| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
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| ? | 1 | 788185 = | 157 (1.930) | coding (634/1437 nt) | unknown | Pantothenate:Na+ symporter (TC 2.A.21.1.1) | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
AACGCCGCCAAACCGAACACCAGCGCCGGGACAATAGGGTTGAAGCCGAATAATTTAATGCCGAATTGGGTGAGCAAAATAAATGAGATTAAGCCTGCTAACATGGAGCTGATCGCGCCGTAGGCATTGGCTTTATCCCAATATAAGCCGAATATGATGGCCCACAAAAATGCCGCTTCCAACCCACCGAA‑GGCAAACAGATTCAGCCAAATGATCATATCCGGCGGATTGAGGGAGGCGAAGATTAAAAGTGCGGTCAAAATTAACGTAATTATTGAGGAGATTCGCCCGATACGTTTTTGATTTTGCGCCGCCTGTGGTTTTGTCGCTAAATATAAATCCTTCACGAAAATGGAAGAAGATTGAATCAGCTGCGCATCCACCGTAGACATGATTGCCGACATCGGCGCGGCAAGGAAAATGCCCGCGACGATAGGCGGTAACACTTGTAACATTAGGCTTGGAATGACTTTGTCCGACACTGTTAAAGCCGGCACT > 1/787428‑787925 | aaCGCCGCCAAACCGAACACCAGCGCCGGGACAATAGGGTTGAAGCCGAATAATTTAATGCCGAATTGGGTGAGCAAAATAAATGAGATTAAGCCTGCTAACATGGAGCTGATCGCGCCGTAGGCATTGGCTTTATCCCAATATAAGCCGAATATGATGGCCCACAAAAATGCCGCTTCCAACCCACCGAA‑GGCAAACAGATTCAGCCAAATGATCATATCCGGCGGATTGAGGGAGGCGAAGATTAAAAg < 1:23332/251‑1 (MQ=255)aaCGCCGCCAAACCGAACACCAGCGCCGGGACAATAGGGTTGAAGCCGAATAATTTAATGCCGAATTGGGTGAGCAAAATAAATGAGATTAAGCCTGCTAACATGGAGCTGATCGCGCCGTAGGCATTGGCTTTATCCCAATATAAGCCGAATATGATGGCCCACAAAAATGCCGCTTCCAACCCACCGAA‑GGCAAACAGATTCAGCCAAATGATCATATCCGGCGGATTGAGGGAGGCGAAGATTAAAAg < 1:500722/251‑1 (MQ=255) cgccgcCAAACCGAACACCAGCGCCGGGACAATAGGGTTGAAGCCGAATAATTTAATGCCGAATTGGGTGAGCAAAATAAATGAGATTAAGCCTGCTAACATGGAGCTGATCGCGCCGTAGGCATTGGCTTTATCCCAATATAAGCCGAATATGATGGCCCACAAAAATGCCGCTTCCAACCCACCGAA‑GGCAAACAGATTCAGCCAAATGATCATATCCGGCGGATTGAGGGAGGCGAAGATTAAAAGTg < 1:670397/251‑1 (MQ=255) gAACACCAGCGCCGGGACAATAGGGTTGAAGCCGAATAATTTAATGCCGAATTGGGTGAGCAAAATAAATGAGATTAAGCCTGCTAACATGGAGCTGATCGCGCCGTAGGCATTGGCTTTATCCCAATATAAGCCGAATATGATGGCCCACAAAAATGCCGCTTCCAACCCACCGAA‑GGCAAACAGATTCAGCCAAATGATCATATCCGGCGGATTGAGGGAGGCGAAGATTAAAAGTGCGGTCAAAATTa > 1:833591/1‑251 (MQ=255) ccGGGACAATAGGGTTGAAGCCGAATAATTTAATGCCGAATTGGGTGAGCAAAATAAATGAGATTAAGCCTGCTAACATGGAGCTGATCGCGCCGTAGGCATTGGCTTTATCCCAATATAAGCCGAATATGATGGCCCACAAAAATGCCGCTTCCAACCCACCGAA‑GGCAAACAGATTCAGCCAAATGATCATATCCGGCGGATTGAGGGAGGCGAAGATTAAAAGTGCGGTCAAAATTAACGTAattat < 1:216848/250‑1 (MQ=255) ggACAATAGGGTTGAAGCCGAATAATTTAATGCCGAATTGGGTGAGCAAAATAAATGAGATTAAGCCTGCTAACATGGAGCTGATCGCGCCGTAGGCATTGGCTTTATCCCAATATAAGCCGAATATGATGGCCCACAAAAATGCCGCTTCCAACCCACCGAA‑GGCAAACAGATTCAGCCAAATGATCATATCCGGCGGATTGAGGGAGGCGAAGATTAAAAg > 1:729457/1‑223 (MQ=255) ggACAATAGGGTTGAAGCCGAATAATTTAATGCCGAATTGGGTGAGCAAAATAAATGAGATTAAGCCTGCTAACATGGAGCTGATCGCGCCGTAGGCATTGGCTTTATCCCAATATAAGCCGAATATGATGGCCCACAAAAATGCCGCTTCCAACCCACCGAA‑GGCAAACAGATTCAGCCAAATGATCATATCCGGCGGATTGAGGGAGGCGAAGATTAAAAGTGCGGTCAAAATTAACGTAATTATTgag > 1:56494/1‑251 (MQ=255) ggACAATAGGGTTGAAGCCGAATAATTTAATGCCGAATTGGGTGAGCAAAATAAATGAGATTAAGCCTGCTAACATGGAGCTGATCGCGCCGTAGGCATTGGCTTTATCCCAATATAAGCCGAATATGATGGCCCACAAAAATGCCGCTTCCAACCCACCGAA‑GGCAAACAGATTCAGCCAAATGATCATATCCGGCGGATTGAGGGAGGCGAAGATTAAAAGTGCGGTCAAAATTAACGTAATTATTgag > 1:319482/1‑251 (MQ=255) aCAATAGGGTTGAAGCCGAATAATTTAATGCCGAATTGGGTGAGCAAAATAAATGAGATTAAGCCTGCTAACATGGAGCTGATCGCGCCGTAGGCATTGGCTTTATCCCAATATAAGCCGAATATGATGGCCCACAAAAATGCCGCTTCCAACCCACCGAA‑GGCAAACAGATTCAGCCAAATGATCATATCCGGCGGATTGAGGGAGGCGAAGATTAAAAGTGCGGTCAAAATTAACGTAATTATTgagg < 1:41822/250‑1 (MQ=255) cAATAGGGTTGAAGCCGAATAATTTAATGCCGAATTGGGTGAGCAAAATAAATGAGATTAAGCCTGCTAACATGGAGCTGATCGCGCCGTAGGCATTGGCTTTATCCCAATATAAGCCGAATATGATGGCCCACAAAAATGCTGCTTCCAACCCACCGAA‑GGCAAACAGATTCAGCCAAATGATCATATCCGGCGGATTGAGGGAGGCGAAGATTAAAAg < 1:366074/220‑1 (MQ=255) 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> 1:196386/1‑223 (MQ=255) gAATATGATGGCCCACAAAAATGCCGCTTCCAACCCACCGAA‑GGCAAACAGATTCAGCCAAATGATCATATCCGGCGGATTGAGGGAGGCGAAGATTAAAAGTGCGGTCAAAATTAACGTAATTATTGAGGAGATTCGCCCGATACGTTTTTGATTTTGCGCCGCCTGTGGTTTTGTCGCTAAATATAAATCCTTCACGAAAATGGAAGAAGATTGAATCAGCTGCGCAt > 1:214595/1‑230 (MQ=255) gAATATGATGGCCCACAAAAATGCCGCTTCCAACCCACCGAA‑GGCAAACAGATTCAGCCAAATGATCATATCCGGCGGATTGAGGGAGGCGAAGATTAAAAGTGCGGTCAAAATTAACGTAATTATTGAGGAGATTCGCCCGATACGTTTTTGATTTTGCGCCGCCTGTGGTTTTGTCGCTAAATATAAATCCTTCACGAAAATGGAAGAAGATTGAATCAGCTGCGCATCCACCGTAGACATGATTGCCg > 1:477770/1‑251 (MQ=255) gAATATGATGGCCCACAAAAATGCCGCTTCCAACCCACCGAA‑GGCAAACAGATTCAGCCAAATGATCATATCCGGCGGATTGAGGGAGGCGAAGATTAAAAGTGCGGTCAAAATTAACGTAATTATTGAGGAGATTCGCCCGATACGTTTTTGATTTTGCGCCGCCTGTGGTTTTGTCGCTAAATATAAATCCTTCACGAAAATGGAAGAAGATTGAATCAGCTGCGCATCCACCGTAGACATGATTGCCg > 1:143920/1‑251 (MQ=255) 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1:435452/250‑1 (MQ=255) aaCAGATTCAGCCAAATGATCATATCCGGCGGATTGAGGGAGGCGAAGATTAAAAGTGCGGTCAAAATTAACGTAATTATTGAGGAGATTCGCCCGATACGTTTTTGATTTTGCGCCGCCTGTGGTTTTGTCGCTAAATATAAATCCTTCACGAAAATGGAAGAAGATTGAATCAGCTGCGCATCCACCGTAGACATGATTGCCGACATCGGCGCGGCAAGGAAAATGCCCGCGACGATAGGCGGTAacac < 1:245302/251‑1 (MQ=255) gATTCAGCCAAATGATCATATCCGGCGGATTGAGGGAGGCGAAGATTAAAAGTGCGGTCAAAATTAACGTAATTATTGAGGAGATTCGCCCGATACGTTTTTGATTTTGCGCCGCCTGTGGTTTTGTCGCTAAATATAAATCCTTCACGAAAATGGAAGAAGATTGAATCAGCTGCGCATCCACCGTAGACATGATTGCCGACATCGGCGCGGCAAGGAAAATGCCCGCGACGATAGGCGGTAACACTTGt > 1:289335/1‑251 (MQ=255) gCCAAATGATCATATCCGGCGGATTGAGGGAGGCGAAGATTAAAAGTGCGGTCAAAATTAACGTAATTATTGAGGAGATTCGCCCGATACGTTTTTGATTTTGCGCCGCCTGTGGTTTTGTCGCTAAATATAAATCCTTCACGAAAATGGAAGAAGATTGAATCAGCTGCGCATCCACCGTAGACATGATTGCCGACATCGGCGCGGCAAGGAAAATGCCCGCGACGATAGGCGGTAACACTTGTAACAtt > 1:192755/1‑251 (MQ=255) 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aaaGTGCGGTCAAAATTAACGTAATTATTGAGGAGATTCGCCCGATACGTTTTTGATTTTGCGCCGCCTGTGGTTTTGTCGCTAAATATAAATCCTTCACGAAAATGGAAGAAGATTGAATCAGCTGCGCATCCACCGTAGACATGATTGCCGACATCGGCGCGGCAAGGAAAATGCCCGCGACGATAGGCGGTAACACTTGTAACATTAGGCTTGGAATGACTTTGTCCGACACTGTTAAAGCCGGCACt < 1:802613/251‑1 (MQ=255) | AACGCCGCCAAACCGAACACCAGCGCCGGGACAATAGGGTTGAAGCCGAATAATTTAATGCCGAATTGGGTGAGCAAAATAAATGAGATTAAGCCTGCTAACATGGAGCTGATCGCGCCGTAGGCATTGGCTTTATCCCAATATAAGCCGAATATGATGGCCCACAAAAATGCCGCTTCCAACCCACCGAA‑GGCAAACAGATTCAGCCAAATGATCATATCCGGCGGATTGAGGGAGGCGAAGATTAAAAGTGCGGTCAAAATTAACGTAATTATTGAGGAGATTCGCCCGATACGTTTTTGATTTTGCGCCGCCTGTGGTTTTGTCGCTAAATATAAATCCTTCACGAAAATGGAAGAAGATTGAATCAGCTGCGCATCCACCGTAGACATGATTGCCGACATCGGCGCGGCAAGGAAAATGCCCGCGACGATAGGCGGTAACACTTGTAACATTAGGCTTGGAATGACTTTGTCCGACACTGTTAAAGCCGGCACT > 1/787428‑787925 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |