| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP028101 | 1754063 = | 192 (0.830) | 4 (0.020) | 4/266 | 15.3 | 2.3% | intergenic (+8/‑60) | C7Y58_08530/C7Y58_08535 | RNA 2'‑phosphotransferase/excinuclease ABC subunit UvrA |
| ? | CP028101 | 1754096 = | 167 (0.810) | intergenic (+41/‑27) | C7Y58_08530/C7Y58_08535 | RNA 2'‑phosphotransferase/excinuclease ABC subunit UvrA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
TCTTGAAATTGATACAGAGGCTATGTTAAAAGAAAATTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAATTTAAAAAATATAGATATTGAGCTTCCTAAAAATG > CP028101/1753947‑1754243 | tCTTGAAATTGATACAGAGGCTATGTTAAAAGAAAATTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCtttt > 1:1506830/1‑150 (MQ=255) ttGAAATTGATACAGAGGCTATGTTAAAAGAAAATTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCtttttt > 1:2923918/1‑150 (MQ=255) aaaTTGATACAGAGGCTATGTTAAAAGAAAATTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTttat < 1:2034564/150‑1 (MQ=255) aTTGATACAGAGGCTATGTTAAAAGAAAATTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTttatta > 1:338698/1‑150 (MQ=255) ttGATACAGAGGCTATGTTAAAAGAAAATTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTtattat < 1:623525/150‑1 (MQ=255) ttGATACAGAGGCTATGTTAAAAGAAAATTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTtattat < 1:623529/150‑1 (MQ=255) gATACAGAGGCTATGTTAAAAGAAAATTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATaa > 1:1598041/1‑150 (MQ=255) aTACAGAGGCTATGTTAAAAGAAAATTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATaaa > 1:133841/1‑150 (MQ=255) aCAGAGGCTATGTTAAAAGAAAATTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAata > 1:715004/1‑150 (MQ=255) cAGAGGCTATGTTAAAAGAAAATTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAatat < 1:710422/150‑1 (MQ=255) agagGCTATGTTAAAGGAAAATTATAAATTCTATCCGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGGAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTGTTGTTATTAGAAATATg < 1:4112/150‑1 (MQ=255) ggCTATGTTAAAAGAAAATTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGata > 1:3515932/1‑150 (MQ=255) cTATGTTAAAAGAAAATTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTACTCCTTTTTTTATTATAAATATGAtata > 1:2983795/1‑150 (MQ=255) tATGTTAAAAGAAAATTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATaa > 1:3359933/1‑150 (MQ=255) tGTTAAAAGAAAATTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTNAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAAtt < 1:2697849/150‑1 (MQ=255) gTTAAAAGAAAATTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAGAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTa > 1:1154475/1‑150 (MQ=255) gTTAAAAGAAAATTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTa > 1:2000712/1‑150 (MQ=255) gAAAATTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAGAGCTTGGCTTACAGATCCTGTTCCACGTAAATTTATTAAGCTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATTCTTGTTTTATTATCAATATGATATCATCAgtatgtg > 1:1790721/1‑149 (MQ=255) aaaTTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATACAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATCATAAATATGATGTAATTAgtatgtagt > 1:2169373/1‑148 (MQ=255) aaaTTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGtatt < 1:728588/150‑1 (MQ=255) aaTTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGtatta < 1:227442/150‑1 (MQ=255) ttATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATtata > 1:1597172/1‑150 (MQ=255) ttATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATtata > 1:159820/1‑150 (MQ=255) aaaTTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATaaaaa < 1:1052338/150‑1 (MQ=255) aaaTTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATaaaaa < 1:530663/150‑1 (MQ=255) aaaTTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTCTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATaaaaa > 1:484432/1‑150 (MQ=255) aaTTCTATCTGTCAGAAGATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATCAGTATGTATTATAAAAAt > 1:3149586/1‑150 (MQ=255) aaTTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAAt < 1:3331302/150‑1 (MQ=255) aaTTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAAt < 1:522225/150‑1 (MQ=255) ttCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATta > 1:632750/1‑150 (MQ=255) tATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTatat < 1:1044498/150‑1 (MQ=255) tATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTatat < 1:230225/150‑1 (MQ=255) tGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGaa > 1:1390952/1‑150 (MQ=255) gTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGaaa > 1:1661229/1‑150 (MQ=255) gTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGaaa > 1:2869273/1‑150 (MQ=255) gTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATCAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGaaa > 1:2964391/1‑150 (MQ=255) tCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTTCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAg < 1:2653989/150‑1 (MQ=255) cAGAAAATAAATTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAgg < 1:2962863/150‑1 (MQ=255) cAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAgg > 1:1030057/1‑150 (MQ=255) cAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAgg < 1:2081494/150‑1 (MQ=255) aGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTAAAAGGa < 1:2365616/150‑1 (MQ=255) aTAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGt > 1:1330053/1‑150 (MQ=255) taaggTTTGGCGTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTg < 1:894367/146‑1 (MQ=255) tAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTg < 1:1374224/150‑1 (MQ=255) aaaGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGa < 1:659936/150‑1 (MQ=255) aaaGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTCTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGa < 1:3368922/150‑1 (MQ=255) aaGTTTGGTCTACAGATTTTGTTCCGAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGaa < 1:1988864/150‑1 (MQ=255) aGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGaaa < 1:2220278/150‑1 (MQ=255) aGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGaaa < 1:1014493/150‑1 (MQ=255) gTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAAt > 1:54680/1‑150 (MQ=255) ttGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTa < 1:2425265/150‑1 (MQ=255) ttGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTa < 1:506447/150‑1 (MQ=255) ttGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTa < 1:816735/150‑1 (MQ=255) ggCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAg < 1:1006640/150‑1 (MQ=255) gCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGc < 1:1358911/150‑1 (MQ=255) cTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCt < 1:717085/150‑1 (MQ=255) gATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATgat > 1:563601/1‑150 (MQ=255) aTTTTGTTCCAAGTAAATTTATTGAAGTTTGATTCAATGAAAGGGTTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAGTgata < 1:2018191/150‑1 (MQ=255) aTTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATgata < 1:76386/150‑1 (MQ=255) aTTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATgata < 1:381965/150‑1 (MQ=255) aTTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATgata < 1:2460390/150‑1 (MQ=255) tttGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATgataga < 1:2786832/150‑1 (MQ=255) tttGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATgataga < 1:1276302/150‑1 (MQ=255) ttGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATgatagat > 1:169902/1‑150 (MQ=255) gTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTCATTCAATGAAAGGATTAACGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATACATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGTTAATGATAGATaa > 1:3528343/1‑150 (MQ=255) ttCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGCATAGTGAAATCAAGCTAATGATAGATaaa > 1:2235197/1‑150 (MQ=255) tCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATaaaa > 1:1635734/1‑150 (MQ=255) cAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAAtt > 1:2639675/1‑150 (MQ=255) cAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAAtt > 1:1150985/1‑150 (MQ=255) aGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTAc < 1:1012847/150‑1 (MQ=255) tAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACta < 1:3196768/150‑1 (MQ=255) tAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACta < 1:3196767/150‑1 (MQ=255) aaTTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACtata > 1:1202113/1‑150 (MQ=255) tattaAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAgg < 1:1883560/150‑1 (MQ=255) attaAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAggg > 1:1001287/1‑150 (MQ=255) aTTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCaa > 1:674294/1‑150 (MQ=255) aTTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAAc < 1:369391/150‑1 (MQ=255) tttaaTGAAAGGATTAAAGTTGTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACa < 1:3049998/147‑1 (MQ=255) aaTGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATaa > 1:1873193/1‑150 (MQ=255) aaTGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATaa > 1:1762516/1‑150 (MQ=255) aaTGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATaa > 1:1445697/1‑150 (MQ=255) aaaaaGGATTAAAGTTTTTAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAAtt > 1:36793/3‑150 (MQ=255) gAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAGATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAAttt > 1:239202/1‑150 (MQ=255) gAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAGATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAAttt > 1:239204/1‑150 (MQ=255) aaGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAATTTaa < 1:1211720/150‑1 (MQ=255) aaGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAATTTaa < 1:1211719/150‑1 (MQ=255) ggATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAACGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAATTTaaaa > 1:3457899/1‑150 (MQ=255) ttAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAATTTAAAAAat < 1:987910/150‑1 (MQ=255) ttAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAATTTAAAAAat < 1:1739693/150‑1 (MQ=255) ttAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAATTTAAAAAat < 1:355967/150‑1 (MQ=255) ttAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAATTTAAAAAat < 1:2548342/150‑1 (MQ=255) gTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAATTTAAAAAATATAGa < 1:1309291/150‑1 (MQ=255) ttAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAATTTAAAAAATATAGatat < 1:1963776/150‑1 (MQ=255) tAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAATTTAAAAAATATAGATAtt > 1:636998/1‑150 (MQ=255) cTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAATTTAAACAATATAGATATTGAGCtt > 1:3448397/1‑150 (MQ=255) tttAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAATTTAAAAAATATAGATATTGAGCTTc < 1:2040478/150‑1 (MQ=255) ttAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAGAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAATTTAAAAAATATAGATATTGAGCTTcc < 1:1178402/150‑1 (MQ=255) ttAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAATTTAAAAAATATAGATATTGAGCTTcc < 1:1538586/150‑1 (MQ=255) aTCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAATTTAAAAAATATAGATATTGAGCTTCCTaa < 1:2885696/150‑1 (MQ=255) ttttttATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAATTTAAAAAATATAGATATTGAGCTTCCTAAAAATg < 1:361739/150‑1 (MQ=255) | TCTTGAAATTGATACAGAGGCTATGTTAAAAGAAAATTATAAATTCTATCTGTCAGAAAATAAAGTTTGGCTTACAGATTTTGTTCCAAGTAAATTTATTAAATTTTAATTCAATGAAAGGATTAAAGTTTTAAAAACTTTAATCCTTTTTTTATTATAAATATGATATAATTAGTATGTATTATAAAAATTATATTGAAAGGAATAGTGAAATTAAGCTAATGATAGATAAAATTACTATAAAGGGAGCAAGGCAACATAATTTAAAAAATATAGATATTGAGCTTCCTAAAAATG > CP028101/1753947‑1754243 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |