| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP028101 | = 1378569 | 168 (1.200) | 4 (0.030) | 4/414 | 3.6 | 2.7% | coding (229/561 nt) | C7Y58_06605 | chromate transporter |
| ? | CP028101 | = 1378689 | 127 (0.970) | coding (349/561 nt) | C7Y58_06605 | chromate transporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
ATAAAAAGAAATGGTTAGATCATGAAGAATTTTTAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGTATATAGGATAGGTAAGTCTGCTAATATAAATAGATATAATTTTTTAATACCACTTATAGTTGCTATATTGATTAGATATTTTGGAGTTTCTCCTATTATTGTTATAATAGCTACTATGATACTTGGAAATATTTTCTATATATTAAAAGAGAAAAAAGAAGATGATAGGAAATGACATATTTTGATTTATTTTTTGTATTTTT > CP028101/1378450‑1378929 | ataaAAAGAAATGGTTAGATCATGAAGAATTTTTAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTg > 2:194677/1‑249 (MQ=255) tGGTTAGATCATGAAGAATTTTTAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCa > 1:350984/1‑249 (MQ=255) ctgTTAGATCATGAAGAATTTTTAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTTGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGTAATATTTAATGGGGTACAAACTGCTATTACAGCa > 2:371696/3‑249 (MQ=255) ggTTAGATCATGAAGAATTTTTAGCTGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAGAACCTGCTATTACAGCACtt > 2:703533/1‑251 (MQ=255) ggTTAGATCATGAAGAATTTTTAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACtt > 2:288161/1‑251 (MQ=255) ggTTAGATCATGAAGAATTTTTAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACtt > 2:433627/1‑251 (MQ=255) ggTTAGATCATGAAGAATTTTTAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACtt > 1:343114/1‑251 (MQ=255) aGATCATGAAGAATTTTTAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTtata > 1:115594/1‑250 (MQ=255) aTCATGCAGCATTTTTAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTTCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATAc < 2:378824/249‑1 (MQ=255) aTCATGAAGAATTTTTAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATAc < 2:609057/249‑1 (MQ=255) aTCATGAAGAATTTTTAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATAc < 1:288161/249‑1 (MQ=255) aTCATGAAGAATTTTTAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTg < 2:410203/251‑1 (MQ=255) aTGAAGAATTTTTAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCTCAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGAtt < 2:512616/251‑1 (MQ=255) aaTTTTTAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGt < 1:437181/250‑1 (MQ=255) aTTTTTAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGTGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGtat < 1:429477/251‑1 (MQ=255) aTTTTTAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGtat < 2:343114/251‑1 (MQ=255) tttttAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATGTATCTCTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGtata < 2:524166/251‑1 (MQ=255) tttAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGtatata < 2:115594/251‑1 (MQ=255) tAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGTGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGTATatagg < 2:232397/251‑1 (MQ=255) tAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGTATatagg < 2:666786/251‑1 (MQ=255) tAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGCATatagg < 1:703533/251‑1 (MQ=255) tAGATGGGATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATCTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGTATatagg < 1:646210/251‑1 (MQ=255) tGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAg < 2:647264/221‑1 (MQ=255) tGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTCTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAg > 1:647264/1‑221 (MQ=255) ggTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGTATataggatagg > 2:34827/1‑251 (MQ=255) 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2:176388/1‑147 (MQ=255) atTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGTATATAGGATAGGTAAGTCTGCTAATATAAATAGATATAATTTTTTAATACCACTTATAGTTGCTATATTGATTAGATATTTTGGAGTTTCTCCTATTATTGTTATAATAGCTACTATGATACTTGGAAATATTTTCTATATATTAAAAGAGAAAAaag > 2:622952/1‑206 (MQ=255) atTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGTATATAGGATAGGTAAGTCTGCTAATATAAATAGATATAATTTTTTAATACCACTTATAGTTGCTATATTGATTAGATATTTTGGAGTTTCTCCTATTATTGTTATAATAGCTACTATGATACTTGGAAATATTTTCTATATATTAAAAGAGAAAAAAGAAGATGATAGGAAATGACATATTTTGATTTATTTTTTGTAttttt > 2:362449/1‑251 (MQ=255) agttAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGTATATAGGATAGGTAAGTCTGCTAATATAAATAGATATAATTTTTTAATACCACTTATAGTTGCTATATTGATTAGATATTTTGGAGTTTCTCCTATTATTGTTATAATAGCTACTATGATACTTGGAAATATTTTCTATATATTAAAAGAGAAAAaag < 1:622952/204‑1 (MQ=255) | ATAAAAAGAAATGGTTAGATCATGAAGAATTTTTAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGTATATAGGATAGGTAAGTCTGCTAATATAAATAGATATAATTTTTTAATACCACTTATAGTTGCTATATTGATTAGATATTTTGGAGTTTCTCCTATTATTGTTATAATAGCTACTATGATACTTGGAAATATTTTCTATATATTAAAAGAGAAAAAAGAAGATGATAGGAAATGACATATTTTGATTTATTTTTTGTATTTTT > CP028101/1378450‑1378929 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |