| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP028101 | = 534770 | 1 (0.000) | noncoding (26/1558 nt) | C7Y58_02725 | 16S ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 562 total aligned reads displayed.
AAAAAATAAAAAAATATTGTTGACAAAAACTAGGAATAATGTTAATATAATTGATGTCAATGTGACAAGGACATTAGCAACAGAATAGAGAAAAGACAAAAAAGCAACCATAAAATTTGGTGTTAAATAAGATAGCAAAGATGAGCTATTAAAAAGATTGAACGAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGGATGAACGCTGACAGAATGCTTAACACATGCAAGTCTACTTGAATTTGGGTTTTTTAACTTCGATTTGGGTGGCGGACGGGTGAGTAACGCGTAAAGAACTTGCCTC > CP028101/534622‑534913 | agaaaaaaatattGTTGACAAAAACTAGGAGTAATGTTAATATAATTGATGTCAATGTGACAAGGACATGAGCAACAGAAGAGAGAAAAGACAAAAAAGCAACCATAAAATTTGGTGTTAAATAAGATAGCAAAGATGAGCTATaaaaaa > 2:2604867‑M2/3‑144 (MQ=255) aaaaaataTTGTTGGCAAAAACTAGGAATAATGTTAATATAATTGATGTCAATGTGACAAGGACATTAGCAACAGAATAGAGAAAAGACAAAAAAGCAACCATAAAATTTGGTGTTAAATAAGATAGCAAAGATGAGCTATaaaaaaaag > 1:2401510‑M2/1‑141 (MQ=255) aaaaaataTTGTTGACAAAAACTAGGAATAATGTTAATATAATTGATGTCAATGTGACAAGGACATTAGCAACAGAATAGAGAAAAGACAAAAAAGCAACCATAAAATTTGGTGTTAAATAAGATAGCAAAGATGAGCTATaaaaaaaag > 2:318410‑M2/1‑141 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |