| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP028101 | 311512 = | 539 (1.130) | 29 (0.080) | 22/242 | 14.8 | 6.3% | intergenic (+67/+69) | C7Y58_01615/C7Y58_01620 | tRNA‑Tyr/ATP‑binding protein |
| ? | CP028101 | 311573 = | 425 (1.100) | intergenic (+128/+8) | C7Y58_01615/C7Y58_01620 | tRNA‑Tyr/ATP‑binding protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 598 total aligned reads displayed.
TCGAATCCTTCCCCAACCACCATCTTTAAAACAATCGGGGCTGTTGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTT‑CTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGTATTCTTCTCTTTTATCATTATTCCATATAACTTTTTTAGATTTTTCCTTT > CP028101/311424‑311722 | tCGAATCCTTCCCCAACCACCATCTTTAAAACAATCGGGGCTGTTGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCt > 1:1666421/1‑150 (MQ=255) cTTCCCCAACCACCATCTTTAAAACAATCGGGGCTGTTGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTCTTATACAACCTttttatt > 1:859632/1‑150 (MQ=255) ccccAACCACCATCTTTAAAACAATCGGGGCTGTTGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTttttatttta > 2:139237/1‑150 (MQ=255) cccAACCACCATCTTTAAAACAATCGGGGCTGTTGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTac < 2:2347822/150‑1 (MQ=255) cccAACCACCATCTTTAAAACAATCGGGGCTGTTGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTac < 1:395318/150‑1 (MQ=255) caccaTCTTTAAAACAATCGGGGCTGTTGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATATCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAAt < 1:2356626/150‑1 (MQ=255) caccaTCTTTAAAACAATCGGGGCTGTTGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTTATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAAt > 2:2092255/1‑150 (MQ=255) caTCTTTAAAACAATCGGGGCTGTTGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCt > 1:1471427/1‑150 (MQ=255) ttAAAACAATCGGGGCTGTTGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAg > 1:1028309/1‑150 (MQ=255) ttAAAACAATCGGGGCTGTTGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAg < 2:1864522/150‑1 (MQ=255) aaaaCAATCGGGGCTGTTGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACGACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGta > 2:1803744/1‑150 (MQ=255) aaaaCAATCGGGGCTGTTGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGta > 1:1516773/1‑150 (MQ=255) aaaaCAATCGGGGCTGTTGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGta < 1:3116269/150‑1 (MQ=255) gaaCAATCGGGGCTGTTGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGtat > 1:2769973/2‑150 (MQ=255) cAATCGGGGCTGTTGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTataat < 1:215873/150‑1 (MQ=255) ggCTGTTGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCNTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTAttt > 1:1788065/1‑150 (MQ=255) tGTTGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTAtttttt < 2:1600930/150‑1 (MQ=255) tGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTT‑c < 1:1357489/150‑1 (MQ=255) tGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTT‑c < 1:3484606/150‑1 (MQ=255) gCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTT‑Ct < 1:3421116/150‑1 (MQ=255) aaaTTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTT‑CTTa > 2:1264971/1‑150 (MQ=255) aaTTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTT‑CTTAg > 1:995896/1‑150 (MQ=255) aaTTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTT‑CTTAg < 1:1886530/150‑1 (MQ=255) ttGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTT‑CTTAGCt > 2:1359289/1‑150 (MQ=255) ttGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTT‑CTTAGCt < 1:1748127/150‑1 (MQ=255) tgatgaTTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTT‑CTTAGCTa < 1:1001466/150‑1 (MQ=255) atgatTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTT‑CTTAGCTAAt > 2:3370781/1‑150 (MQ=255) tgatTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTT‑CTTAGCTAAtt > 1:2027951/1‑150 (MQ=255) aTCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTT‑CTTAGCTAATTCAATTaaa > 2:3260790/1‑150 (MQ=255) tGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACGAATTCTTGAAGTAGAATATTATTTTTTTT‑CTTAGCTAATTCAATTAAATCTTg < 2:1084243/150‑1 (MQ=255) tGATTTGGGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTT‑CTTAGCTAATTCAATTAAATCTTg < 2:812533/150‑1 (MQ=255) aTTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTCTACAACATTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTT‑CTTCGCTAATTCAATTAAATCTTGGc > 1:2573450/1‑150 (MQ=255) tttGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAGTGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTT‑CTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCt < 2:3087161/150‑1 (MQ=255) 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aCCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTT‑CTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGTATTCTTCTCTTTTATCATTATTCCATATAACTTTTTTAGATTTTTcc < 1:2852796/150‑1 (MQ=255) ccTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTT‑CTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGTATTCTTCTCTTTTATCATTATTCCATATAACTTTTTTAGATTTTTCCt > 1:1569778/1‑150 (MQ=255) | TCGAATCCTTCCCCAACCACCATCTTTAAAACAATCGGGGCTGTTGCAAATTGATGATTTTTATCATTGATTTGTGATAGCCTTTTTTGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAGAAAT‑TTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTT‑CTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGTATTCTTCTCTTTTATCATTATTCCATATAACTTTTTTAGATTTTTCCTTT > CP028101/311424‑311722 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |