGCGGTATAAAAAGAACAGAAAACGAGATGGCTATCGCCCAATGACACTCAAATTACGTCAAATGGGTTCTCCTGTTTTCACTCTCCTTTGGTCTTCATTGGCTTTGATTATTATTCTTTCGGCGTAGGTGGTGTATGGTTAAGTTAATTATTGGCTGGATAGCTAAAAATTCAGGCGGATTGCTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 1/2156755‑2156994‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AAATGGCTTTTTGATTCGGTTGTTTTGAAATTTATTGTTTTTTCTTTGATTTATCTTTGCATTCAAGAAGTTGTGCCATTGCTTTTAGATATTTTTGTCGGTGATAAATTTGATGAAATTAAACAGCTTTTGGGTCAGGTGCCGGAGAATGTGGCTTATATTTTAAAAATGTTCCGCGTTGATTTTGCTTTTAAGGTGGTTTTAAGCGCTTATCTTATGCGTTTTGTTATTCGCCGCATTCCGATTATAG > 4/1‑250 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |