| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP028101 | = 134236 | 220 (1.570) | 3 (0.020) | 3/420 | 3.8 | 1.2% | coding (363/534 nt) | C7Y58_00665 | 50S ribosomal protein L6 |
| ? | CP028101 | = 134652 | 280 (2.100) | coding (370/399 nt) | C7Y58_00670 | 30S ribosomal protein S8 | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
TTTGTCTTGATGCTTTTCTATCAACTTTTTTAAACAACTGTCTTACCTCCTTTTTAAGCTATTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTACCCAACCCCTACCAAAGTAAGAGTTTTTCTATATCCTTCATGTACACCTTTAACCATATTATTGATTAAGGCTCTTGTTGTTCCATGAATTGCTCTCATAAATGGTTCATCATTAGGTCTTTCAACTGTGATATGCCCATCTTCTAATTTTATAG > CP028101/134002‑134474 | tttGTCTTGATGCTTTTCTATCAACTTTTTTAAACAACTGTCTTACCTCCTTTTTAAGCTATTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTtcat < 2:162566/251‑1 (MQ=255) tCTTGATGCTTTTCTATCAACTTTTTTAAACAACTGTCTTACCTCCTTTTTAAGCTATTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAAt > 2:257798/1‑251 (MQ=255) aTGCTTTTCTATCAACTTTTTTAAACAACTGTCTTACCTCCTTTTTAAGCTATTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTa > 2:55938/1‑251 (MQ=255) aTCAACTTTTTTAAACAACTGTCTTACCTCCTTTTTAAGCTATTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTcc > 1:687686/1‑221 (MQ=255) aCTTTTTTAAACAACTGTCTTACCTCCTTTTTAAGCTATTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAatat < 1:625608/251‑1 (MQ=255) ttttttAAACAACTGTCTTACCTCCTTTTTAAGCTATTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATcc < 1:421598/251‑1 (MQ=255) ttttttAAACAACTGTCTTACCTCCTTTTTAAGCTATTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATcc < 2:501135/251‑1 (MQ=255) aaaCAACTGTCTTACCTCCTTTTTAAGCTATTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACCTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGa > 2:477610/1‑251 (MQ=255) aacaacTGTCTTACCTCCTTTTTAAGCTATTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGat < 1:144916/251‑1 (MQ=255) caacTGTCTTACCTCCTTTTTAAGCTATTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGatat > 2:15163/1‑251 (MQ=255) caacTGTCTTACCTCCTTTTTAAGCTATTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATCGATAGTAGTATTCTTATCAACAGAAAAAGTTATTACAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGatat > 1:609655/1‑251 (MQ=255) gTCTTACCTCCTTTTTAAGCTATTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTAc < 1:458467/222‑1 (MQ=255) gTCTTACCTCCTTTTTAAGCTATTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTa > 1:25869/1‑251 (MQ=255) tACCTCCTTTTTAAGCTATTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATcc < 1:160913/251‑1 (MQ=255) tttttAAGCTATTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTccc < 1:363403/251‑1 (MQ=255) aTTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATg > 2:90805/1‑196 (MQ=255) aTTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATg < 1:90805/196‑1 (MQ=255) aTTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTc < 2:664740/228‑1 (MQ=255) aTTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTtg > 1:171187/1‑248 (MQ=255) aCTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTggg < 2:312320/197‑1 (MQ=255) aCTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTAc < 2:66631/251‑1 (MQ=255) aCTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTAc < 2:65486/251‑1 (MQ=255) ttACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTACCCAAc < 1:58958/251‑1 (MQ=255) 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cATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTACCCAACCCCTACCAAAGTAAGAGTTTTTCTATATcc < 1:230909/250‑1 (MQ=255) atTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTACCCAACCCCTACCAAAGTAAGAGTTTTTCTATATCCTTCa > 1:373967/1‑251 (MQ=255) tttAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTACCCAACCCCTACCAAAGTAAGAGTTTTTCTATATCCTTCAt > 1:165244/1‑251 (MQ=255) tAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTACCCAACCCCTACCAAAGTAAGAGTTTTTCTATATCCTTCATGt < 2:171187/251‑1 (MQ=255) ccccTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACGGGGTGAGAATATCCTAAAGAGATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTACCCAACCCCTACCAAAGTAAGAGTTTTTCTATATCCTTCATGTaca > 1:567346/1‑251 (MQ=255) cccTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTACCCAACCCCTACCAAAGTAAGAGTTTTTCTATATCCTTCATGTacac < 1:671773/251‑1 (MQ=255) ccttttcctttaTATGGTTCAGGTTGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTACCCAACCCCTACCAAAGTAAGAGTTTTTCTATATCCTTCATGTACAcc < 1:102545/251‑1 (MQ=255) cctttacctttaTATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTAc < 2:415382/204‑1 (MQ=255) ctttacctttaTATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTACCCAACCCCTACCAAAGTAAGAGTTTTTCTATATCCTTCATGTac < 2:114282/247‑1 (MQ=255) ctttacctttaTATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTACCCAACCCCTACCAAAGTAAGAGTTTTTCTATATCCTTCATGTac > 1:114282/1‑247 (MQ=255) acctttaTATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTAc > 2:364952/1‑199 (MQ=255) acctttaTATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTACCCAACCCCTACCAAAGTAAGAGTTTTTCTATATCCTTCATGTac > 2:249026/1‑243 (MQ=255) cctttaTATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGt < 2:221224/123‑1 (MQ=255) cctttaTATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGctc > 1:98219/1‑193 (MQ=255) cctttaTATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTACCCAAccc < 1:662682/205‑1 (MQ=255) cctttaTATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTACCCAACCCCTACCAAAGTAAGAGTTTTTCTATATCCTTCATGTac > 1:107476/1‑242 (MQ=255) cctttaTATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTACCCAACCCCTACCAAAGTAAGAGTTTTTCTATATCCTTCATGTACACCTTTaa > 1:249828/1‑250 (MQ=255) cctttaTATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTACCCAACCCCTACCAAAGTAAGAGTTTTTCTATATCCTTCATGTACACCTTTaa > 1:254203/1‑250 (MQ=255) cctttaTATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATAGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTACCCAACCCCTACCAAAGTAagag < 2:489641/220‑1 (MQ=255) ctttaTATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGTATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTACCCAACCCCTACCAAAGTAAGAGTTTTTCTATATCCTTCATGTACACCTTTAAcc < 2:615443/251‑1 (MQ=255) 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1:489998/1‑154 (MQ=255) | TTTGTCTTGATGCTTTTCTATCAACTTTTTTAAACAACTGTCTTACCTCCTTTTTAAGCTATTTTAAGACTTTTTACCTTCTTTTCTTCTAATATGTTCATCAGCATATTTAACCCCTTTACCTTTATATGGTTCAGGTGGTCTCTTAGCTCTAATGTTAGCTGCAACTTGACCTACTAATTCTTTTTCTACTCCATCTATATGGATAGTAGTATTCTTTTCAACAGAAAAAGTTATTCCAGGTATTTCATCAATGATTACTGGGTGAGAATATCCTAAAGATATTTCTAATCCTTTTCCCTTAGTTGCTGCTCTGTACCCAACCCCTACCAAAGTAAGAGTTTTTCTATATCCTTCATGTACACCTTTAACCATATTATTGATTAAGGCTCTTGTTGTTCCATGAATTGCTCTCATAAATGGTTCATCATTAGGTCTTTCAACTGTGATATGCCCATCTTCTAATTTTATAG > CP028101/134002‑134474 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |