| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP028101 | 593405 = | 325 (1.410) | 3 (0.010) | 3/282 | 16.5 | 0.97% | coding (2354/2829 nt) | C7Y58_02990 | DUF3427 domain‑containing protein |
| ? | CP028101 | 593422 = | 302 (1.380) | coding (2371/2829 nt) | C7Y58_02990 | DUF3427 domain‑containing protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 327 total aligned reads displayed.
ATCTACAACAAAGTCTTTTGACCCTGTACTGTACAAAAAAGATAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTGGAGAATATACAAAGCAAGAAGCATTTTGGTATCTAAATTTGAATTTTAACAATGGTTTTCAAGTAAGTGGCTATACCCCTTTTGAAAATGAAAGAAAACTTTTAATAT > CP028101/593256‑593554 | tCTACAACAAAGTCTTTTGACCCTGTACTGTACAAAAAAGATAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGaaaaa < 1:1170501/150‑1 (MQ=255) cTACAACAAAGTCTTTTGACCCTGTACTGTACAAAAAAGATAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGACGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGaaaaaa > 1:818871/1‑150 (MQ=255) acaacaAAGTCTTTTGACCCTGTACTGTACAAAAAAGATAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGaaaaaaaa < 1:346196/150‑2 (MQ=255) acaacaAAGTCTTTTGACCCTGTACTGTACAAAAAAGATAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAAt > 1:956539/1‑150 (MQ=255) acaacaAAGTCTTTTGACCCTGTACTGTACAAAAAAGATAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAAt < 1:1868780/150‑1 (MQ=255) caacaaAGTCTTTTGACCCTGTACTGTACAAAAAAGATAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAAtt > 1:2716015/1‑150 (MQ=255) caacaaAGTCTTTTGACCCTGTACTGTACAAAAAAGATAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAAtt > 1:1314646/1‑150 (MQ=255) aacacAGTCTTTTGACCCTGTACTGTACAAAAAAGATAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATta < 1:3305076/150‑1 (MQ=255) acaaAGTCTTTTGACCCTGTACTGTACAAAAAAGATAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATtat > 1:1593676/1‑150 (MQ=255) cTTTTGACCCTGTACTGTACAAAAAAGATAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAAtt > 1:1055884/1‑150 (MQ=255) tttGACCCTGTACTGTACAAAAAAGATAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAAtttt < 1:3121975/150‑1 (MQ=255) tttGACCCTGTACTGTACAAAAAAGATAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAAtttt > 1:2375231/1‑150 (MQ=255) gACCCTGTACTGTACAAAAAAGATAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTa > 1:1373742/1‑150 (MQ=255) 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tgtacAAAAAAGATAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAg < 1:1143873/150‑1 (MQ=255) gtacAAAAAAGATAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGt > 1:1732038/1‑150 (MQ=255) tacAAAAAAGATAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTa < 1:3037664/150‑1 (MQ=255) cAAAAAAGATAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTaaa < 1:2385209/150‑1 (MQ=255) aaaaaaGATAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTaaaa > 1:649607/1‑150 (MQ=255) 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aTAAAGAATATTATTTAGATGGAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTg < 1:583580/150‑1 (MQ=255) aTAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGCAAAACTCTTTg > 1:2225369/1‑150 (MQ=255) tAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTgg < 1:290959/150‑1 (MQ=255) aaaGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTGga > 1:1964128/1‑150 (MQ=255) aaaGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTGga < 1:3461879/150‑1 (MQ=255) aaGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTGgag < 1:184628/150‑1 (MQ=255) aaGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTGgag < 1:1716684/150‑1 (MQ=255) aGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTGgaga < 1:497/150‑1 (MQ=255) gaacattattTAGATGAAAATTTTAAAAAGTCTTATAAAAATAATTCGTAGTTTAAAATTGGAATAGATGAGTTAATAAAATATAATGTAGCGTTTGCAGAAAAAAATTGTAATGATTTTGTAAAGGAGTCAGTAAAACGTTTTGGAGaa < 1:2345578/146‑1 (MQ=255) gAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTGGAGaa < 1:626831/150‑1 (MQ=255) 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taATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTGGAGAATATACAAAGCAAGAAGCATTTTGGTATCTAAATTTGAATTTTAACAATGGTTTTCAAGTAAGTGGCTATACCCCTTTTGaaaa < 1:2293090/150‑1 (MQ=255) taATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTGGAGAATATACAAAGCAAGAAGCATTTTGGTATCTAAATTTGAATTTTAACAATGGTTTTCAAGTAAGTGGCTATACCCCTTTTGaaaa < 1:736161/150‑1 (MQ=255) taATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTGGAGAATATACAAAGCAAGAAGCATTTTGGTATCTAAATTTGAATTTTAACAATGGTTTTCAAGTAAGTGGCTATACCCCGTTTGaaaa < 1:1497697/150‑1 (MQ=255) aaTTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTGGAGAATATACAAAGCAAGAAGCATTTTGGTATCTAAATTTGAATTTTAACAATGGTTTTCAAGTAAGTGGCTATACCCCTTTTGAAAAt < 1:1815388/150‑1 (MQ=255) tttAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTGGAGAATATACAAAGCAAGAAGCATTTTGGTATCTAAATTTGAATTTTAACAATGGTTTTCAAGTAAGTGGCTATACCCCTTTTGAAAATga < 1:690301/150‑1 (MQ=255) tttAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTGGAGAATATACAAAGCAAGAAGCATTTTGGTATCTAAATTTGAATTTTAACAATGGTTTTCAAGTAAGTGGCTATACCCCTTTTGAAAATga > 1:199974/1‑150 (MQ=255) ttAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTGGAGAATATACAAAGCAAGAAGCATTTTGGTATCTAAATTTGAATTTTAACAATGGTTTTCAAGTAAGTGGCTATACCCCTTTTGAAAATgaa > 1:804206/1‑150 (MQ=255) aGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTGGAGAATATACAAAGCAAGAAGCATTTTGGTATCTAAATTTGAATTTTAACAATGGTTTTCAAGTAAGTGGCTATACCCCTTTTGAAAATgaaag < 1:2479280/150‑1 (MQ=255) aGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTGGAGAATATACAAAGCAAGAAGCATTTTGGTATCTAAATTTGAATTTTAACAATGGTTTTCAAGTAAGTGGCTATACCCCTTTTGAAAATgaaaa < 1:2454663/150‑2 (MQ=255) cTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTGGAGAATATACAAAGCAAGAAGCATTTTGGTATCTAAATTTGAATTTTAACAATGGTTTTCAAGTAAGTGGCTATACCCCTTTTGAAAATgaaagaa > 1:3351671/1‑150 (MQ=255) ttttGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTGGAGAATATACAAAGCAAGAAGCATTTTGGTATCTAAATTTGAATTTTAACAATGGTTTTCAAGTAAGTGGCTATACCCCTTTTGAAAATgaaagaaa > 1:772735/1‑150 (MQ=255) ttttGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTGGAGAATATACAAAGCAAGAAGCATTTTGGTATCTAAATTTGAATTTTAACAATGGTTTTCAAGTAAGTGGCTATACCCCTTTTGAAAATgaaagaaa > 1:1756622/1‑150 (MQ=255) | ATCTACAACAAAGTCTTTTGACCCTGTACTGTACAAAAAAGATAAAGAATATTATTTAGATGAAAATTTTAAAAATTCTTATAAAAATAATTCTTATTTTAAAATTTTAATAGATGATTTAATAAAATATAATTTAGCTTTTGCAGAAAAAAATTATAATAATTTTGTAAAAGAGTCAGTAAAACTTTTTGGAGAATATACAAAGCAAGAAGCATTTTGGTATCTAAATTTGAATTTTAACAATGGTTTTCAAGTAAGTGGCTATACCCCTTTTGAAAATGAAAGAAAACTTTTAATAT > CP028101/593256‑593554 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |