| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP028101 | 311512 = | 539 (1.130) | 29 (0.080) | 22/242 | 14.8 | 6.3% | intergenic (+67/+69) | C7Y58_01615/C7Y58_01620 | tRNA‑Tyr/ATP‑binding protein |
| ? | CP028101 | 311573 = | 425 (1.100) | intergenic (+128/+8) | C7Y58_01615/C7Y58_01620 | tRNA‑Tyr/ATP‑binding protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TCTGGTTTTAGCCAAGATTTAATTGAATTAGCTAAGAAAAAAAATAATATTATACTTAAAGAATTAGTGTAAAATAAAAAGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP028101/311652‑311512‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttctatcaacaccatttattatacaaccTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGTATTCTTCTCTTTTATC > CP028101/311573‑311688 TCTGGTTTTAGCCAAGATTTAATTGAATTAGCTAAGAAAAAAAATAATATTATACTTAAAGAATTAGTGTAAAACAAAAAGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTCTTATACAACCTTTTTATTT > 1:991774/1‑150 GGTTTTAGCCAAGATTTAATTGAATTAGCTAAGAAAAAAAATAATATTATACTTAAAGAATTAGTGTAAAATAAAAAGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTAC < 1:2904509/150‑1 ATTTAATTGAATTAGCTAAGAAAAAAAATAATATTATACTTAAAGAATTAGTGTAAAATAAAAAGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAA > 1:933784/1‑150 ATTGAATTAGCTAAGAAAAAAAATAATATTATACTTAAAGAATTAGCGTAAAATAAAAAGGTTGTATAGTAAATGGTGTTGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACATTTTTATTTTAAAATAATCGTTTAAGTATA > 2:2003156/1‑150 CTAAGAAAAAAAATAATATTATACTTAAAGAATTAGTGTAAAATAAAAAGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTT > 2:1548513/1‑150 AAAAAATAATATTATACTTAAAGAATTAGTGTAAAATAAAAAGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTT > 1:1169842/1‑150 AAAAATAATATTATACTTAAAGAATTAGTGTAAAATAAAAAGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTA > 1:1427510/1‑150 AAGAATTAGTGTAAAATAAAAAGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTT > 2:1849306/1‑150 GTAAAATAAAAAGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTCTTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACC > 1:2278708/1‑150 AAAAGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTG > 2:90922/1‑150 GTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAAT > 2:1778315/1‑150 ATAATAAATGGTGTTGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATAT > 1:2568666/1‑150 AATAAATGGTGTTGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTCCCACTAATTCTTTAAGTCTCATATCATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGCAAATAATATAT > 2:2027203/1‑150 AAATGGTGTTGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGT > 1:767764/1‑150 AAATGGTGTTGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGT > 1:3120895/1‑150 TGGTGTTGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGTATT > 1:3397562/1‑150 TGTTGATGGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGTATTCTT > 1:1840938/1‑150 GTTGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGTATTCTTC > 2:1185069/1‑150 TTGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATGTATAGTATTCTTCT > 1:2422635/1‑150 TGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGTATTCTTCTC > 2:1765843/1‑150 TGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGTATTCTTCTC > 2:1765850/1‑150 TGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGTATTCTTCTC > 1:574329/1‑150 TGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGTATTCTTCTC > 1:574328/1‑150 GATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGTATTCTTCTCT > 1:3431655/1‑150 GATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGTATTCTTCTCT > 1:3431652/1‑150 GATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGTATTCTTCTCT > 1:3431658/1‑150 GAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGTATTCTTCTCTTTTA > 1:955403/1‑150 GAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGTATTCTTCTCTTTTA > 1:955401/1‑150 agaagCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACCTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGTATTCTTCTCTTTTATC < 2:2207223/145‑1 TCTGGTTTTAGCCAAGATTTAATTGAATTAGCTAAGAAAAAAAATAATATTATACTTAAAGAATTAGTGTAAAATAAAAAGGTTGTATAATAAATGGTGTTGATAGAAATTTCTTCTATCAACACCATTTATTATACAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP028101/311652‑311512‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttctatcaacaccatttattatacaaccTTTTTATTTTACACTAATTCTTTAAGTATAATATTATTTTTTTTCTTAGCTAATTCAATTAAATCTTGGCTAAAACCAGATTTTGAAAATAATATATAGTATTCTTCTCTTTTATC > CP028101/311573‑311688 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |