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| ? | CP028101 | = 1378689 | 127 (0.970) | coding (349/561 nt) | C7Y58_06605 | chromate transporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
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2:626530/1‑251 (MQ=255) atatAAAGTAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCAT‑GGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGTATATAGGATAGGTAAGTCTGCTAATATAAATAGATATAATTTTTTAATACCACTTATAGTTGCTATATTGATTAg > 1:713562/1‑251 (MQ=255) atatAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGTATataggat < 1:259039/186‑1 (MQ=255) atatAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGTATATAGGATAGGTAAGTc > 2:654947/1‑195 (MQ=255) atatAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGTATATAGGATAGGTAAGTc < 1:654947/195‑1 (MQ=255) 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2:529888/1‑165 (MQ=255) ttttATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGTATATAGGATAGGTAAGTCTGCTAATATAAATAGATATAAt < 1:487367/202‑1 (MQ=255) aTGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGTATatagg < 1:140800/165‑1 (MQ=255) | AGTTAAAAAAGGATAAAAATGAATAGAAATAGAATTATAGAAATTTTTATATTATTTTTTAAAATAGGGGCATTTACTATTGGAGGAGGCTATGCAATGCTTTCTCTAATAGAAGATGAAATTGTTAATAAAAAGAAATGGTTAGATCATGAAGAATTTTTAGATGGTATGGCTATTGCTCAGTCAACTCCTGGAGTACTCGCTGTTAATATATCACTTATCACAGGATATAAAATAGCAGGTTTTATGGGTATGTTTGCAGGTATGCTAGGAGCAGTTTTGCCATCTTTTTTTATAGTTTTATTTTTAAGTCAAATACTATTAGCTTATGGGAATCATCCATTGGTTGTAGCAATATTTAATGGGGTAAAACCTGCTATTACAGCACTTATACTGATTTCTGTATATAGGATAGGTAAGTCTGCTAATATAAATAGATATAATTTTTTAATACCACTTATAGTTGCTATATTGATTAGA > CP028101/1378323‑1378802 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |