| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP028101 | 14211 = | NA (NA) | 4 (0.020) | 4/296 | 16.2 | 1.6% | coding (77/99 nt) | C7Y58_00075 | hypothetical protein |
| ? | CP028101 | 272963 = | 246 (1.060) | intergenic (+25/+25) | C7Y58_01450/C7Y58_01455 | DNA mismatch repair protein MutT/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
GAAAAGAAAGTATTGAAAGAGAAAAATTGATGAAGTTCAGAGTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATCTGCATATCTTTCTCCAGATGCAGTTTCAG > CP028101/272814‑273112 | aaaaGAAAGTATTGAAAGAGAAAAATTGATGAAGTTCAGAGTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCt > 1:381021/1‑150 (MQ=255) aaagaaagTATTGAAAGAGAAAAATTGATGAAGTTCAGAGTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCtt > 1:836441/1‑150 (MQ=255) aaagaaagTATTGAAAGAGAAAAATTGATGAAGTTCAGAGTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCtt < 1:3077136/150‑1 (MQ=255) gaaagTATTGAAAGAGAAAAATTGATGAAGTTCAGAGTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCtttt‑a > 1:298472/1‑150 (MQ=255) aaagTATTGAAAGAGAAAAATTGATGAAGTTCAGAGTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCtttt‑at > 1:2277285/1‑150 (MQ=255) aagTATTGAAAGAGAAAAATTGATGAAGTTCAGAGTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCttttgtt > 1:2013118/1‑147 (MQ=255) aagTATTGAAAGAGAAAAATTGATGAAGTTCAGAGTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCtttt‑att < 1:1471802/150‑1 (MQ=255) gAAAGAGAAAAATTGATGAAGTTCAGAGTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTg > 1:1692868/1‑150 (MQ=255) gAAAGAGAAAAATTGATGAAGTTCAGAGTAAAAAAAGAATTCACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTACTGCTTTT‑ATTTTAATTg > 1:3006099/1‑150 (MQ=255) agagAAAAATTGATGAAGTTCAGAGTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCtt < 1:423287/150‑1 (MQ=255) gagaAAAATTGATGAAGTTCAGAGTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCttt > 1:2639413/1‑150 (MQ=255) gaAAAATTGATGAAGTTCAGAGTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCttttt < 1:934581/150‑1 (MQ=255) gaAAAATTGATGAAGTTCAGAGTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCttttt < 1:2207433/150‑1 (MQ=255) aaaaTTGATGAAGTTCAGAGTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCttttcaa > 1:1320143/1‑147 (MQ=255) aaaTTGATGAAGTTCAGAGTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTaaa > 1:193607/1‑150 (MQ=255) aaTTGATGAAGTTCAGAGTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAACAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTaaaa > 1:2064514/1‑150 (MQ=255) aaTTGATGAAGTTCAGAGTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTaaaa > 1:1244493/1‑150 (MQ=255) aaTTGATGAAGTTCAGAGTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTaaaa > 1:1244488/1‑150 (MQ=255) 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cAGAGTAAAAAAAGAATTTACGGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAATACCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCa < 1:3403703/150‑1 (MQ=255) gagTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAAc > 1:821460/1‑150 (MQ=255) gagTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAAc < 1:3337947/150‑1 (MQ=255) gagTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAATGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAAc < 1:3337950/150‑1 (MQ=255) aaaaaaaGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGtt < 1:2718628/150‑1 (MQ=255) aaaaaaaGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGtt > 1:157782/1‑150 (MQ=255) aaaaaGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTAc > 1:2513339/1‑150 (MQ=255) aaaaaGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTAc > 1:58186/1‑150 (MQ=255) aaaaGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACt < 1:3042032/150‑1 (MQ=255) aaaaGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACt < 1:2958099/150‑1 (MQ=255) 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tAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTaa > 1:638020/1‑150 (MQ=255) aaTTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAg > 1:1214141/1‑150 (MQ=255) aTTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGa > 1:42666/1‑150 (MQ=255) aTTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGa > 1:2161960/1‑150 (MQ=255) aTTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGa > 1:1122850/1‑150 (MQ=255) 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tttAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATc > 1:2415785/1‑150 (MQ=255) tttAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATc < 1:145109/150‑1 (MQ=255) tttAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACCTCGTTTCCAGCTTCATc > 1:1986343/1‑150 (MQ=255) ttAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATCt < 1:3251829/150‑1 (MQ=255) tacaataaaaCGCAGGAAAACCCCCTGCTTTT‑ATTTTCATTGCTTTTTAAAACTATTTCTCTTCAACAGTTACTGATACTTTTTTCCGGTCTCCTAAAGTTCAGATTCCTTCTTCGCCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTTATCTg > 1:2891751/4‑150 (MQ=255) aaataaaaAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATCTGCa < 1:1450975/150‑1 (MQ=255) aaataaaaAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATCTGCa < 1:1209006/150‑1 (MQ=255) aaataaaaAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATCTGCa > 1:2851676/1‑150 (MQ=255) aaataaaaAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATCTGCa < 1:1424049/150‑1 (MQ=255) aaataaaaAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATCTGCa > 1:3444287/1‑150 (MQ=255) aaataaaaAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATCTGCa < 1:19662/150‑1 (MQ=255) aataaaaAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAGTTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTATTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATCTGCat > 1:2690729/1‑150 (MQ=255) aataaaaAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATCTGCat < 1:1756270/150‑1 (MQ=255) aataaaaAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATCTGCat < 1:1229818/150‑1 (MQ=255) ataaaaAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATCTGCata > 1:2622695/1‑150 (MQ=255) taaaaAGCAGGAAAAATTCCTGTTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATCTGCatat < 1:238488/150‑1 (MQ=255) aaGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAATTACTGGTACTTCTTCAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATCTGCATATCttt > 1:836947/1‑150 (MQ=255) aGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATCTGCATATCTTtc > 1:881401/1‑150 (MQ=255) ggAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATCTGCATATCTTTCTCCa > 1:1848314/1‑150 (MQ=255) tgcaacagccccTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAACAACTTCGTTTCCAGCTTCATCTGCATATCTTTCTCCAGa > 1:472616/12‑150 (MQ=255) cTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATCTGCATATCTTTCTCCAGATGCAGTTTCAg > 1:495800/1‑150 (MQ=255) cTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATCTGCATATCTTTCTCCAGATGCAGTTTCAg < 1:1364079/150‑1 (MQ=255) | GAAAAGAAAGTATTGAAAGAGAAAAATTGATGAAGTTCAGAGTAAAAAAAGAATTTACAGATTTAGCCTATTATCTAATTAAAAAAGCACATCCTTATGAAGTGCCTGTCATTAATATTTTTTAAAATAAAAAGCAGGAAAAATTCCTGCTTTT‑ATTTTAATTGCTTTTTAAAACTATTTAGCTTCAACAGTTACTGGTACTTCTTTAAGGTCTCCTAAAGTTAAGATTCCTTCTGCACCTTTCATAGCAACTTCGTTTCCAGCTTCATCTGCATATCTTTCTCCAGATGCAGTTTCAG > CP028101/272814‑273112 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |