| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP028101 | 515137 = | 535 (1.130) | 16 (0.040) | 8/262 | 22.0 | 3.4% | intergenic (+50/‑81) | C7Y58_02630/C7Y58_02635 | autotransporter domain‑containing protein/N‑acetyltransferase |
| ? | CP028101 | 515178 = | 445 (1.070) | intergenic (+91/‑40) | C7Y58_02630/C7Y58_02635 | autotransporter domain‑containing protein/N‑acetyltransferase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 496 total aligned reads displayed.
GATATGATACTAAGGGAGAAAACCTAAGAGGAGGTCTAGGACTAAGAGTTATATTCTAATTATAAAAAAGACCCTTAATGTACTTTAATTTTATAGAGTATTATTTTCTAACAAAAAAGAAGGTTGTTTTTCAACCTTCTTTTTTGTTATAATTATAAAAAATAAATAAAAATTGGAAGGAGGAGACTTATGGAATTAGTTTATATAAAAGATCCCGATTTTGAAGTGATGATGAAAATTGTAGAGATAGAGCAAGAAACTTTTGAAGGAAATGGAAATGTTGACCTTTGGATAATAAA > CP028101/515029‑515327 | gATATGATACTAAGGGAGAAAACCTAAGAGGAGGTCTAGGACTAAGAGTTATATTCTAATTATAAAAAAGACCCTTAATGTACTTTAATTTTATAGAGTATTATTTTCTAACAAAAAAGAAGGTTGTTTTTCAACCTTCTTTTTTGttat > 1:628640/1‑150 (MQ=255) atGATACTAAGGGAGAAAACCTAAGAGGAGGTCTAGGACTAAGAGTTATATTCTAATTATAAAAAAGACCCTTAATGTACTTTAATTTTATAGAGTATTATTTTCTAACAAAAAAGAAGGTTGTTTTTCAACCTTCTTTTTTGttataat > 2:1911572/1‑150 (MQ=255) tACTAAGGGAGAAAAACTAAGAGGAGGTCTAGGACTAAGAGTTATATTCTAATTATAAAAAAGACCCTTAATGTACTTTAATTTTATAGAGTATTATTTTCTAACAAAAAAGAAGGTTGTTTTTCAACCTTCTTTTTTGttataattata > 1:2352100/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |