| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | CP028101 | = 336796 | NA (NA) | 558 (1.210) +TTTT |
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| ? | CP028101 | = 534770 | 1 (0.000) | noncoding (26/1558 nt) | C7Y58_02725 | 16S ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 570 total aligned reads displayed.
TAGCTGTGAGGCAAGTTCTTTACGCGTTACTCACCCGTCCGCCACCCAAATCGAAGTTAAAAAACCCAAATTCAAGTAGACTTGCATGTGTTAAGCATTCTGTCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTTCGTTCAATCTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP028101/336648‑336796‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTCAACAATATTTTTTTATTTTTT < CP028101/534770‑534622 |||| GCTGTGAGGCAAGTTCTTTACGCGTTACTCACCCGTCCGCCACCCAAATCGAAGTTAAAAAACCCAAATTCAATTAGACTTGCATGTGTTAAGCATTCTGTCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTTCGTTCAATCTTTTTTTT < 2:3093411/150‑1 GCTGTGAGGCAAGTTCTTTACGCGTTACTCACCCGTCCGCCACCCAAATCGAAGTTAAAAAACCCAAATTCAAGTAGACTTGCATGTGTTAAGCATTCTGTCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTTCGTTCAATCTTTTTTTT > 2:498196/1‑150 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> 2:3480158/1‑150 TCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTTCGTTCAATCTTTTTTTT‑ATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTA > 2:2517842/1‑150 ATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTTCGTTCAATCTTTTTTTT‑ATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAAC > 2:2848712/1‑150 TGAGCCAGGATCAAACTCTTCGTTCAATCTTTTTTTT‑ATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTA > 1:768667/1‑150 GCCAGGATCAAACTCTTCGTTCAATCTTTTTTTT‑ATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCGCATTGACATCAATTATATTAACATTATTC > 1:960970/1‑150 CCAGGATCAAACTCTTCGTTCAATCTTTTTTTT‑ATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCC < 1:3021290/150‑1 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< 2:1325250/150‑1 ACTCTTCGTTCAATCTTTTTTTT‑ATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGT < 2:3020194/150‑1 CTCTTCGTTCAGTCTTTTTTTT‑ATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTC < 2:2488719/150‑1 CTCTTCGTTCAATCTTTTTTTT‑ATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTC < 1:2792896/150‑1 CTTCGTTCAATCTTTTTTTT‑ATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTCAA > 1:3109787/1‑150 TTCGTTCAATCTTTTTTTT‑ATAGCTCATCTGTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATTGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTATCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTCAAC < 2:2612960/150‑1 GTTCAATCTTTTTTTT‑ATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTCAACAAT > 2:1532074/1‑150 aatcTTTTTTTTATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTCACCAATATTT > 2:3260237/5‑150 atcTTTTTTTTATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTCAACAATATTTT > 1:258469/4‑150 TTTTTTATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTCAACAATATTTTTTTAT > 1:239033/1‑150 TTTTTATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTCAACAATATTTTTTTATT > 1:1669909/1‑150 |||| TAGCTGTGAGGCAAGTTCTTTACGCGTTACTCACCCGTCCGCCACCCAAATCGAAGTTAAAAAACCCAAATTCAAGTAGACTTGCATGTGTTAAGCATTCTGTCAGCGTTCATCCTGAGCCAGGATCAAACTCTTCGTTCAATCTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP028101/336648‑336796‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATAGCTCATCTTTGCTATCTTATTTAACACCAAATTTTATGGTTGCTTTTTTGTCTTTTCTCTATTCTGTTGCTAATGTCCTTGTCACATTGACATCAATTATATTAACATTATTCCTAGTTTTTGTCAACAATATTTTTTTATTTTTT < CP028101/534770‑534622 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |